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Aplicação de metagenômica para descoberta de novos vírus na Mata Atlântica paulista

Processo: 13/22136-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de julho de 2014
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Nicholas Di Paola
Instituição-sede : Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Auxílio(s) vinculado(s):17/24004-6 - Sequências completas do genoma de dois vírus da parainfluenza humana tipo 3 isolados coletados no Brasil, PUB.ART
Assunto(s):Epidemiologia   Metagenômica   Sequenciamento de alta performance   Zoonoses

Resumo

Abordagens metagenômicas têm possibilitado a descoberta de uma variedade de vírus previamente desconhecidos no meio ambiente e nas populações humanas. No Brasil, a fragmentação e a invasão de áreas florestas tropicais têm aumentado exponencialmente as chances da exposição humana a vírus exóticos e novas zoonoses. A Mata Atlântica presente no Atlântico-Sul margeia pequenas áreas de populações humanas que possuem acesso às metrópoles densamente populadas e portos marítimos. Dado o grande potencial de espalhamento viral, este projeto tem como objetivo coletar amostras de soro em áreas geográficas que apresentam este perfil de maior contato com regiões tropicais próximas a metrópoles. Objetivamos identificar novos vírus utilizando (I) uma abordagem de sequenciamento de alta performance (sequenciamento de segunda geração) e (II) análise in silico dos perfis do modelo de Markov. Ao final, esperamos caracterizar possíveis novas espécies virais e cultivá-las em linhagens celulares a fim de determinar a prevalência da infecção humana por meio sorologia. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Vacinas para vírus emergentes 
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