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Resumo

O uso de plantas da flora brasileira como fonte de princípios ativos tem se mostrado cada vez mais eficaz na busca de medicamentos. Entretanto, pouco tem sido realizado para transformar este potencial em desenvolvimento de novos produtos e patentes. A presente proposta de pós-doutoramento, dará continuidade aos estudos do projeto temático "Fitoterápicos padronizados para o tratamento de doenças crônicas" da FAPESP, com a espécie Mimosa caesalpiniifolia no sentido de desenvolver um(s) fitoterápico(s). Ensaios realizados anteriormente demonstraram resultados promissores para o desenvolvimento de fitomedicamentos, com atividade antiiflamatória e antifúngica. Além das atividades de apoio e pesquisas realizadas internamente, uma parceria com a Universidade de Cádiz (UCA) da Espanha permitirá irá avaliar o potencial Alelopático dos extratos/compostos puros de Mimosa caesalpiniifolia no estudo da atividade Fitotóxica o grupo de pesquisa possui diferentes técnicas e domínio nos "Estudos em plantas alelopáticas e microorganismos superiores" que no Brasil esses estudos são escassos . A alelopatia é como uma ciência que estuda as interações entre plantas e organismos em seu ambiente mediado por agentes químicos é uma fonte valiosa como potencial medicinal. O grupo irá enriquecendo e complementando os estudos inicialmente propostos pelo projeto temático e pelo presente projeto de pós-doutorado. (AU)

Resumo

O gênero Eois Hübner (Geometridae: Larentiinae) compreende 250 espécies válidas, das quais 217 são descritas para a região Neotropical e 31 com localidade tipo no Brasil. O fato de ser um gênero especioso e que nunca foi revisado, bem como contar com potenciais espécies novas, faz com que Eois esteja inserido em um cenário taxonômico problemático. Além disso, as espécies Eois se destacam por estarem envolvidas em interações inseto-planta, sequestro de compostos secundários e possível co-evolução com plantas da família Piperaceae. O estabelecimento de Eois como um potencial grupo modelo em estudos de co-evolução e outras interações com piperáceas, especialmente com o gênero Piper, é limitado principalmente pelas incertezas taxonômicas envolvendo as mariposas. A verdadeira diversidade de Eois é subestimada tanto pelo fato da fauna brasileira ser pouco conhecida, como pelo fato da amostragem inadequada e por causa de possíveis espécies crípticas possivelmente "escondidas" em taxóns nominais. Este projeto de pesquisa propõe a testar a monofilia de Eois e investigar a diversidade do gênero no Brasil, através da utilização da taxonomia integrativa, utilizando ferramentas morfológicas e moleculares, e o estudo de material tipo depositado em coleções europeias. Também esperamos que as análises moleculares a partir do material obtido em viagens de campo realizadas no Brasil e de coleções entomológicas, esclareça a sistemática de Larentiinae de uma forma geral, e mais especificamente estando a monofilia das tribos Asthenini e Eupitheciini e do gênero Eois. (AU)

Resumo

Em nosso projeto no Brasil (FAPESP #2014/05772-4) nós investigamos os limites específicos e as relações filogenéticas entre os membros da série de Ischnocnema guentheri (Anura: Brachycephalidae), utilizando protocolos de taxonomia integrativa. No presente projeto nós propomos aprofundar nossos estudos em I. guentheri e I. henselii, que parecem se tratar de um complexo de pelo menos seis espécies morfologicamente crípticas com estruturação genética profunda. Para entendermos um problema taxonômico tão complexo, serão utilizados um protocolo de sequenciamento de nova geração denominado Filogenômica Ancorada e métodos inovadores de filogeografia, baseados em modelos, para ajudar a elucidar o cenário biogeográfico que levou à diversificação das linhagens. Esperamos desvendar a história das populações estudadas através da investigação de processos como fluxo gênico, introgressão e tempo de divergência, processos estes que se mostraram relevantes para a diversificação de outros taxa na Mata Atlântica brasileira. Também esperamos que essa aproximação nos leve a uma melhor delimitação das espécies do complexo I. guentheri-I. henselii, devido à melhoria nos caracteres quantitativos relacionados à estruturação genética das populações estudadas resultante do alto número de marcadores moleculares que serão utilizados no projeto. Este estágio será realizado no laboratório do Prof. Dr. Michael Hickerson, no City College of New York, Nova York, EUA, e seus resultados farão parte do terceiro capítulo da tese de doutorado do candidato. (AU)

