Identification of Yersinia spp. atypical strains by molecular methods

• Grant number: 07/01146-8
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Master
• Start date: October 01, 2007
• End date: April 30, 2009
• Field of knowledge: Biological Sciences - Microbiology - Biology and Physiology of Microorganisms
• Principal Investigator: Juliana Pfrimer Falcão
• Grantee: Roberto Antonio de Souza
• Host Institution: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil

Abstract

O gênero Yersinia compreende 11 espécies. Y. enterocolitica, Y. pseudotuberculosis e Y. pestis são patógenos de vários animais, incluindo os humanos. Y. aldovae, Y. bercovieri, Y. frederiksenii, Y. intermedia, Y. kristensenii, Y. mollaretti e Y. rhodei são encontradas no meio ambiente e alimentos e consideradas, usualmente, como bactérias oportunistas não-patogênicas. Y. ruckeri é um importante patógeno de peixes. A classificação de bactérias do gênero Yersinia nas diferentes espécies é feita usualmente através de uma série de testes bioquímicos clássicos. O Laboratório de Referência em Yersinia da Faculdade de Ciências Farmacêuticas da UNESP de Araraquara, posteriormente transferido para a Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto/USP, recebeu desde a sua fundação amostras suspeitas de Yersinia, provenientes de vários estados do Brasil e também de outros países, para confirmação e tipagem completa sendo que mais de 700 amostras foram confirmadas como Yersinia e posteriormente completamente tipadas. Entretanto, foram recebidas algumas amostras de Yersinia que não puderam ser classificadas pelos testes bioquímicos convencionais em nenhuma das espécies até o momento conhecidas e por esse motivo foram denominadas Yersinia atípicas. Esse projeto visa classificar essas amostras atípicas em espécies através de técnicas de biologia molecular como: ERIC-PCR, Eletroforese em Campo Pulsado (Pulsed-field), Ribotipagem e Multi-locus Sequencing Typing (MLST). Os resultados a serem obtidos poderão classificar essas amostras em alguma das espécies já conhecidas ou mesmo fornecer dados para que nova(s) espécies(s) de Yersinia sejam propostas, contribuindo assim para uma melhor caracterização desse gênero quanto a sua diversidade. (AU)

Scientific publications

(4)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

SOUZA, ROBERTO A.; FALCAO, DEISE P.; FALCAO, JULIANA P.. Emended description of Yersinia massiliensis. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 61, p. 4-pg., 2011-05-01. (07/01146-8)

SOUZA, ROBERTO A.; FALCAO, JULIANA P.; DEALMEIDA, AMP; LEAL, NC. Pathogenic Potential of the Yersinia massiliensis Species. ADVANCES IN YERSINIA RESEARCH, v. 954, p. 6-pg., 2012-01-01. (07/01146-8)

SOUZA, ROBERTO A.; FALCAO, DEISE P.; FALCAO, JULIANA P.. Emended description of Yersinia massiliensis. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 61, n. 5, p. 1094-1097, MAY 2011. (07/01146-8)

SOUZA, ROBERTO A.; PITONDO-SILVA, ANDRE; FALCAO, DEISE P.; FALCAO, JULIANA P.. Evaluation of four molecular typing Methodologies as tools for determining taxonomy relations and for identifying. species among Yersinia isolates. Journal of Microbiological Methods, v. 82, n. 2, p. 141-150, AUG 2010. (07/01146-8)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

SOUZA, Roberto Antonio de. Identification of atypical Yersinia strains by molecular methods. 2009. Master's Dissertation - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (PCARP/BC) Ribeirão Preto.