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Paulo Arruda

CV Lattes ResearcherID ORCID


Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

graduate at Ciencias Biologicas from Pontifícia Universidade Católica de Campinas (1976), master's at Genetics from Universidade Estadual de Campinas (1979) and ph.d. at Genética e Biologia Molecular from Universidade Estadual de Campinas (1982). Has experience in Genetics, focusing on Vegetal Genetics, acting on the following subjects: maize, storage protein, aminoacid metabolism, lisina-ketoglutaratoe reductase and lysine biosynthesis. (Source: Lattes Curriculum)

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Keywords used by the researcher
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (32)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

Publications27
Citations145
Cit./Article5.4
Data from Web of Science

BARRETO, PEDRO; OKURA, VAGNER; PENA, IZABELLA A.; MAIA, RENATO; MAIA, IVAN G.; ARRUDA, PAULO. Overexpression of mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) induces a hypoxic response in Nicotiana tabacum leaves. Journal of Experimental Botany, v. 67, n. 1, p. 301-313, . Web of Science Citations: 4. (14/17634-5, 12/00235-5, 14/24183-0)

KIYOTA, EDUARDO; PENA, IZABELLA AGOSTINHO; ARRUDA, PAULO. The saccharopine pathway in seed development and stress response of maize. PLANT CELL AND ENVIRONMENT, v. 38, n. 11, p. 2450-2461, . Web of Science Citations: 10. (10/50114-4, 12/00235-5)

COSTA‚ C.L.; ARRUDA‚ P.; BENEDETTI‚ C.E.. An Arabidopsis gene induced by wounding functionally homologous to flavoprotein oxidoreductases. Plant Molecular Biology, v. 44, n. 1, p. 61-71, .

MAIA‚ I.G.; BENEDETTI‚ C.E.; LEITE‚ A.; TURCINELLI‚ S.R.; VERCESI‚ A.E.; ARRUDA‚ P.. AtPUMP: an Arabidopsis gene encoding a plant uncoupling mitochondrial protein1. FEBS Letters, v. 429, n. 3, p. 403-406, . (94/03581-1)

NOGUEIRA‚ F.T.S.; SCHLÖGL‚ P.S.; CAMARGO‚ S.R.; FERNANDEZ‚ J.H.; DE ROSA‚ V.E.; POMPERMAYER‚ P.; ARRUDA‚ P.. SsNAC23‚ a member of the NAC domain protein family‚ is associated with cold‚ herbivory and water stress in sugarcane. Plant Science, v. 169, n. 1, p. 93-106, . (98/12250-0)

NOGUEIRA‚ F.T.S.; BORECKỲ‚ J.; VERCESI‚ A.E.; ARRUDA‚ P.. Genomic structure and regulation of mitochondrial uncoupling protein genes in mammals and plants. BIOSCIENCE REPORTS, v. 25, n. 3, p. 209-226, . (98/12250-0)

CAMARGO, ANTONIO PEDRO; CORREA DE SOUZA, RAFAEL SOARES; COSTA, PATRICIA DE BRITTO; GERHARDT, ISABEL RODRIGUES; DANTE, RICARDO AUGUSTO; TEODORO, GRAZIELLE SALES; ABRAHAO, ANNA; LAMBERS, HANS; CARAZZOLLE, MARCELO FALSARELLA; HUNTEMANN, MARCEL; et al. Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot. SCIENTIFIC DATA, v. 6, . Web of Science Citations: 0. (16/23218-0, 18/04240-0)

SANTIAGO, ANDRE DA SILVA; COUNAGO, RAFAEL M.; RAMOS, PRISCILA ZONZINI; GODOI, PAULO H. C.; MASSIRER, KATLIN B.; GILEADI, OPHER; ELKINS, JONATHAN M.. Structural Analysis of Inhibitor Binding to CAMKK1 Identifies Features Necessary for Design of Specific Inhibitors. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Web of Science Citations: 1. (13/50724-5)

