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Antonio Augusto Franco Garcia

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Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

graduation at Engenharia Agronômica from Universidade de São Paulo (1990), master's at Agronomy from Universidade de São Paulo (1993) and doctorate at Agronomy from Universidade de São Paulo (1998). Has experience in Agronomy, acting on the following subjects: melhoramento genético, marcadores moleculares, mapeamento de qtls, mapeamento genético and cana-de-açúcar. (Source: Lattes Curriculum)

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Keywords used by the researcher
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (26)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

Publications25
Citations225
Cit./Article9.0
Data from Web of Science

ALMEIDA BALSALOBRE, THIAGO WILLIAN; PEREIRA, GUILHERME DA SILVA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; GAZAFFI, RODRIGO; BARRETO, FERNANDA ZATTI; ANONI, CARINA OLIVEIRA; CARDOSO-SILVA, CLAUDIO BENICIO; COSTA, ESTELA ARAUJO; MANCINI, MELINA CRISTINA; HOFFMANN, HERMANN PAULO; et al. GBS-based single dosage markers for linkage and QTL mapping allow gene mining for yield-related traits in sugarcane. BMC Genomics, v. 18, . Web of Science Citations: 22. (08/57908-6, 12/11109-0, 12/25236-4, 08/52197-4)

ROSARIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F.. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 55, n. 1, p. 97-103, . Web of Science Citations: 0. (12/13272-6)

GAZAFFI, RODRIGO; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; PASTINA, MARIA MARTA; MOLLINARI, MARCELO; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.. A model for quantitative trait loci mapping, linkage phase, and segregation pattern estimation for a full-sib progeny. Tree Genetics & Genomes, v. 10, n. 4, p. 791-801, . Web of Science Citations: 12. (12/13272-6, 10/00083-5, 08/54402-4)

FEIJO ROSA, JOAO RICARDO BACHEGA; MANTELLO, CAMILA CAMPOS; GARCIA, DOMINIQUE; DE SOUZA, LIVIA MOURA; DA SILVA, CARLA CRISTINA; GAZAFFI, RODRIGO; DA SILVA, CICERO CASIMIRO; TOLEDO-SILVA, GUILHERME; CUBRY, PHILIPPE; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; et al. QTL detection for growth and latex production in a full-sib rubber tree population cultivated under suboptimal climate conditions. BMC PLANT BIOLOGY, v. 18, . Web of Science Citations: 3. (13/20447-0, 12/50491-8)

PEREIRA, GUILHERME S.; GARCIA, ANTONIO AUGUSTO F.; MARGARIDO, GABRIEL R. A.. A fully automated pipeline for quantitative genotype calling from next generation sequencing data in autopolyploids. BMC Bioinformatics, v. 19, . Web of Science Citations: 4. (15/22993-7, 08/52197-4, 12/25236-4)

GERARD, DAVID; FERRAO, LUIS FELIPE VENTORIM; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; STEPHENS, MATTHEW. Genotyping Polyploids from Messy Sequencing Data. Genetics, v. 210, n. 3, p. 789-807, . Web of Science Citations: 12. (14/20389-2)

PASTINA, M. M.; MALOSETTI, M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; OLIVEIRA, K. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; VAN EEUWIJK, F. A.; GARCIA, A. A. F.. A mixed model QTL analysis for sugarcane multiple-harvest-location trial data. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 124, n. 5, p. 835-849, . Web of Science Citations: 38. (10/00083-5, 08/52197-4, 08/57908-6)

BARRETO, FERNANDA ZATTI; BACHEGA FEIJO ROSA, JOAO RICARDO; ALMEIDA BALSALOBRE, THIAGO WILLIAN; PASTINA, MARIA MARTA; SILVA, RENATO RODRIGUES; HOFFMANN, HERMANN PAULO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO. A genome-wide association study identified loci for yield component traits in sugarcane (Saccharum spp.). PLoS One, v. 14, n. 7, . Web of Science Citations: 1. (10/06702-9, 08/52197-4, 08/57908-6)

