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César Martins

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Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Instituto de Biociências (IBB)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

Bachelor in Biological Sciences from Universidade Estadual de Londrina (1995) and master (1997) and doctor (2000) in Genetics and Evolution from São Carlos Federal University (Brazil). Has experience in Genetics, Molecular Biology and Genomics, focusing on Animal Genetics, acting on the following subjects: Genome and chromosome evolution. (Source: Lattes Curriculum)

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Keywords used by the researcher
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (35)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

Publications35
Citations312
Cit./Article8.9
Data from Web of Science

MAHADEVARAJU, SHARVANI; FEAR, JUSTIN M.; AKEJU, MIRIAM; GALLETTA, BRIAN J.; PINHEIRO, MARA M. L. S.; AVELINO, CAMILA C.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; CONLON, KATIE; DELL'ORSO, STAFANIA; DEMERE, ZELALEM; et al. Dynamic sex chromosome expression in Drosophila male germ cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1, . Web of Science Citations: 0. (15/20844-4, 17/14923-4, 17/26609-2, 15/16661-1, 13/08028-1, 19/15212-0)

FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARTINS, CESAR. Development of chromosomal markers based on next-generation sequencing: the B chromosome of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata as a model. BMC GENETICS, v. 17, . Web of Science Citations: 4. (11/03807-7, 13/04533-3)

OLIVEIRA, SARAH G.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; MOURA, RITA C.; MARTINS, CESAR. Chromosomal organization and evolutionary history of Mariner transposable elements in Scarabaeinae coleopterans. MOLECULAR CYTOGENETICS, v. 6, . Web of Science Citations: 5. (13/04533-3, 09/04351-7, 08/02830-2)

SCHNEIDER, CARLOS HENRIQUE; GROSS, MARIA CLAUDIA; TERENCIO, MARIA LEANDRA; DO CARMO, EDSON JUNIOR; MARTINS, CESAR; FELDBERG, ELIANA. Evolutionary dynamics of retrotransposable elements Rex1, Rex3 and Rex6 in neotropical cichlid genomes. BMC Evolutionary Biology, v. 13, . Web of Science Citations: 26. (09/05234-4)

VALENTE, GUILHERME; KOCHER, THOMAS; EICKBUSH, THOMAS; SIMOES, RAFAEL P.; MARTINS, CESAR. Integrated cytogenetics and genomics analysis of transposable elements in the Nile tilapia, Oreochromis niloticus. Molecular Genetics and Genomics, v. 291, n. 3, p. 1219-1225, . Web of Science Citations: 2. (11/03807-7, 13/04533-3)

GERALDO, MARCOS TADEU; VALENTE, GUILHERME TARGINO; NAKAJIMA, RAFAEL TAKAHIRO; MARTINS, CESAR. Dimerization and Transactivation Domains as Candidates for Functional Modulation and Diversity of Sox9. PLoS One, v. 11, n. 5, . Web of Science Citations: 0. (09/05234-4, 10/13143-6)

GIUSTI, JULIANA; PINHAL, DANILLO; MOXON, SIMON; CAMPOS, CAMILA LOVAGLIO; MUNSTERBERG, ANDREA; MARTINS, CESAR. MicroRNA-10 modulates Hox genes expression during Nile tilapia embryonic development. MECHANISMS OF DEVELOPMENT, v. 140, p. 12-18, . Web of Science Citations: 7. (11/06465-0)

GROSS, M. C.; SCHNEIDER, C. H.; VALENTE, G. T.; PORTO, J. I. R.; MARTINS, C.; FELDBERG, E.. Comparative Cytogenetic Analysis of the Genus Symphysodon (Discus Fishes, Cichlidae): Chromosomal Characteristics of Retrotransposons and Minor Ribosomal DNA. Cytogenetic and Genome Research, v. 127, n. 1, p. 43-53, . Web of Science Citations: 41.

GROSS, M. C.; SCHNEIDER, C. H.; VALENTE, G. T.; MARTINS, C.; FELDBERG, E.. Variability of 18S rDNA locus among Symphysodon fishes: chromosomal rearrangements. Journal of Fish Biology, v. 76, n. 5, p. 1117-1127, . Web of Science Citations: 59.

