Metagenomic Study of Environmental Contamination and Antimicrobial Resistance in Aquaculture Systems

• Grant number: 25/16254-9
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: September 01, 2025
• End date: October 31, 2025
• Field of knowledge: Agronomical Sciences - Food Science and Technology - Food Science
• Principal Investigator: Jonas Augusto Rizzato Paschoal
• Grantee: Lucas David Rodrigues dos Santos
• Host Institution: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil
• Associated research grant: 21/08152-0 - Challenge of the use of drugs in fish farming in the context of One Health: evaluation of efficacy, safety and risk analysis., AP.TEM

Abstract

A aquicultura é uma atividade de crescente relevância no Brasil, especialmente devido ao seu potencial de produção sustentável de proteína animal de alta qualidade. No entanto, a intensificação dos sistemas de produção aumenta a vulnerabilidade dos peixes a doenças infecciosas, o que leva ao uso frequente de antimicrobianos, inclusive de não autorizados no Brasil. Este projeto visa investigar duas questões principais: (1) o impacto do uso de antimicrobianos sobre a emergência e disseminação de genes de resistência aos antimicrobianos (ARGs), associados a elementos genéticos móveis (MGEs) em peixes cultivados em condições controladas; e (2) o impacto ambiental do uso de medicamentos veterinários, avaliando a contaminação da água, dos sedimentos e de organismos não-alvo em sistemas de aquicultura no Brasil. Além disso, o projeto tem como objetivo promover o aprendizado de técnicas avançadas de metagenômica com a equipe da pesquisadora Teresa Nogueira do INIAV - Instituto Nacional de Investigação Agrária e Veterinária, e líder do grupo de Genômica e Ecologia Evolutiva de Microrganismos no CE3C, da Universidade de Lisboa, Portugal. integrando esse conhecimento para implementação no Brasil. Com isso, o estudo fornecerá dados essenciais sobre as consequências do uso de antimicrobianos na resistência microbiana e no equilíbrio ecológico dos ambientes aquáticos, além de contribuir para a formação técnica do bolsista.