DAS GRACAS DIAS, KAIO OLIMPIO; GEZAN, SALVADOR ALEJANDRO; GUIMARAES, CLAUDIA TEIXEIRA; NAZARIAN, ALIREZA; DA COSTA E SILVA, LUCIANO; PARENTONI, SIDNEY NETTO; DE OLIVEIRA GUIMARAES, PAULO EVARISTO; ANONI, CARINA DE OLIVEIRA; VILLELA PADUA, JOSE MARIA; PINTO, MARCOS DE OLIVEIRA; et al. Improving accuracies of genomic predictions for drought tolerance in maize by joint modeling of additive and dominance effects in multi-environment trials. HEREDITY, v. 121, n. 1, p. 24-37, . Web of Science Citations: 5. (16/12977-7)

FERNANDES, SAMUEL B.; DIAS, KAIO O. G.; FERREIRA, DANIEL F.; BROWN, PATRICK J.. Efficiency of multi-trait, indirect, and trait-assisted genomic selection for improvement of biomass sorghum. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 131, n. 3, p. 747-755, . Web of Science Citations: 19. (16/12977-7)

PASTINA, M. M.; MALOSETTI, M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; OLIVEIRA, K. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; VAN EEUWIJK, F. A.; GARCIA, A. A. F.. A mixed model QTL analysis for sugarcane multiple-harvest-location trial data. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 124, n. 5, p. 835-849, . Web of Science Citations: 38. (08/57908-6, 08/52197-4, 10/00083-5)

ROSARIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F.. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 55, n. 1, p. 97-103, . Web of Science Citations: 0. (12/13272-6)

DAS GRACAS DIAS, KAIO OLIMPIO; GEZAN, SALVADOR ALEJANDRO; GUIMARAES, CLAUDIA TEIXEIRA; PARENTONI, SIDNEY NETTO; DE OLIVEIRA GUIMARAES, PAULO EVARISTO; CARNEIRO, NEWTON PORTILHO; PORTUGAL, ARLEY FIGUEIREDO; BASTOS, EDSON ALVES; CARDOSO, MILTON JOSE; ANONI, CARINA DE OLIVEIRA; et al. Estimating Genotype X Environment Interaction for and Genetic Correlations among Drought Tolerance Traits in Maize via Factor Analytic Multiplicative Mixed Models. CROP SCIENCE, v. 58, n. 1, p. 72-83, . Web of Science Citations: 4. (16/12977-7)

BARRETO, FERNANDA ZATTI; BACHEGA FEIJO ROSA, JOAO RICARDO; ALMEIDA BALSALOBRE, THIAGO WILLIAN; PASTINA, MARIA MARTA; SILVA, RENATO RODRIGUES; HOFFMANN, HERMANN PAULO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO. A genome-wide association study identified loci for yield component traits in sugarcane (Saccharum spp.). PLoS One, v. 14, n. 7, . Web of Science Citations: 1. (08/57908-6, 10/06702-9, 08/52197-4)

DOS SANTOS, JHONATHAN P. R.; FERNANDES, SAMUEL B.; MCCOY, SCOTT; LOZANO, ROBERTO; BROWN, PATRICK J.; LEAKEY, ANDREW D. B.; BUCKLER, EDWARD S.; GARCIA, ANTONIO A. F.; GORE, MICHAEL A.. Novel Bayesian Networks for Genomic Prediction of Developmental Traits in Biomass Sorghum. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 10, n. 2, p. 769-781, . Web of Science Citations: 4. (17/03625-2, 17/25674-5)

CHAVARRIA-PEREZ, LOURDES MARIA; GIORDANI, WILLIAN; GRACAS DIAS, KAIO OLIMPIO; COSTA, ZIRLANE PORTUGAL; MASSENA RIBEIRO, CAROLINA ALBUQUERQUE; BENEDETTI, ANDERSON ROBERTO; CAUZ-SANTOS, LUIZ AUGUSTO; PEREIRA, GUILHERME SILVA; BACHEGA FEIJO ROSA, JOAO RICARDO; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; et al. Improving yield and fruit quality traits in sweet passion fruit: Evidence for genotype by environment interaction and selection of promising genotypes. PLoS One, v. 15, n. 5, . Web of Science Citations: 0. (12/09100-5, 16/12977-7, 10/06702-9, 18/09069-7, 17/04216-9)

