Advanced search
Start date
Betweenand

Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research

Grant number: 13/50724-5
Support type:Research Grants - Research Partnership for Technological Innovation - PITE
Duration: March 01, 2015 - February 29, 2020
Field of knowledge:Interdisciplinary Subjects
Principal Investigator:Paulo Arruda
Grantee:Paulo Arruda
Home Institution: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil
Company: Structural Genomics Consortium
City: Campinas
Co-Principal Investigators:Aníbal Eugênio Vercesi ; Licio Augusto Velloso ; Mario Jose Abdalla Saad ; Paulo Mazzafera ; Ronaldo Aloise Pilli
Associated grant(s):15/50024-9 - An integrative analysis of protein kinases in childhood acute lymphoblastic leukemia, AP.R
Associated scholarship(s):19/02059-9 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
19/02158-7 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
19/00202-9 - Protein Kinase Chemical Biology Center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
+ associated scholarships 18/09342-5 - Protein kinase Chemical Biology center supporting drug development through open access research, BP.TT
18/11871-6 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/07844-3 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/02528-6 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/03063-7 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT
18/03359-3 - Protein kinase chemical biology center: supporting drug development through open-access research, BP.TT - associated scholarships

Abstract

Mais de 500 proteínas quinases estão presentes no genoma humano, atuando como chaves regulatórias de praticamente todos os processos fisiológicos do organismo humano. As quinases podem ser moduladas através de pequenas moléculas químicas altamente potentes. No entanto, apesar de sua importância e adequação para a descoberta de fármacos, a maioria das pesquisas acadêmicas e farmacêuticas tem se concentrado em apenas uma pequena fração de quinases. Ou seja, a maioria das quinases são “sub-exploradas”. Estas quinases sub-exploradas representam uma rica fonte de inovação em biologia e são o foco deste projeto de pesquisa. A UNICAMP, se propõe a entrar em parceria com o Structural Genomics Consortium (SGC) e conjuntamente trabalhar em uma lista de alvos contendo 26 quinases sub-exploradas envolvidas na regulação do splicing de RNA e da biologia da cromatina – alvos estes implicados em doenças neurológicas, angiogênese e câncer. A SGC-UNICAMP tem como objetivo a geração de pequenas moléculas inibidoras seletivas (“sondas químicas”), para pelo menos oito (8) quinases dessa lista. Para atingirmos esse objetivo, iremos estabelecer uma plataforma de “química medicinal guiada por estruturas” na UNICAMP, com financiamento e aconselhamento dos nossos oito parceiros da indústria farmacêutica e de um conselho consultivo externo composto por líderes globais em biologia química. A plataforma, em colaboração com uma rede de acadêmicos de Campinas e mundial, irá caracterizar as sondas (i) em ensaios bioquímicos, com o objetivo de determinar a potência e a seletividade, e (ii) em ensaios celulares para demonstrar “acoplamento no alvo” no interior das células. Uma vez que as sondas químicas atingirem rigorosos critérios de qualificação, iremos disponibilizá-los para cientistas brasileiros e internacionais, sem restrição de uso. A disponibilidade dessas sondas químicas irá possibilitar a descoberta de novas vias biológicas e identificação de novas oportunidades de intervenção terapêutica. Ao estabelecer esta plataforma química de acesso aberto, temos como objetivo tornar a UNICAMP em um dos centros mundiais em biologia química de quinases. (AU)

Articles published in Agência FAPESP about the research grant
Chemical probe can help regulate an essential signaling pathway in cells 
Research helps understand role of protein kinases involved in cancer 
University and pharmaceutical company create new drug discovery tools 
Researchers map entire population of microorganisms in sugarcane 
New initiative to accelerate preclinical drug assays  

Scientific publications (6)
(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)
AGAJANIAN, MEGAN J.; WALKER, MATTHEW P.; AXTMAN, ALISON D.; RUELA-DE-SOUSA, ROBERTA R.; SERAFIN, D. STEPHEN; RABINOWITZ, ALEX D.; GRAHAM, DAVID M.; RYAN, MEAGAN B.; TAMIR, TIGIST; NAKAMICHI, YUKO; GAMMONS, MELISSA V.; BENNETT, JAMES M.; COUNAGO, RAFAEL M.; DREWRY, DAVID H.; ELKINS, JONATHAN M.; GILEADI, CARINA; GILEADI, OPHER; GODOI, PAULO H.; KAPADIA, NIRAV; MUELLER, SUSANNE; SANTIAGO, ANDRE S.; SORRELL, FIONA J.; WELLS, CARROW I.; FEDOROV, OLEG; WILLSON, TIMOTHY M.; ZUERCHER, WILLIAM J.; MAJOR, MICHAEL B. WNT Activates the AAK1 Kinase to Promote Clathrin-Mediated Endocytosis of LRP6 and Establish a Negative Feedback Loop. CELL REPORTS, v. 26, n. 1, p. 79+, JAN 2 2019. Web of Science Citations: 1.
SANTIAGO, ANDRE DA SILVA; COUNAGO, RAFAEL M.; RAMOS, PRISCILA ZONZINI; GODOI, PAULO H. C.; MASSIRER, KATLIN B.; GILEADI, OPHER; ELKINS, JONATHAN M. Structural Analysis of Inhibitor Binding to CAMKK1 Identifies Features Necessary for Design of Specific Inhibitors. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, OCT 4 2018. Web of Science Citations: 0.
JAMIESON, SAM A.; RUAN, ZHENG; BURGESS, ABIGAIL E.; CURRY, JACK R.; MCMILAN, HAMISH D.; BREWSTER, JODI L.; DUNBIER, ANITA K.; AXTMAN, ALISON D.; KANNAN, NATARAJAN; MACE, PETER D. Substrate binding allosterically relieves autoinhibition of the pseudokinase TRIB1. Science Signaling, v. 11, n. 549 SEP 25 2018. Web of Science Citations: 4.
TOSARINI, THALITA RAVAZO; RAMOS, PRISCILA ZONZINI; PROFETA, GERSON SOUZA; BARONI, RENATA MORO; MASSIRER, KATLIN B.; COUNAGO, RAFAEL M.; MONDEGO, JORGE M. C. Cloning, expression and purification of kinase domains of cacao PR-1 receptor-like kinases. Protein Expression and Purification, v. 146, p. 78-84, JUN 2018. Web of Science Citations: 1.
COUNAGO, RAFAEL M.; ALLERSTON, CHARLES K.; SAVITSKY, PAVEL; AZEVEDO, HATYLAS; GODOI, PAULO H.; WELLS, CARROW I.; MASCARELLO, ALESSANDRA; DE SOUZA GAMA, FERNANDO H.; MASSIRER, KATLIN B.; ZUERCHER, WILLIAM J.; GUIMARAES, CRISTIANO R. W.; GILEADI, OPHER. Structural characterization of human Vaccinia-Related Kinases (VRK) bound to small-molecule inhibitors identifies different P-loop conformations. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, AUG 8 2017. Web of Science Citations: 2.
AQUINO, BRUNO; COUNAGO, RAFAEL M.; VERZA, NATALIA; FERREIRA, LUCAS M.; MASSIRER, KATLIN B.; GILEADI, OPHER; ARRUDA, PAULO. Structural Characterization of Maize SIRK1 Kinase Domain Reveals an Unusual Architecture of the Activation Segment. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, MAY 26 2017. Web of Science Citations: 2.

Please report errors in scientific publications list by writing to: cdi@fapesp.br.
Distribution map of accesses to this page
Click here to view the access summary to this page.