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Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research

Grant number: 13/50724-5
Support type:Research Grants - Research Partnership for Technological Innovation - PITE
Duration: March 01, 2015 - February 29, 2020
Field of knowledge:Interdisciplinary Subjects
Principal Investigator:Paulo Arruda
Grantee:Paulo Arruda
Home Institution: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil
Company: Structural Genomics Consortium
City: Campinas
Partner institutions: Structural Genomics Consortium
Co-Principal Investigators:Aníbal Eugênio Vercesi ; Licio Augusto Velloso ; Mario Jose Abdalla Saad ; Paulo Mazzafera ; Ronaldo Aloise Pilli
Associated grant(s):15/50024-9 - An integrative analysis of protein kinases in childhood acute lymphoblastic leukemia, AP.R SPRINT
Associated scholarship(s):19/18771-0 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
19/02059-9 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
19/02158-7 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
+ associated scholarships 19/00202-9 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/09342-5 - Protein kinase Chemical Biology center supporting drug development through open access research, BP.TT
18/11871-6 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/07844-3 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/02528-6 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/03063-7 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/03359-3 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
17/19605-0 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
17/08535-1 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT - associated scholarships

Abstract

Mais de 500 proteínas quinases estão presentes no genoma humano, atuando como chaves regulatórias de praticamente todos os processos fisiológicos do organismo humano. As quinases podem ser moduladas através de pequenas moléculas químicas altamente potentes. No entanto, apesar de sua importância e adequação para a descoberta de fármacos, a maioria das pesquisas acadêmicas e farmacêuticas tem se concentrado em apenas uma pequena fração de quinases. Ou seja, a maioria das quinases são “sub-exploradas”. Estas quinases sub-exploradas representam uma rica fonte de inovação em biologia e são o foco deste projeto de pesquisa. A UNICAMP, se propõe a entrar em parceria com o Structural Genomics Consortium (SGC) e conjuntamente trabalhar em uma lista de alvos contendo 26 quinases sub-exploradas envolvidas na regulação do splicing de RNA e da biologia da cromatina – alvos estes implicados em doenças neurológicas, angiogênese e câncer. A SGC-UNICAMP tem como objetivo a geração de pequenas moléculas inibidoras seletivas (“sondas químicas”), para pelo menos oito (8) quinases dessa lista. Para atingirmos esse objetivo, iremos estabelecer uma plataforma de “química medicinal guiada por estruturas” na UNICAMP, com financiamento e aconselhamento dos nossos oito parceiros da indústria farmacêutica e de um conselho consultivo externo composto por líderes globais em biologia química. A plataforma, em colaboração com uma rede de acadêmicos de Campinas e mundial, irá caracterizar as sondas (i) em ensaios bioquímicos, com o objetivo de determinar a potência e a seletividade, e (ii) em ensaios celulares para demonstrar “acoplamento no alvo” no interior das células. Uma vez que as sondas químicas atingirem rigorosos critérios de qualificação, iremos disponibilizá-los para cientistas brasileiros e internacionais, sem restrição de uso. A disponibilidade dessas sondas químicas irá possibilitar a descoberta de novas vias biológicas e identificação de novas oportunidades de intervenção terapêutica. Ao estabelecer esta plataforma química de acesso aberto, temos como objetivo tornar a UNICAMP em um dos centros mundiais em biologia química de quinases. (AU)

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Scientific publications (18)
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HERNEISEN, ALICE L.; SIDIK, SAIMA M.; MARKUS, BENEDIKT M.; DREWRY, DAVID H.; ZUERCHER, WILLIAM J.; LOURIDO, SEBASTIAN. Identifying the Target of an Antiparasitic Compound in Toxoplasma Using Thermal Proteome Profiling. ACS Chemical Biology, v. 15, n. 7, p. 1801-1807, JUL 17 2020. Web of Science Citations: 0.
KRAHN, ANDREA I.; WELLS, CARROW; DREWRY, DAVID H.; BEITEL, LENORE K.; DURCAN, THOMAS M.; AXTMAN, ALISON D. Defining the Neural Kinome: Strategies and Opportunities for Small Molecule Drug Discovery to Target Neurodegenerative Diseases. ACS Chemical Neuroscience, v. 11, n. 13, p. 1871-1886, JUL 1 2020. Web of Science Citations: 0.
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WELLS, CARROW I.; VASTA, JAMES D.; CORONA, CESEAR R.; WILKINSON, JENNIFER; ZIMPRICH, CHAD A.; INGOLD, MORGAN R.; PICKETT, JULIE E.; DREWRY, DAVID H.; PUGH, KATHRYN M.; SCHWINN, MARIE K.; HWANG, BYOUNGHOON (BRIAN); ZEGZOUTI, HICHAM; HUBER, KILIAN V. M.; CONG, MEI; MEISENHEIMER, PONCHO L.; WILLSON, TIMOTHY M.; ROBERS, MATTHEW B. Quantifying CDK inhibitor selectivity in live cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 11, n. 1 JUN 2 2020. Web of Science Citations: 0.
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WELLS, CARROW; COUNAGO, RAFAEL M.; LIMAS, JUANITA C.; ALMEIDA, TUANNY L.; COOK, JEANETTE GOWEN; DREWRY, DAVID H.; ELKINS, JONATHAN M.; GILEADI, OPHER; KAPADIA, NIRAV R.; LORENTE-MACIAS, ALVARO; PICKETT, JULIE E.; RIEMEN, ALEXANDER; RUELA-DE-SOUSA, ROBERTA R.; WILLSON, TIMOTHY M.; ZHANG, CUNYU; ZUERCHER, WILLIAM J.; ZUTSHI, REENA; AXTMAN, ALISON D. SGC-AAK1-1: A Chemical Probe Targeting AAK1 and BMP2K. ACS Medicinal Chemistry Letters, v. 11, n. 3, p. 340-345, MAR 12 2020. Web of Science Citations: 0.
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PROFETA, GERSON S.; DOS REIS, CAIO V.; SANTIAGO, ANDRE DA S.; GODOI, PAULO H. C.; FALA, ANGELA M.; WELLS, CARROW I.; SARTORI, ROGER; SALMAZO, ANITA P. T.; RAMOS, PRISCILA Z.; MASSIRER, KATLIN B.; ELKINS, JONATHAN M.; DREWRY, DAVID H.; GILEADI, OPHER; COUNAGO, RAFAEL M. Binding and structural analyses of potent inhibitors of the human Ca2+/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) identified from a collection of commercially-available kinase inhibitors. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, NOV 11 2019. Web of Science Citations: 0.
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