JAMIESON, SAM A.; RUAN, ZHENG; BURGESS, ABIGAIL E.; CURRY, JACK R.; MCMILAN, HAMISH D.; BREWSTER, JODI L.; DUNBIER, ANITA K.; AXTMAN, ALISON D.; KANNAN, NATARAJAN; MACE, PETER D.. Substrate binding allosterically relieves autoinhibition of the pseudokinase TRIB1. Science Signaling, v. 11, n. 549, . Web of Science Citations: 9. (13/50724-5)

AQUINO, BRUNO; COUNAGO, RAFAEL M.; VERZA, NATALIA; FERREIRA, LUCAS M.; MASSIRER, KATLIN B.; GILEADI, OPHER; ARRUDA, PAULO. Structural Characterization of Maize SIRK1 Kinase Domain Reveals an Unusual Architecture of the Activation Segment. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Web of Science Citations: 3. (13/50724-5)

BARRETO, PEDRO; OKURA, VAGNER; PENA, IZABELLA A.; MAIA, RENATO; MAIA, IVAN G.; ARRUDA, PAULO. Overexpression of mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) induces a hypoxic response in Nicotiana tabacum leaves. Journal of Experimental Botany, v. 67, n. 1, p. 301-313, . Web of Science Citations: 4. (14/17634-5, 12/00235-5, 14/24183-0)

KIYOTA, EDUARDO; PENA, IZABELLA AGOSTINHO; ARRUDA, PAULO. The saccharopine pathway in seed development and stress response of maize. PLANT CELL AND ENVIRONMENT, v. 38, n. 11, p. 2450-2461, . Web of Science Citations: 10. (10/50114-4, 12/00235-5)

NESHICH, IZABELLA A. P.; KIYOTA, EDUARDO; ARRUDA, PAULO. Genome-wide analysis of lysine catabolism in bacteria reveals new connections with osmotic stress resistance. ISME Journal, v. 7, n. 12, p. 2400-2410, . Web of Science Citations: 20. (10/50114-4, 12/00235-5)

AQUINO, BRUNO; COUNAGO, RAFAEL M.; VERZA, NATALIA; FERREIRA, LUCAS M.; MASSIRER, KATLIN B.; GILEADI, OPHER; ARRUDA, PAULO. Structural Characterization of Maize SIRK1 Kinase Domain Reveals an Unusual Architecture of the Activation Segment. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Web of Science Citations: 3. (13/50724-5)

BARRETO, PEDRO; YASSITEPE, JULIANA E. C. T.; WILSON, ZOE A.; ARRUDA, PAULO. Mitochondrial Uncoupling Protein 1 Overexpression Increases Yield in Nicotiana tabacum under Drought Stress by Improving Source and Sink Metabolism. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Web of Science Citations: 4. (14/17634-5)

LEITE ARMANHI, JADERSON SILVEIRA; CORREA DE SOUZA, RAFAEL SOARES; DAMASCENO, NATALIA DE BRITO; DE ARAUJO, LAURA M.; IMPERIAL, JUAN; ARRUDA, PAULO. A Community-Based Culture Collection for Targeting Novel Plant Growth-Promoting Bacteria from the Sugarcane Microbiome. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Web of Science Citations: 9. (16/04322-0, 16/23425-5)

COUNAGO, RAFAEL M.; ALLERSTON, CHARLES K.; SAVITSKY, PAVEL; AZEVEDO, HATYLAS; GODOI, PAULO H.; WELLS, CARROW I.; MASCARELLO, ALESSANDRA; DE SOUZA GAMA, FERNANDO H.; MASSIRER, KATLIN B.; ZUERCHER, WILLIAM J.; et al. Structural characterization of human Vaccinia-Related Kinases (VRK) bound to small-molecule inhibitors identifies different P-loop conformations. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . Web of Science Citations: 4. (13/50724-5)

PROFETA, GERSON S.; DOS REIS, CAIO V.; SANTIAGO, ANDRE DA S.; GODOI, PAULO H. C.; FALA, ANGELA M.; WELLS, CARROW I.; SARTORI, ROGER; SALMAZO, ANITA P. T.; RAMOS, PRISCILA Z.; MASSIRER, KATLIN B.; et al. Binding and structural analyses of potent inhibitors of the human Ca2+/calmodulin dependent protein kinase kinase 2 (CAMKK2) identified from a collection of commercially-available kinase inhibitors. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, . Web of Science Citations: 0. (19/14275-8, 14/50897-0, 13/50724-5)