Resumo

Espectroscopia vibracional é uma das mais importantes formas de se caracterizar a estrutura de moléculas. Um exemplo é o Dicroísmo Circular Vibracional (VCD), o dicroísmo circular no infravermelho devido a vibrações atômicas em moléculas quirais. Uma forma de reproduzir o espectro vibracional e prover frequências e modos vibracionais é através da Análise de Modos Normais (NMA), a qual requer a diagonalização da matriz Hessiana. Esta matriz é composta pela segunda derivada da superfície de energia potencial com relação à deslocamentos atômicos. Entretanto, tal metodologia pode ser problemática quando moléculas contendo um grande número de átomos, tal como proteínas, são analisadas. Isto se deve ao grande custo computacional envolvido na construção da Hessiana em tais sistemas. No presente projeto pretendemos abordar este tópico através do desenvolvimento de um código computacional que provém a possibilidade de partição do sistema em fragmentos menores através de uma interface gráfica. Os fragmentos podem então ser tratados separadamente, por exemplo, com a Hessiana respectiva a parte quiral ativa sendo obtida em um nível mais alto de teoria que a Hessiana construída a partir do deslocamento de átomos nos demais fragmentos. Esta técnica de sub-sistemas será então avaliada para um grupo de moléculas de interesse farmacêutico juntamente a outras formas de análise parcial da Hessiana (PHVA, MBH, etc.). A implementação do código desenvolvido como uma sub-rotina de um programa mais geral, tal como o pacote de programas ADF (Amsterdam Density Functional), proverá uma alternativa para a obtenção de espectro VCD para sistemas muito maiores do que aqueles que podem ser estudados atualmente. (AU)

Resumo

As formigas agricultoras (tribo Attini) compreendem mais de 230 espécies. Elas dependem do cultivo de fungos para a sua alimentação. Elas podem ser divididas atualmente em cinco diferentes sistemas agricultoras: agricultura inferior; agricultura de fungo coral; agricultura de levedura; agricultura maior generalizada; e formigas cortadeiras que evoluiu mais recentemente para se tornarem os herbívoros dominantes dos trópicos do Novo Mundo. As formigas cotadeiras envolve diferentes espécies de dois grandes gêneros; Atta e Acromyrmex, com a capacidade de cortar e processar vegetação fresca como um substrato nutritivo para a sua cultura fúngica. Vários compostos têm sido publicados de simbiontes de formigas agricultoras, com um amplo espectro de actividades biológicas. O melhor exemplo, na descoberta de produtos naturais bioativos a partir deste sistema simbiótico, é a descrição de um novo depsipéptido cíclico, dentigerumicina, produzida pela bacteria simbionte, Pseudonocardia, isolada do exoesqueleto da formiga Apterostigma dentigerum. Este composto tem uma inibição selectiva contra o fungo patogénico Escovopsis sp., E também tem uma actividade inibidora potente contra várias cepas de Cândida albicans. Neste projecto de doutorado em curso, descobrimos que as colônias das formigas cortadeiras Acromyrmex subterraneus brunneus e Acromyrmex rugosus rugosus têm bactérias simbiontes que produzem metabolitos secundários capazes de inibir o crescimento do fungo patogênico Escovopsis sp, e as parasitas Trypanosoma cruzi e Leishmania donovani. Vários compostos antibióticos e citotóxicos conhecidos, em conjunto com novos análogos têm sido identificados. Os principais objectivos do doutorado sanduíche no laboratório de Timothy S. Bugni da Escola de Farmácia da Universidade de Wisconsin será: estudos químicos de bactérias simbiontes envolvidas em ecossistemas de formigas agricultoras para a descoberta de novos compostos antimicrobianos, citotóxicos e antiparasitários, usando diferentes técnicas de cultura, modernos estudos em espectrometria de massa e de RMN e fracionamento bio-guiado. Este estágio está em concordância com o projeto de doutorado direto da FAPESP. (AU)