PINHAL, DANILLO; SHIVJI, MAHMOOD S.; NACHTIGALL, PEDRO G.; CHAPMAN, DEMIAN D.; MARTINS, CESAR. A Streamlined DNA Tool for Global Identification of Heavily Exploited Coastal Shark Species (Genus Rhizoprionodon). PLoS One, v. 7, n. 4, . Web of Science Citations: 10. (07/03067-8, 07/03065-5)

VALENTE, GUILHERME T.; CONTE, MATTHEW A.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; CARVALHO, ROBSON F.; VICARI, MARCELO R.; KOCHER, THOMAS D.; MARTINS, CESAR. Origin and Evolution of B Chromosomes in the Cichlid Fish Astatotilapia latifasciata Based on Integrated Genomic Analyses. Molecular Biology and Evolution, v. 31, n. 8, p. 2061-2072, . Web of Science Citations: 58. (11/03807-7)

BOVOLENTA, LUIZ AUGUSTO; PINHAL, DANILLO; ACENCIO, MARCIO LUIS; DE OLIVEIRA, ARTHUR CASULLI; MOXON, SIMON; MARTINS, CESAR; LEMKE, NEY. miRTil: An Extensive Repository for Nile Tilapia microRNA Next Generation Sequencing Data. CELLS, v. 9, n. 8, . Web of Science Citations: 0. (10/20684-3, 12/13450-1, 12/15589-7, 14/08420-1, 15/19176-7, 11/06465-0, 13/03644-6)

DULZ, THAIS APARECIDA; AZAMBUJA, MATHEUS; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA; NOLETO, RAFAEL BUENO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; NOGAROTO, VIVIANE; DINIZ, DEBORA; AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES DE MELLO; VICARI, MARCELO RICARDO. Karyotypic Diversification in TwoMegaleporinusSpecies (Characiformes, Anostomidae) Inferred fromIn SituLocalization of Repetitive DNA Sequences. ZEBRAFISH, v. 17, n. 5, p. 333-341, . Web of Science Citations: 0. (15/16661-1)

AHMAD, SYED F.; JEHANGIR, MARYAM; CARDOSO, ADAUTO L.; WOLF, IVAN R.; MARGARIDO, VLADIMIR P.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; O'NEILL, RACHEL; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. B chromosomes of multiple species have intense evolutionary dynamics and accumulated genes related to important biological processes. BMC Genomics, v. 21, n. 1, . Web of Science Citations: 0. (18/03877-4, 15/16661-1, 14/16477-3)

PINHAL, DANILLO; BOVOLENTA, LUIZ A.; MOXON, SIMON; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; ACENCIO, MARCIO L.; PATTON, JAMES G.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; LEMKE, NEY; MARTINS, CESAR. Genome-wide microRNA screening in Nile tilapia reveals pervasive isomiRs' transcription, sex-biased arm switching and increasing complexity of expression throughout development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Web of Science Citations: 4. (12/13450-1, 11/06465-0, 13/06864-7, 15/16661-1, 15/19176-7, 12/15589-7)

PINHAL, DANILLO; DOMINGUES, RODRIGO R.; BRUELS, CHRISTINE C.; FERRETTE, BRUNO L. S.; GADIG, OTTO B. F.; SHIVJI, MAHMOOD S.; MARTINS, CESAR. Restricted connectivity and population genetic fragility in a globally endangered Hammerhead Shark. Reviews in Fish Biology and Fisheries, v. 30, n. 3, . Web of Science Citations: 1. (17/02420-8, 07/03065-5, 07/03067-8)

MARTINS, CESAR; TRIFONOV, VLADIMIR; HOUBEN, ANDREAS. Addressing Long-Standing Questions with Advanced Approaches: The 4th B Chromosome Conference. Cytogenetic and Genome Research, v. 160, n. 3, p. 111-117, . Web of Science Citations: 0. (18/25753-5)

NACHTIGALL, PEDRO G.; DIAS, MARCOS C.; CARVALHO, ROBSON F.; MARTINS, CESAR; PINHAL, DANILLO. MicroRNA-499 Expression Distinctively Correlates to Target Genes sox6 and rod1 Profiles to Resolve the Skeletal Muscle Phenotype in Nile Tilapia. PLoS One, v. 10, n. 3, . Web of Science Citations: 11. (12/15589-7, 11/06465-0, 13/06864-7)

VALENTE, GUILHERME T.; ACENCIO, MARCIO L.; MARTINS, CESAR; LEMKE, NEY. The Development of a Universal In Silico Predictor of Protein-Protein Interactions. PLoS One, v. 8, n. 5, . Web of Science Citations: 16. (13/02018-4, 09/05234-4)

MAHADEVARAJU, SHARVANI; FEAR, JUSTIN M.; AKEJU, MIRIAM; GALLETTA, BRIAN J.; PINHEIRO, MARA M. L. S.; AVELINO, CAMILA C.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; CONLON, KATIE; DELL'ORSO, STAFANIA; DEMERE, ZELALEM; et al. Dynamic sex chromosome expression in Drosophila male germ cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1, . Web of Science Citations: 0. (15/20844-4, 17/14923-4, 17/26609-2, 15/16661-1, 13/08028-1, 19/15212-0)