AGAJANIAN, MEGAN J.; WALKER, MATTHEW P.; AXTMAN, ALISON D.; RUELA-DE-SOUSA, ROBERTA R.; SERAFIN, D. STEPHEN; RABINOWITZ, ALEX D.; GRAHAM, DAVID M.; RYAN, MEAGAN B.; TAMIR, TIGIST; NAKAMICHI, YUKO; et al. WNT Activates the AAK1 Kinase to Promote Clathrin-Mediated Endocytosis of LRP6 and Establish a Negative Feedback Loop. CELL REPORTS, v. 26, n. 1, p. 79+, . Web of Science Citations: 2. (13/50724-5, 16/17469-0)

TOSARINI, THALITA RAVAZO; RAMOS, PRISCILA ZONZINI; PROFETA, GERSON SOUZA; BARONI, RENATA MORO; MASSIRER, KATLIN B.; COUNAGO, RAFAEL M.; MONDEGO, JORGE M. C.. Cloning, expression and purification of kinase domains of cacao PR-1 receptor-like kinases. Protein Expression and Purification, v. 146, p. 78-84, . Web of Science Citations: 1. (12/07657-2, 13/50724-5)

CORREA DE SOUZA, RAFAEL SOARES; LEITE ARMANHI, JADERSON SILVEIRA; DAMASCENO, NATALIA DE BRITO; IMPERIAL, JUAN; ARRUDA, PAULO. Genome Sequences of a Plant Beneficial Synthetic Bacterial Community Reveal Genetic Features for Successful Plant Colonization. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . Web of Science Citations: 0. (18/19100-9, 16/04322-0, 16/23218-0, 16/23425-5)

ALAM, MAHMOOD M.; SANCHEZ-AZQUETA, ANA; JANHA, OMAR; FLANNERY, ERIKA L.; MAHINDRA, AMIT; MAPESA, KOPANO; CHAR, ADITYA B.; SRIRANGANADANE, DEV; BRANCUCCI, NICOLAS M. B.; ANTONOVA-KOCH, YEVGENIYA; et al. Validation of the protein kinase PfCLK3 as a multistage cross-species malarial drug target. Science, v. 365, n. 6456, p. 884+, . Web of Science Citations: 2. (13/50724-5)

ALVES BARBOSA, EVERTON DE ALMEIDA; SERAPHIM, THIAGO VARGAS; GANDIN, CESAR AUGUSTO; TEIXEIRA, LEILANE FERREIRA; GONCALVES DA SILVA, RONNI ANDERSON; RIGHETTO, GERMANNA L.; GONCALVES, KALIANDRA DE ALMEIDA; VASCONCELLOS, RAPHAEL DE SOUZA; ALMEIDA, MARCIA ROGERIA; SILVA JUNIOR, ABELARDO; et al. Insights into the full-length SRPK2 structure and its hydrodynamic behavior. International Journal of Biological Macromolecules, v. 137, p. 205-214, . Web of Science Citations: 0. (14/07206-6, 13/50724-5, 11/23110-0, 12/00195-3, 17/03489-1, 12/50161-8, 17/07335-9)

SERAFIM, RICARDO A. M.; DE SOUZA GAMA, FERNANDO H.; DUTRA, LUIZ A.; DOS REIS, CAIO V.; VASCONCELOS, STANLEY N. S.; SANTIAGO, ANDRE DA SILVA; TAKARADA, JESSICA E.; DI PILLO, FULVIA; AZEVEDO, HATYLAS; MASCARELLO, ALESSANDRA; et al. Development of Pyridine-based Inhibitors for the Human Vaccinia-related Kinases 1 and 2. ACS Medicinal Chemistry Letters, v. 10, n. 9, p. 1266-1271, . Web of Science Citations: 0. (18/03359-3, 16/25320-6, 18/09475-5, 13/50724-5)

CAPELLA‚ A.N.; MENOSSI‚ M.; ARRUDA‚ P.; BENEDETTI‚ C.E.. COI1 affects myrosinase activity and controls the expression of two flower-specific myrosinase-binding protein homologues in Arabidopsis. PLANTA, v. 213, n. 5, p. 691-699, .

