Busca avançada
Ano de início
Entree

Avaliação de estratégias de genotipagem em situações de incerteza de paternidade e seu impacto sobre as avaliações genômicas em bovinos de corte

Processo: 13/25910-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2014
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2016
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Fernando Sebastián Baldi Rey
Beneficiário:Rafael Lara Tonussi
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal, SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:09/16118-5 - Ferramentas genômicas no melhoramento genético de características de importância econômica direta em bovinos da raça Nelore, AP.TEM
Assunto(s):Modelos estatísticos   Acasalamento   Reprodução animal

Resumo

O sistema de reprodutores múltiplos (RM) é o sistema de acasalamento mais utilizado no país para bovinos de corte, levando em conta os poucos estudos com animais da raça Nelore e a importância da seleção genômica, são necessários estudos que avaliem a inclusão nos modelos de animais com paternidade incerta e a criação da matriz de pedigree com dados genômicos em diferentes cenários de produção e verificar o impacto sobre as avaliações genéticas. Dessa forma, objetivou-se com este trabalho avaliar o impacto da aplicação de informações genômicas em situações de incerteza de paternidade e diferentes estratégias de genotipagem sobre as avaliações genéticas em bovinos de corte utilizando dados reais e simulados. Para o estudo de simulação, será criada uma matriz de relações de parentesco esperada (A), e a partir dela serão criados cenários onde haverá 50, 75 e 100% dos pais (touros) conhecidos. Em relação à criação da matriz G, serão testadas estratégias de genotipagem com diferentes proporções de animais filhos de RM nos cenários propostos. Portanto, serão simulados diversos cenários, sendo testados vários modelos com diferentes proporções de animais com paternidade conhecida na matriz A, para as duas características, de herdabilidade baixa e moderada, considerando duas situações (50 e 100%) de animais genotipados com paternidade conhecida. Os modelos utilizados serão: BLUP, modelo animal hierárquico, multiple e single-step. Para o estudo com dados reais serão avaliadas duas situações, onde na primeira serão incluídas informações genômicas para todos os animais e na segunda serão incluídos apenas os genótipos dos animais com paternidade conhecida na matriz G. No estudo de simulação será calculado a correlação entre TBV (valor genético verdadeiro) e EBV (valor genético estimado), para avaliar a acurácia de predição dos modelos. Para estimar viés das estimativas, o valor genético verdadeiro será regredido sobre a estimativa do respectivo valor genético para cada cenário. No estudo com dados reais, a habilidade de predição dos modelos propostos será testada por meio de validação cruzada. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TONUSSI, RAFAEL LARA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; ESPIGOLAN, RAFAEL; PERIPOLLI, ELISA; OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; BRAGA FEITOSAL, FABIELI LOISE; ANTUNES LEMOS, MARCOS VINICFUS; BERTON, MARIANA PIATTO; JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; LOBO, RAYSILDO BARBOSA; FRAMARTINO BEZERRA, LUIZ ANTONIO; MAGNABOSCO, CLAUDIO DE ULHOA; LOURENCO, DANIELA ANDRESSA LINO; AGUILAR, IGNACIO; BALDI, FERNANDO. Application of single step genomic BLUP under different uncertain paternity scenarios using simulated data. PLoS One, v. 12, n. 9 SEP 28 2017. Citações Web of Science: 0.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
RAFAEL LARA TONUSSI. Avaliação de estratégias de genotipagem em situações de incerteza de paternidade e seu impacto sobre as avaliações genômicas em bovinos de corte. 2016. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias..

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.
Mapa da distribuição dos acessos desta página
Para ver o sumário de acessos desta página, clique aqui.