Structural Studies with importin alpha and Nuclear Localization Sequence peptides

• Grant number: 09/14118-8
• Support Opportunities: Regular Research Grants
• Start date: December 01, 2009
• End date: January 31, 2012
• Field of knowledge: Biological Sciences - Biophysics - Molecular Biophysics
• Principal Investigator: Marcos Roberto de Mattos Fontes
• Grantee: Marcos Roberto de Mattos Fontes
• Host Institution: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brazil
• City of the host institution: Botucatu

Abstract

Proteínas que contém as clássicas seqüências de localização nuclear (NLSs) são importadas para o núcleo pelo heterodímero importina-alfa/beta. A importina-alfa contém o sítio de ligação do NLS, enquanto a importina-beta media o transporte através do poro da membrana nuclear. Para determinar as bases estruturais do reconhecimento de seqüências NLS pela importina-alfa de mamíferos, o laboratório de Biologia Molecular Estrutural do Departamento de Física e Biofísica do Instituto de Biociências - UNESP em colaboração com pesquisadores da Universidade de Queensland - Austrália desde 1999 vem se dedicando a esta linha de pesquisa. Nestes últimos dez anos já foram elucidadas cerca de uma dezena de estruturas por técnicas de cristalografia, e com auxílio de outras técnicas (surface plasmon ressonance (Biacore), equilíbrio de sedimentação, espalhamento dinâmico de luz, eletroforese e dicroísmo circular), informações biológicas fundamentais foram obtidas. A combinação destes dados experimentais gerou informações de grande importância para o entendimento do processo de importação de proteínas para o núcleo celular com possíveis implicações no desenho racional de drogas e no processo de drug delivery. Neste período foram publicados artigos em periódicos de grande índice de impacto. O planejamento de médio prazo para esta linha de pesquisa em nosso laboratório inclui a atuação de pós-doutores e pós-graduados e a colaboração de pesquisadores do país (Profa. Maria Célia Bertolini - UNESP/Araraquara, Profa. Maria Izabel Cano - UNESP/Botucatu entre outros) e do exterior (Prof. Bostjan Kobe - Universidade de Queensland - Austrália). O projeto proposto aqui trata especificamente de duas classes de peptídeos NLSs e sua interação com importina alfa de mamíferos: i) importina alfa e peptídeos NLSs de proteínas relacionadas ao reparo de DNA e ii) peptídeos NLSs desenvolvidos a partir de uma biblioteca de peptídeos específicos para importina alfa de mamíferos por nossos colaboradores da Austrália. (AU)

Scientific publications

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MORAES, IVAN R.; DE OLIVEIRA, HAMINE C.; FONTES, MARCOS R. M.. Structural basis of nuclear transport for NEIL DNA glycosylases mediated by importin-alpha. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1872, n. 2, p. 11-pg., 2023-12-11. (19/05958-4, 09/14118-8, 19/05239-8)

DE BARROS, ANDREA C.; TAKEDA, AGNES A. S.; DREYER, THIAGO R.; VELAZQUEZ-CAMPOY, ADRIAN; KOBE, BOSTJAN; FONTES, MARCOS R. M.. DNA mismatch repair proteins MLH1 and PMS2 can be imported to the nucleus by a classical nuclear import pathway. Biochimie, v. 146, p. 87-96, MAR 2018. (13/24705-3, 09/14118-8)