DIAS, K. O. G.; PIEPHO, H. P.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. O.; PARENTONI, S. N.; PINTO, M. O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, V, J.; GUIMARAES, C. T.; GARCIA, A. A. F.; et al. Novel strategies for genomic prediction of untested single-cross maize hybrids using unbalanced historical data. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 133, n. 2, . Web of Science Citations: 0. (18/00634-3, 16/12977-7)

KRAUSE, MATHEUS DALSENTE; DAS GRACAS DIAS, KAIO OLIMPIO; RIGAL DOS SANTOS, JHONATHAN PEDROSO; DE OLIVEIRA, AMANDA AVELAR; MOREIRA GUIMARAES, LAURO JOSE; PASTINA, MARIA MARTA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO. Boosting predictive ability of tropical maize hybrids via genotype-by-environment interaction under multivariate GBLUP models. CROP SCIENCE, v. 60, n. 6, p. 3049-3065, . Web of Science Citations: 1. (16/12977-7)

VENTORIM FERRAO, LUIS FELIPE; FERRAO, ROMARIO GAVA; GAVA FERRAO, MARIA AMELIA; FRANCISCO, AYMBIRE; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO. A mixed model to multiple harvest-location trials applied to genomic prediction in Coffea canephora. Tree Genetics & Genomes, v. 13, n. 5, . Web of Science Citations: 9. (14/20389-2)

BALSALOBRE, THIAGO W. A.; MANCINI, MELINA C.; PEREIRA, GUILHERME DA S.; ANONI, CARINA O.; BARRETO, FERNANDA Z.; HOFFMANN, HERMANN P.; DE SOUZA, ANETE P.; GARCIA, ANTONIO A. F.; CARNEIRO, MONALISA S.. Mixed Modeling of Yield Components and Brown Rust Resistance in Sugarcane Families. AGRONOMY JOURNAL, v. 108, n. 5, p. 1824-1837, . Web of Science Citations: 5. (08/52197-4, 12/25236-4)

VENTORIM FERRAO, LUIS FELIPE; FERRAO, ROMARIO GAVA; GAVA FERRAO, MARIA AMELIA; FRANCISCO, AYMBIRE; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO. A mixed model to multiple harvest-location trials applied to genomic prediction in Coffea canephora. Tree Genetics & Genomes, v. 13, n. 5, . Web of Science Citations: 9. (14/20389-2)

CHAVARRIA-PEREZ, LOURDES MARIA; GIORDANI, WILLIAN; GRACAS DIAS, KAIO OLIMPIO; COSTA, ZIRLANE PORTUGAL; MASSENA RIBEIRO, CAROLINA ALBUQUERQUE; BENEDETTI, ANDERSON ROBERTO; CAUZ-SANTOS, LUIZ AUGUSTO; PEREIRA, GUILHERME SILVA; BACHEGA FEIJO ROSA, JOAO RICARDO; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; et al. Improving yield and fruit quality traits in sweet passion fruit: Evidence for genotype by environment interaction and selection of promising genotypes. PLoS One, v. 15, n. 5, . Web of Science Citations: 0. (12/09100-5, 16/12977-7, 10/06702-9, 18/09069-7, 17/04216-9)

DOS SANTOS, JHONATHAN P. R.; FERNANDES, SAMUEL B.; MCCOY, SCOTT; LOZANO, ROBERTO; BROWN, PATRICK J.; LEAKEY, ANDREW D. B.; BUCKLER, EDWARD S.; GARCIA, ANTONIO A. F.; GORE, MICHAEL A.. Novel Bayesian Networks for Genomic Prediction of Developmental Traits in Biomass Sorghum. G3-GENES, GENOMES, GENETICS, v. 10, n. 2, p. 769-781, . Web of Science Citations: 0. (17/03625-2, 17/25674-5)