FALCAO, VIVIANE TANNURI F. L.; MASCHIO, DANIELA A.; DE FONTES, CAMILA CALVO; OLIVEIRA, RICARDO B.; SANTOS-SILVA, JUNIA C.; SOARES ALMEIDA, ANNA CAROLINA; VANZELA, EMERIELLE C.; CARTAXO, MARIA TEREZA; CARVALHO, CAROLINA P. F.; COLLARES-BUZATO, CARLA BEATRIZ. Reduced insulin secretion function is associated with pancreatic islet redistribution of cell adhesion molecules (CAMs) in diabetic mice after prolonged high-fat diet. Histochemistry and Cell Biology, v. 146, n. 1, p. 13-31, . Web of Science Citations: 11. (10/50789-1, 09/54129-9)

BARRETO, PEDRO; OKURA, VAGNER KATSUMI; PENA NESHICH, IZABELLA AGOSTINHO; MAIA, IVAN DE GODOY; ARRUDA, PAULO. Overexpression of UCP1 in tobacco induces mitochondrial biogenesis and amplifies a broad stress response. BMC PLANT BIOLOGY, v. 14, . Web of Science Citations: 21. (12/00126-1, 12/00235-5)

DIAS-LOPES, CAMILA; NESHICH, IZABELLA A. P.; NESHICH, GORAN; ORTEGA, JOSE MIGUEL; GRANIER, CLAUDE; CHAVEZ-OLORTEGUI, CARLOS; MOLINA, FRANCK; FELICORI, LIZA. Identification of New Sphingomyelinases D in Pathogenic Fungi and Other Pathogenic Organisms. PLoS One, v. 8, n. 11, . Web of Science Citations: 11. (12/00235-5, 09/16376-4)

ARRUDA, PAULO; NESHICH, IZABELLA PENA. Nutritional-rich and stress-tolerant crops by saccharopine pathway manipulation. FOOD AND ENERGY SECURITY, v. 1, n. 2, p. 141-147, . Web of Science Citations: 3. (10/50114-4, 12/00235-5)

PENA, IZABELLA A.; MARQUES, LYGIA A.; LARANJEIRA, ANGELO B. A.; YUNES, JOSE A.; EBERLIN, MARCOS N.; ARRUDA, PAULO. Simultaneous detection of lysine metabolites by a single LC-MS/MS method: monitoring lysine degradation in mouse plasma. SPRINGERPLUS, v. 5, . Web of Science Citations: 6. (10/50114-4, 13/23920-8, 12/00235-5)

CORREA DE SOUZA, RAFAEL SOARES; BALBUENA, TIAGO SANTANA; ARRUDA, PAULO. Structure, Organization, and Expression of the Alpha Prolamin Multigenic Family Bring New Insights into the Evolutionary Relationships among Grasses. PLANT GENOME, v. 8, n. 1, . Web of Science Citations: 1. (11/11650-0, 11/12431-0)

NESHICH, IZABELLA A. P.; KIYOTA, EDUARDO; ARRUDA, PAULO. Genome-wide analysis of lysine catabolism in bacteria reveals new connections with osmotic stress resistance. ISME Journal, v. 7, n. 12, p. 2400-2410, . Web of Science Citations: 20. (10/50114-4, 12/00235-5)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

PEREIRA, Tiago Campos. Estudo da atividade de supressão da proteína HC-Pro e análise do perfil de expressão de PTGS em cana-de-açúcar.  64 f. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  Campinas.  (00/02316-5

KEMPER, Edson Luis. Estudo da modulação funcional da enzima lisina-cetoglutarato redutase em milho. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (96/12067-5