DULZ, THAIS APARECIDA; AZAMBUJA, MATHEUS; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA; NOLETO, RAFAEL BUENO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; NOGAROTO, VIVIANE; DINIZ, DEBORA; AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES DE MELLO; VICARI, MARCELO RICARDO. Karyotypic Diversification in TwoMegaleporinusSpecies (Characiformes, Anostomidae) Inferred fromIn SituLocalization of Repetitive DNA Sequences. ZEBRAFISH, v. 17, n. 5, p. 333-341, . Web of Science Citations: 0. (15/16661-1)

AHMAD, SYED F.; JEHANGIR, MARYAM; CARDOSO, ADAUTO L.; WOLF, IVAN R.; MARGARIDO, VLADIMIR P.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; O'NEILL, RACHEL; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. B chromosomes of multiple species have intense evolutionary dynamics and accumulated genes related to important biological processes. BMC Genomics, v. 21, n. 1, . Web of Science Citations: 0. (18/03877-4, 15/16661-1, 14/16477-3)

JEHANGIR, MARYAM; AHMAD, SYED F.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. De novo genome assembly of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata reveals a higher level of genomic polymorphism and genes related to B chromosomes. CHROMOSOMA, v. 128, n. 2, p. 81-96, . Web of Science Citations: 1. (15/16661-1, 14/17683-6, 11/03807-7, 13/04533-3)

FERRETTI, ANA B. S. M.; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; MILANI, DIOGO; LORETO, VILMA; MARTI, DARDO A.; RAMOS, ERICA; MARTINS, CESAR; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.. How dynamic could be the 45S rDNA cistron? An intriguing variability in a grasshopper species revealed by integration of chromosomal and genomic data. CHROMOSOMA, v. 128, n. 2, p. 165-175, . Web of Science Citations: 0. (15/16661-1, 14/11763-8)

AHMAD, SYED FARHAN; MARTINS, CESAR. The Modern View of B Chromosomes Under the Impact of High Scale Omics Analyses. CELLS, v. 8, n. 2, . Web of Science Citations: 5. (14/16477-3, 15/16661-1)

SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; COAN, RAFAEL; RAMOS, ERICA; NOGAROTO, VIVIANE; ZIEMNICZAK, KALINE; VALENTE, GUILHERME TARGINO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; MARTINS, CESAR; VICARI, MARCELO RICARDO. DNA transposon invasion and microsatellite accumulation guide W chromosome differentiation in a Neotropical fish genome. CHROMOSOMA, v. 128, n. 4, p. 547-560, . Web of Science Citations: 0. (15/16661-1)

CARDOSO, ADAUTO LIMA; DE ALMEIDA FANTINATTI, BRUNO EVARISTO; VENTURELLI, NATALIA BORTHOLAZZI; CARMELLO, BIANCA DE OLIVEIRA; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; MARTINS, CESAR. Epigenetic DNA Modifications Are Correlated With B Chromosomes and Sex in the Cichlid Astatotilapia latifasciata. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . Web of Science Citations: 0. (15/16661-1, 13/04533-3, 12/21546-9)

MILANI, DIOGO; BARDELLA, VANESSA B.; FERRETTI, ANA B. S. M.; PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO M.; MELO, ADRIANA DE S.; MOURA, RITA C.; LORETO, VILMA; SONG, HOJUN; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.. Satellite DNAs Unveil Clues about the Ancestry and Composition of B Chromosomes in Three Grasshopper Species. GENES, v. 9, n. 11, . Web of Science Citations: 3. (15/16661-1)

VALENTE, GUILHERME T.; ACENCIO, MARCIO L.; MARTINS, CESAR; LEMKE, NEY. The Development of a Universal In Silico Predictor of Protein-Protein Interactions. PLoS One, v. 8, n. 5, . Web of Science Citations: 16. (09/05234-4, 13/02018-4)

VALENTE, GUILHERME T.; NAKAJIMA, RAFAEL T.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARQUES, DIEGO F.; ALMEIDA, RODRIGO O.; SIMOES, RAFAEL P.; MARTINS, CESAR. B chromosomes: from cytogenetics to systems biology. CHROMOSOMA, v. 126, n. 1, p. 73-81, . Web of Science Citations: 21. (13/04533-3)

RAMOS, ERICA; CARDOSO, ADAUTO L.; BROWN, JUDITH; MARQUES, DIEGO F.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; O'NEILL, RACHEL J.; MARTINS, CESAR. The repetitive DNA element BncDNA, enriched in the B chromosome of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata, transcribes a potentially noncoding RNA. CHROMOSOMA, v. 126, n. 2, p. 313-323, . Web of Science Citations: 15. (13/04533-3, 12/20959-8, 10/17212-2)

SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; NOGAROTO, VIVIANE; ALMEIDA, MARA CRISTINA; ARTONI, ROBERTO FERREIRA; VALENTE, GUILHERME TARGINO; MARTINS, CESAR; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; CESTARI, MARTA MARGARETE; VICARI, MARCELO RICARDO. Sequence analyses and chromosomal distribution of the Tc1/Mariner element in Parodontidae fish (Teleostei: Characiformes). Gene, v. 593, n. 2, p. 308-314, . Web of Science Citations: 8. (12/15258-0, 13/04533-3)