DIAS, K. O. G.; PIEPHO, H. P.; GUIMARAES, L. J. M.; GUIMARAES, P. E. O.; PARENTONI, S. N.; PINTO, M. O.; NODA, R. W.; MAGALHAES, V, J.; GUIMARAES, C. T.; GARCIA, A. A. F.; et al. Novel strategies for genomic prediction of untested single-cross maize hybrids using unbalanced historical data. THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, v. 133, n. 2, . Web of Science Citations: 0. (18/00634-3, 16/12977-7)

SOUZA, LIVIA MOURA; GAZAFFI, RODRIGO; MANTELLO, CAMILA CAMPOS; SILVA, CARLA CRISTINA; GARCIA, DOMINIQUE; LE GUEN, VINCENT; ALMEIDA CARDOSO, SAULO EMILIO; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO; SOUZA, ANETE PEREIRA. QTL Mapping of Growth-Related Traits in a Full-Sib Family of Rubber Tree (Hevea brasiliensis) Evaluated in a Sub-Tropical Climate. PLoS One, v. 8, n. 4, . Web of Science Citations: 26. (07/50562-4)

MOLLINARI, M.; MARGARIDO, G. R. A.; VENCOVSKY, R.; GARCIA, A. A. F.. Evaluation of algorithms used to order markers on genetic maps. HEREDITY, v. 103, n. 6, p. 494-502, . Web of Science Citations: 21. (08/54402-4)

SERANG, OLIVER; MOLLINARI, MARCELO; FRANCO GARCIA, ANTONIO AUGUSTO. Efficient Exact Maximum a Posteriori Computation for Bayesian SNP Genotyping in Polyploids. PLoS One, v. 7, n. 2, . Web of Science Citations: 41. (08/54402-4, 08/52197-4)

BALSALOBRE, THIAGO W. A.; MANCINI, MELINA C.; PEREIRA, GUILHERME DA S.; ANONI, CARINA O.; BARRETO, FERNANDA Z.; HOFFMANN, HERMANN P.; DE SOUZA, ANETE P.; GARCIA, ANTONIO A. F.; CARNEIRO, MONALISA S.. Mixed Modeling of Yield Components and Brown Rust Resistance in Sugarcane Families. AGRONOMY JOURNAL, v. 108, n. 5, p. 1824-1837, . Web of Science Citations: 5. (08/52197-4, 12/25236-4)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

MARGARIDO, Gabriel Rodrigues Alves. Mapeamento de QTLs em múltiplos caracteres e ambientes em cruzamento comercial de cana-de-açucar usando modelos mistos. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (07/02775-9

ANONI, Carina de Oliveira. Mapeamento de QTLs em progênie de irmãos-completos de cana-de-açúcar utilizando imputação múltipla. Dissertação (Mestrado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (10/06715-3

SANTOS, Jhonathan Pedroso Rigal dos. Novas redes Bayesianas para predição genômica de caracteres de desenvolvimento em sorgo biomassa. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (17/03625-2

LARA, Letícia Aparecida de Castro. Modelos genéticos-estatísticos para seleção genômica em Panicum maximum com informação de dosagem alélica. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (15/20659-2

PEREIRA, Guilherme da Silva. Mapeamento comparativo de QTLs entre sorgo sacarino e cana-de-açúcar para caracteres bioenergéticos. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (12/25236-4

ROSÁRIO, Millor Fernandes Do. Arquitetura genética de características quantitativas associadas ao desempenho e ao rendimento de carcaça na galinha doméstica. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (04/02080-2

ROSA, João Ricardo Bachega Feijó. Análise do desequilíbrio de ligação e da estrutura populacional do germoplasma brasileiro de cana-de-açúcar. Dissertação (Mestrado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (10/06702-9

MOLLINARI, Marcelo. Desenvolvimento de um modelo para construção de mapas genéticos em autopoliploides, com aplicações em cana-de-açúcar. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (08/54402-4

FERRÃO, Luís Felipe Ventorim. Desenvolvimento e aplicação de métodos genético-estatíticos para predição genômica em Coffea canephora. Tese (Doutorado) -  Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz.  Universidade de São Paulo (USP).  Piracicaba.  (14/20389-2

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