| Grant number: | 21/03325-4 |
| Support Opportunities: | Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training |
| Start date: | June 01, 2021 |
| End date: | October 31, 2022 |
| Field of knowledge: | Biological Sciences - Genetics - Animal Genetics |
| Principal Investigator: | Mariana Freitas Nery |
| Grantee: | Agnello César Rios Picorelli |
| Host Institution: | Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil |
| Associated research grant: | 15/18269-1 - Using comparative genomics to understand convergent evolution of mammals: tracking the molecular footprints of the marine and riverine environment colonisation, AP.JP |
Abstract Com o advento dos métodos de sequenciamento massivo e a recente acessibilidade a esses métodos, surgem novas oportunidades de pesquisas que permitirão significativo progresso no nosso conhecimento sobre as bases genômicas da diversidade fenotípica. A disponibilidade de novos genomas também permite que organismos não-modelo emerjam como grupos com alto potencial para responder perguntas sobre a natureza do processo evolutivo. Entre os organismos não-modelo, os mamíferos aquáticos chamam especial atenção pela radical transformação em quase todos seus sistemas ao longo de suas histórias evolutivas e pela notável convergência genotípica que se pode observar entre as linhagens que - de maneira independente - colonizaram o ambiente aquático. Nesse contexto, o projeto Jovem Pesquisador (2015/18269-1) tem como principal objetivo o estudo da evolução molecular das seguintes espécies: o golfinho marinho Sotalia guianensis, o golfinho fluvial amazônico Sotalia fluviatilis, o peixe-boi marinho Trichechus manatus e o peixe-boi fluvial amazônico Trichechus inunguis. Os genomas dessas quatro espécies foram sequenciados e estão sendo submetidos à duas principais estratégias de estudo: (I) análises dos genomas das espécies irmãs, com foco em perguntas relacionadas ao processo de especiação, e (II) comparação entre os genomas de espécies de linhagens independentes que ocupam o mesmo ambiente (marinho ou fluvial) com o fim deinvestigar a existência de convergência molecular por trás de fenótipos convergentes relacionados ao habitat em comum. O grande volume de dados produzidos pelo sequenciamento dos genomas mencionados acima, requer extenso trabalho bioinformático para sua organização, armazenamento, compartilhamento e análises. Este trabalho intenso e minucioso de bioinformática envolve métodos e conhecimentos de Tecnologia da Informação (TI), que muitas vezes fogem do escopo de formação dos biólogos. Este projeto se insere nesse contexto, e tem como objetivo o manejo e organização adequados dos dados genômicos e o desenvolvimento de um pipeline analítico que centralize as análises dos genomas, de modo a acelerar a produção do conhecimento. Além disso, o compartilhamento dos dados gerados com o sequenciamento dos genomas - que é parte importante na disseminação desse conhecimento - também faz parte desse projeto. | |
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