Adaptation of sampling and DNA extraction protocols implemented in DotDx for other agricultural crops

• Grant number: 25/22374-7
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: December 01, 2025
• End date: January 31, 2027
• Field of knowledge: Biological Sciences - Genetics - Plant Genetics
• Principal Investigator: Gabriella Dias Arena
• Grantee: Thainara Siqueira Messias
• CNAE: Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais
• Associated research grant: 24/10466-1 - DotDx: Molecular platform for point-of-care detection of phytopathogens, transgenes, and resistance genes in plants, AP.PIPE

Abstract

A tecnologia desenvolvida é adaptável para a detecção potencial de qualquer gene alvo encontrado em amostras foliares, bastando adaptar o protocolo de extração de DNA para a cultura de interesse e alterar os conjuntos de primers utilizados nas reações. Com base neste potencial tecnológico, a plataforma será a princípio adaptada para a detecção de outros alvos, entre eles o patógeno Ralstonia solanacearum em eucalipto, em função do interesse de empresas de papel e celulose na detecção da bactéria em viveiros de mudas. O trabalho desenvolvido pelo bolsista será o de validar a metodologia de coleta de material vegetal e extração de DNA em eucalipto. Sabe-se que a bactéria em questão é vascular, portanto, é possível que seja necessário adaptar o protocolo de coleta de material vegetal para nervuras ou coleto ao invés de outros tecidos foliares, o que pode implicar em adaptações no dispositivo amostrador e no dispositivo de coleta. Quando ao protocolo de extração de DNA, será avaliado o método de aquecimento em solução de lise já utilizado no dispositivo e extensivamente validado para folhas de algodão, sendo testadas as otimizações necessárias para que a detecção do patógeno seja bem-sucedida.