Transformation of sweet orange varieties for functional study and / or gene editing for resistance to citrus bacterial diseases

• Grant number: 20/04795-1
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: June 01, 2020
• End date: April 30, 2022
• Field of knowledge: Biological Sciences - Genetics - Plant Genetics
• Principal Investigator: Alessandra Alves de Souza
• Grantee: Isis Gabriela Barbosa Carvalho
• Host Institution: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Campinas , SP, Brazil
• Associated research grant: 13/10957-0 - Xylella fastidiosa-vector-host plant interaction and approaches for citrus variegated chlorosis and citrus canker control, AP.TEM

Abstract

Trabalhos anteriores de nosso grupo de pesquisa identificaram um gene em X. fastidiosa que codifica uma endonuclease capaz de clivar RNAs bacterianos. Demonstramos que plantas transgênicas transformadas com esse gene, o mqsR, foram mais resistentes ao cancro cítrico. Na abordagem proposta neste projeto, novas plantas foram transformadas (devido ao projeto TT3 anterior) com esse gene clonado sob o domínio do promotor AtSuc, específico de floema, visando resistência contra a bactéria causadora do Greening. Além da necessidade de continuação dos trabalhos já iniciados, uma nova abordagem recentemente adotada pelo nosso grupo, é o uso de CRISPR para edição de genes de suscetibilidade a Xanthomonas citri, causadora do cancro cítrico. Esse estudo faz parte do trabalho de doutorado do aluno Reinaldo Rodrigues de Souza Neto que recentemente voltou de um BEPE na Universidade da Florida (UF). O referido aluno voltou em fevereiro de 2020, onde trouxe um vetor desenvolvido na UF para transformação genética nas variedades comerciais do Brasil. Nesse sentido, esse projeto TT3 também visa treinamento da técnica CRISPR para continuar o trabalho do Reinaldo (Processo FAPESP 2017/13885-1) além de iniciar o treinamento na técnica de transformação e regeneração de protoplasto visando a utilização futura de CRISPR-DNA free em citrus. (AU)

Scientific publications

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DE LIMA, LUIZ FELIPE FRANCO; CARVALHO, ISIS GABRIELA BARBOSA; DE SOUZA-NETO, REINALDO RODRIGUES; DOS SANTOS, LARISSA DA SILVA; NASCIMENTO, CESAR AUGUSTO; TAKITA, MARCO AURELIO; TAVORA, FABIANO TOUZDJIAN PINHEIRO KOHLRAUSCH; MEHTA, ANGELA; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. Antisense Oligonucleotide as a New Technology Application for CsLOB1 Gene Silencing Aiming at Citrus Canker Resistance. PHYTOPATHOLOGY, v. 114, n. 8, p. 8-pg., 2024-08-14. (21/09689-8, 17/13885-1, 20/04795-1, 19/23217-1, 22/04112-7)

DE SOUZA-NETO, REINALDO RODRIGUES; CAVALCANTE, LIDIA NASCIMENTO; CARVALHO, ISIS GABRIELA BARBOSA; CURTOLO, MAIARA; BENEDETTI, CELSO EDUARDO; TAKITA, MARCO AURELIO; WANG, NIAN; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. CRISPR/Cas9-Mediated Disruption of CsLIEXP1 Reveals Expansin as a Key Susceptibility Factor for Citrus Canker Disease. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 38, n. 4, p. 10-pg., 2025-08-07. (23/05118-1, 17/13885-1, 13/10957-0, 14/50880-0, 20/04795-1, 18/21990-2)

DE SOUZA-NETO, REINALDO RODRIGUES; DA COSTA VASCONCELOS, FERNANDA NOGALES; TEPER, DORON; BARBOSA CARVALHO, ISIS GABRIELA; TAKITA, MARCO AURELIO; BENEDETTI, CELSO EDUARDO; WANG, NIAN; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. The Expansin Gene CsLIEXP1 Is a Direct Target of CsLOB1 in Citrus. PHYTOPATHOLOGY, v. 113, n. 7, p. 12-pg., 2023-07-01. (17/13885-1, 18/21990-2, 20/04795-1, 13/10957-0, 14/50880-0)