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Análise genômica de Pseudonocardia e diversidade de actinobactérias produtoras de antibióticos associadas com formigas cultivadoras de fungo

Processo: 16/17614-0
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2016
Vigência (Término): 30 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Mônica Tallarico Pupo
Beneficiário:
Supervisor no Exterior: Cameron Robert Currie
Instituição-sede : Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Wisconsin-Madison (UW), Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:15/01001-6 - Descobrindo a diversidade simbionte bacteriana associada com formigas agricultoras em diferentes biomas brasileiros, BP.PD
Assunto(s):Produtos naturais   Actinobactéria

Resumo

As formigas Attini cultivam fungos Basidiomicetos, com os quais mantêm uma associação simbiótica permanente e obrigatória. Para ajudar a prevenir infecções nos ninhos por parasitas, as formigas têm adotado vários mecanismos, incluindo uma associação com Actinobactérias simbióticas do gênero Pseudonocardia que produzem metabólitos secundários e que suprimem especificamente o parasita Escovopsis. Estudos sobre a associação entre Actinobactérias produtoras de antibióticos e formigas cultivadoras de fungo tem levado ao isolamento e à identificação de diversos compostos antimicrobianos. Recentes desenvolvimentos no sequenciamento do genoma e biologia molecular tem facilitado a descoberta de compostos antimicrobianos, permitindo colocar os produtos naturais em um contexto ecológico, em que conclusões mais gerais podem ser tiradas sobre as origens biossintéticas, a ecologia e evolução das associações simbióticas. Este projeto objetiva determinar, através de sequenciamento genômico o potencial metabólico secundário, bem como o contexto ecológico e evolutivo relacionado com a capacidade de Actinobactérias produtoras de antibióticos para produzir produtos naturais. Além disso, pretende-se explorar a diversidade de Actinobactérias produtoras de antibióticos associadas com formigas cultivadoras de fungo de três biomas - Mata Atlântica, Amazônia e Cerrado - através de análises filogenéticas. Nesta proposta pretendemos realizar a montagem e análises de dados utilizando softwares específicos que serão conduzidos no laboratório do Prof. Cameron Currie (Universidade de Wisconsin-Madison, EUA), o qual tem experiência em estudos sobre ecologia e evolução da associação entre formigas Attini e micro-organismos.Palavras-chave: Sequenciamento genômico, ecológico, evolutivo, produtos naturais, Actinobactérias. (AU)