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Epigenomics in cancer Workshop/Mini advanced bioinformatics course

Processo: 14/07955-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Organização de Reunião Científica
Vigência: 24 de agosto de 2014 - 29 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Houtan Noushmehr
Beneficiário:Houtan Noushmehr
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Assunto(s):Epigenômica  Biologia computacional  Genômica  Neoplasias 

Resumo

Em parceria com a Sociedade Brasileira de Genética ( SBG - anexado) e FAPESP-USC (processo No: 2013/50385-6 - anexado), este workshop destina-se a introduzir o tema de Epigenômica em câncer e a treinar profissionais e estudantes com conhecimento em Biologia e que tenham forte interesse em analisar dados produzidos em alta escala, utilizando ferramentas de Bioinformática, tais como o software aberto, R/Bioconductor (bioconductor.fmrp.usp.br). R/Bioconductor é um poderoso repositório de pacotes com linguagem flexível, utilizado para analisar informações geradas em alta escala tais como expressão genética, epigenômica e genômica. Os principais objetivos do Workshop são 1- fornecer conhecimento básico sobre epigenética e sobre a análise de estudos de associações de genoma inteiro relacionados ao câncer e, 2- apresentar ferramentas avançadas de Bioinformática utilizadas no campo da pesquisa epigenômica para auxiliar na análise e interpretação de dados de sequenciamento de próxima geração em larga escala, tais como RNAseq , ChIPseq e BSseq.Contaremos com 10 cientistas de renome mundial por sua expertise em Epigenômica. Em seguida ao Workshop, o Prof. Dr. Houtan Noushmehr, convidado a presidir e coordenar uma mesa redonda, discutirá o tema Epigenômica e Câncer. Durante a sessão prática, serão discutidos, passo a passo, o recente trabalho sobre genômica/ epigenômica (Brennan et al., Cell 2013), no qual o Prof. Noushmehr é co-autor, e em que foram utilizados pacotes atualmente existentes no R/Bioconductor. O Workshop proporcionará aos alunos uma oportunidade de explorar os ins-and-outs do R/ Bioconductor de tal forma que possam aplicá-lo prontamente em suas próprias pesquisas. (AU)