UCHOA, Nathaly Nunes. Analise da expressão do gene lisina cetoglutarato redutase/sacaropina desidrogenase em milho submetido aos tratamentos com polietileno glicol, cloreto de sodio, metil-jasmonato e acido abscisico. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (00/05615-3

COSTA, Cínthia Losano. Isolamento e caracterização de uma flavoproteina oxido-redutase de Arabidopsis thaliana induzida por injuria mecanica e metil jasmonato. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (98/00881-5

BARRETO, Pedro Paulo Augusto Fabiano Arantes Pereira. Alterações no metabolismo energético provocadas pela superexpressão da proteína desacopladora mitocondrial 1 (UCP1) em tabaco induzem biogênese mitocondrial e resposta global a estresses = : Alterations on energy metabolism caused by mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) overexpression in tobacco induce mitochondrial biogenesis and global stress response. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (12/00126-1

CAPELLA, Adriana Natalicio. Identificação de genes regulados por acido jasmonico em Arabidopsis thaliana. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (96/12065-2

FIGUEIRA, Thais Rezende e Silva. A origem do milho : a identificação de Saccharum como um dos provaveis parentais alotetraploides. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (01/14108-0

PAPES, Fabio. Caracterização molecular e funcional da degradação de lisina pela via da sacaropina em eucariotos superiores. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (98/12050-0

LUCCA, Paulo Cezar de. Produção dos hormonios recombinantes de crescimento e pro-insulina humanos em plantas transgenicas de milho. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (99/07176-8

NOGUEIRA, Fabio Tebaldi Silveira. Identificação e caracterização de genes expressos em resposta ao estresse por baixa temperatura em cana-de-açucar. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (99/11723-4

KEMPER, Edson Luis. Estudo da modulação funcional da enzima lisina-cetoglutarato redutase em milho. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (96/12067-5

UCHOA, Nathaly Nunes. Analise da expressão do gene lisina cetoglutarato redutase/sacaropina desidrogenase em milho submetido aos tratamentos com polietileno glicol, cloreto de sodio, metil-jasmonato e acido abscisico. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (00/05615-3

BARRETO, Pedro Paulo Augusto Fabiano Arantes Pereira. Alterações no metabolismo energético provocadas pela superexpressão da proteína desacopladora mitocondrial 1 (UCP1) em tabaco induzem biogênese mitocondrial e resposta global a estresses = : Alterations on energy metabolism caused by mitochondrial uncoupling protein 1 (UCP1) overexpression in tobacco induce mitochondrial biogenesis and global stress response. Tese (Doutorado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (12/00126-1

COSTA, Cínthia Losano. Isolamento e caracterização de uma flavoproteina oxido-redutase de Arabidopsis thaliana induzida por injuria mecanica e metil jasmonato. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biologia.  Universidade Estadual de Campinas.  (98/00881-5

Patent applications

ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND METHODS FOR IDENTIFYING AND USING SUCH PEPTIDES EP20020012237 - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Adilson Leite; Urara Kawazoe; Paulo Arruda; Arnaldo da Silva Junior - June 2001, 01

MÉTODO PARA IDENTIFICAÇÃO DE UM PEPTÍDEO ARTIMICROBIANO, PEPTÍDEO ANTIMICROBIANO ISOLADO, ANÁLOGOS DOS PEPTÍDEOS, SEUS USOS, MOLÉCULA DE ÁCIDO NUCLEICO ISOLADA, VETOR DE EXPRESSÃO, CÉLULA HOSPEDEIRA, MÉTODO PARA PREVENIR O CRESCIMENTO, INIBIR O CRESCIMENTO OU REDUZIR A VIABILIDADE DE UM MICROORGANISMO E MÉTODO DE TRATAMENTO DE UM ORGANISMO INFECTADO COM UM MICROORGANISMO PATOGÊNICO PI0202064-5 - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Adilson Leite; Urara Kawazoe; Paulo Arruda; Arnaldo da Silva Junior - May 2002, 29

ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND METHODS FOR IDENTIFYING AND USING SUCH PEPTIDES US09/870,498 - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Adilson Leite; Urara Kawazoe; Paulo Arruda; Arnaldo da Silva Junior - June 2001, 01

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