Resumo

As formigas Attini cultivam fungos Basidiomicetos, com os quais mantêm uma associação simbiótica permanente e obrigatória. Para ajudar a prevenir infecções nos ninhos por parasitas, as formigas têm adotado vários mecanismos, incluindo uma associação com Actinobactérias simbióticas do gênero Pseudonocardia que produzem metabólitos secundários e que suprimem especificamente o parasita Escovopsis. Estudos sobre a associação entre Actinobactérias produtoras de antibióticos e formigas cultivadoras de fungo tem levado ao isolamento e à identificação de diversos compostos antimicrobianos. Recentes desenvolvimentos no sequenciamento do genoma e biologia molecular tem facilitado a descoberta de compostos antimicrobianos, permitindo colocar os produtos naturais em um contexto ecológico, em que conclusões mais gerais podem ser tiradas sobre as origens biossintéticas, a ecologia e evolução das associações simbióticas. Este projeto objetiva determinar, através de sequenciamento genômico o potencial metabólico secundário, bem como o contexto ecológico e evolutivo relacionado com a capacidade de Actinobactérias produtoras de antibióticos para produzir produtos naturais. Além disso, pretende-se explorar a diversidade de Actinobactérias produtoras de antibióticos associadas com formigas cultivadoras de fungo de três biomas - Mata Atlântica, Amazônia e Cerrado - através de análises filogenéticas. Nesta proposta pretendemos realizar a montagem e análises de dados utilizando softwares específicos que serão conduzidos no laboratório do Prof. Cameron Currie (Universidade de Wisconsin-Madison, EUA), o qual tem experiência em estudos sobre ecologia e evolução da associação entre formigas Attini e micro-organismos.Palavras-chave: Sequenciamento genômico, ecológico, evolutivo, produtos naturais, Actinobactérias. (AU)

Resumo

A ordem Squamata é composta por répteis (Serpentes, "Lagartos", Anfisbaenas e Mosassauros) que apresentam uma grande diversidade de espécies e de formas. Dentre os Squamata, a subordem Amphisbaenia é composta por organismos que apresentam diversas modificações morfológicas adaptadas para hábitos fossoriais. Atualmente, Amphisbaenia possui 194 espécies descritas que são divididas em seis famílias (Amphisbaenidae, Blanidae, Bipedidae, Cadeidae, Rhineuridae e Trogonophidae) que possuem ampla distribuição, ocorrendo na região Neotropical, África subsaariana, partes da região do Mediterrâneo, Baixa Califórnia e Flórida. Apesar do progresso do conhecimento acerca do grupo, o posicionamento filogenético de Amphisbaenia dentro de Squamata, bem como as relações entre as famílias e gêneros ainda permanecem incertos. Muitos trabalhos atribuem as dificuldades para compreensão da origem e evolução das Amphisbaenia à convergência de diversos caracteres morfológicos, como as diferentes formas da cabeça presentes neste grupo. Sendo assim, este projeto visa investigar e contribuir para preencher algumas destas lacunas sobre o conhecimento do grupo. Este projeto tem como objetivo quantificar as diferenças e categorizar objetivamente as formas de cabeça dentro Amphisbaenia utilizando técnicas de morfometria geométrica. Para entender o processo evolutivo subjacente que moldou a forma da cabeça neste grupo, e para testar especificamente se essas formas apresentam correlação com a filogenia ou representar convergências morfológicas, vamos usar métodos filogenéticos comparativos. Além disso, também iremos avaliar os diferentes complexos morfofuncionais usando análise de componentes principais dos dados de métricos e geométricos. (AU)

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