VALENTE, GUILHERME T.; CONTE, MATTHEW A.; FANTINATTI, BRUNO E. A.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; CARVALHO, ROBSON F.; VICARI, MARCELO R.; KOCHER, THOMAS D.; MARTINS, CESAR. Origin and Evolution of B Chromosomes in the Cichlid Fish Astatotilapia latifasciata Based on Integrated Genomic Analyses. Molecular Biology and Evolution, v. 31, n. 8, p. 2061-2072, . Web of Science Citations: 58. (11/03807-7)

PINHAL, DANILLO; BOVOLENTA, LUIZ A.; MOXON, SIMON; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; ACENCIO, MARCIO L.; PATTON, JAMES G.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; LEMKE, NEY; MARTINS, CESAR. Genome-wide microRNA screening in Nile tilapia reveals pervasive isomiRs' transcription, sex-biased arm switching and increasing complexity of expression throughout development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . Web of Science Citations: 4. (12/15589-7, 12/13450-1, 15/16661-1, 11/06465-0, 15/19176-7, 13/06864-7)

NACHTIGALL, PEDRO G.; DIAS, MARCOS C.; CARVALHO, ROBSON F.; MARTINS, CESAR; PINHAL, DANILLO. MicroRNA-499 Expression Distinctively Correlates to Target Genes sox6 and rod1 Profiles to Resolve the Skeletal Muscle Phenotype in Nile Tilapia. PLoS One, v. 10, n. 3, . Web of Science Citations: 11. (11/06465-0, 13/06864-7, 12/15589-7)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

VENTURELLI, Natália Bortholazzi. Cromossomo B comportamento meiótico e padrões de segregação em Astatotilapia latifasciata. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (13/25234-4

COAN, Rafael Luiz Buogo. Análise genômica em larga escala de elementos repetitivos com foco em cromossomos B do ciclídeo Astatotilapia latifasciata. Dissertação (Mestrado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (14/16763-6

JEHANGIR, Maryam. Genome assembly of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata with focus in population genomics of B chromosome polymorphism. Dissertação (Mestrado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (14/17683-6

NAKAJIMA, Rafael Takahiro. Análises em larga escala de proteínas e construção de redes biológicas com foco em estudos de cromossomos B. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (15/11485-0

FANTINATTI, Bruno Evaristo de Almeida. Contribuições ao conhecimento de cromossomos supernuméricos em peixes, utilizando como modelo Haplochromis obliquidens (Perciformes, Cichlidae).  78 f. Dissertação (Mestrado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (09/11850-0

GIUSTI, Juliana. MicroRNAs e seu papel no desenvolvimento e diferenciação sexual da Tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus).  70 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (11/13903-3

VALENTE, Guilherme Targino. Analisando a determinação sexual de vertebrados com base em redes de interação entre proteínas.  83 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (09/07775-2

GERALDO, Marcos Tadeu. Evolução e organização genômica do gene FOXL2 em vertebrados.  59 f. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Biociências de Botucatu.  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho".  Botucatu.  (10/13143-6

CARMELLO, Bianca de Oliveira. Organização genômima e análise da expressão do gene hnRNP Q-like (Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A-like) retroinserido no cromossomo B de Astatotilapia latifasciata.  38 f. Dissertação (Mestrado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (13/06092-4

OLIVEIRA, Sárah Gomes de. Dinâmica evolutiva de DNAs repetitivos com ênfase em espécies da tribo Phanaeini.  199 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (09/04351-7

FERREIRA, Irani Alves. Mapeamento cromossômico comparativo em peixes ciclícos utilizando sequências repetitivas de DNA.  99 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (05/54295-5

PINHAL, Danillo. Aplicação da genética molecular no manejo e conservação de tubarões.  129 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (07/03067-8

MAZZUCHELLI, Juliana. Integrando citogenética e genômica em estudos comparativos entre peixes ciclídeos e outros vertebrados.  70 f. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  Botucatu.  (08/03130-4

FERREIRA, Irani Alves. Mapeamento cromossômico da tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) utilizando sequências de DNA.  72 f. Dissertação (Mestrado) -  Campus de Botucatu.  Universidade Estadual Paulista (UNESP).  Botucatu.  (03/11358-1

MARQUES, Diego Ferreira. O carvalho e a mulemba : Angola na narrativa colonial portuguesa. Tese (Doutorado) -  Instituto de Filosofia e Ciências Humanas.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (12/16288-0

AHMAD, Syed Farhan. High Scale Genomic Applied to B chromosome biology. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Instituto de Biociências (Campus de Botucatu).  (14/16477-3

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