Testing and validation of interactive methods for plankton image lebeling

• Grant number: 23/10770-0
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: September 01, 2023
• End date: November 30, 2023
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Computer Science - Computing Methodologies and Techniques
• Agreement: Belmont Forum
• Principal Investigator: Nina Sumiko Tomita Hirata
• Grantee: João Henrique Alliprandini da Costa
• Host Institution: Instituto de Matemática e Estatística (IME). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brazil
• Associated research grant: 18/24167-5 - World Wide Web of Plankton Image Curation (www.pic), AP.R

Abstract

O bolsista irá desenvolver atividades relacionadas ao teste e validação de uma ferramenta interativa que está sendo desenvolvida no escopo do projeto ao qual essa bolsa está vinculada. Especificamente, a ferramenta permite a visualização de um lote de imagens capturadas por um equipamento in situ que são projetadas em um mapa bidimensional de pontos com o qual o usuário pode interagir. O usuário poderá realizar a seleção de um subconjunto de pontos, e visualizar as imagens originais correspondentes aos pontos selecionados. Rótulos podem ser atribuídos a essas imagens, bem como rótulos já atribuídos podem ser editados. Um detalhe importante nesse processo são os métodos que estão por trás da projeção calculada. Tais métodos fazem com que imagens similares sejam projetadas próximas umas às outras. Desta forma, quando se seleciona uma regiãona projeção, as imagens tendem a ser de uma mesma espécie de plâncton. Nesse contexto, o bolsista estará envolvido em tarefas que requerem conhecimento sobre plâncton em geral (em atividades tais como uniformizar a nomenclatura das classes de um dataset para outro, verificar se espécies de classes similares estão de fato se agrupando, definir quais classes são relevantes sob o ponto de vista biológico ou do ecossistema em estudo). Esse conhecimento será importante para avaliar e melhorar a qualidade das projeções e da ferramenta. Como resultados esperados, o bolsista contribuirá para gerar validações das imagens obtidas nas projeções e, a partir delas, produzirplanilhas contendo os dados de contagem dos organismos planctônicos separados por táxons. Estesdados serão aplicados em produtos científicos do projeto WWW.PIC. (AU)