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Estudo do metabolismo de micro-organismos do ambiente marinho: perfil químico e biossíntese

Processo: 16/05133-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de junho de 2016
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2020
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
Pesquisador responsável:Roberto Gomes de Souza Berlinck
Beneficiário:Laura Pavan Ióca
Instituição Sede: Instituto de Química de São Carlos (IQSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):18/10742-8 - A função de um peptídeo não-ribossimal para promover a motilidade de Pseudovibrio brasiliensis Ab134 e bactérias relacionadas, BE.EP.DR
Assunto(s):Química de produtos naturais   Produtos naturais   Mineração de genoma
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biosynthesis | gene cluster | genome mining | marine-derived bacterium | marine-derived fungus | Natural Products | Química de produtos naturais

Resumo

O presente projeto procura ampliar o conhecimento sobre a maquinaria enzimática de três classes de metabólitos secundários únicos, incluindo o estudo por genome mining da bactéria marinha Pseudovibrio brasiliensis Ab134, assim como a busca dos gene clusters codificantes para as ±-nitropironas, isopirofeno e naftoquinonaimina, no genoma da linhagem fúngica Aspergillus sp. DLM38, do roussoelatído em Roussoella sp. DLM33 e das fomactinas no genoma da linhagen fúngica Biatriospora sp. CBMAI 1333.

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Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BERLINCK, ROBERTO G. S.; CRNKOVIC, CAMILA M.; GUBIANI, JULIANA R.; BERNARDI, DARLON I.; IOCA, LAURA P.; QUINTANA-BULLA, JAIRO I.. The isolation of water-soluble natural products - challenges, strategies and perspectives. NATURAL PRODUCT REPORTS, . (13/50228-8, 16/16033-3, 19/00447-1, 20/11691-8, 16/05133-7, 17/06014-4, 16/21341-9, 18/10742-8)
TONON, LUCIANE A. CHIMETTO; RUA, CINTIA; CRNKOVIC, CAMILA M.; BERNARDI, I, DARLON; JUNIOR, OSMINDO R. PIRES; HADDAD, CELIO F. B.; PEDROSA, CAROLINADA S. G.; SOUZA, LETICIA R. Q.; REHEN, STEVENS K.; DE AZEVEDO, GUSTAVO P. R.; et al. Microbiome associated with the tetrodotoxin-bearing anuran Brachycephalus pitanga. Toxicon, v. 203, p. 139-146, . (13/50741-7, 16/14375-4, 16/05133-7, 17/06014-4, 13/50228-8, 16/21341-9, 19/00447-1)
IOCA, LAURA P.; NICACIO, KAREN J.; BERLINCK, ROBERTO G. S.. Natural Products from Marine Invertebrates and Microorganisms in Brazil between 2004 and 2017: Still the Challenges, More Rewards. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 29, n. 5, p. 998-1031, . (16/05133-7, 13/50228-8)
KAHLERT, LUKAS; BERNARDI, DARLON; HAUSER, MAURICE; IOCA, LAURA P.; BERLINCK, ROBERTO G. S.; SKELLAM, ELIZABETH J.; COX, RUSSELL J.. Early Oxidative Transformations During the Biosynthesis of Terrein and Related Natural Products. CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL, v. 27, n. 46, p. 11895-11903, . (16/05133-7, 18/10742-8, 16/21341-9, 13/50228-8, 20/11691-8, 19/17721-9)
DE AMORIM, MARCELO R.; BARBOSA, CAMILA DE S.; PAZ, TIAGO A.; IOCA, LAURA P.; NICACIO, KAREN J.; DE OLIVEIRA, LUCIANNE F. P.; GOULART, MIRIAN O.; PAULINO, JULIA M.; DA CRUZ, MATEUS O.; FERREIRA, ANTONIO G.; et al. Polyketide- and Terpenoid-Derived Metabolites Produced by a Marine-Derived Fungus, Peroneutypa sp.. Journal of Natural Products, v. 86, n. 6, p. 11-pg., . (19/17721-9, 16/05133-7, 15/01017-0, 20/12904-5, 20/01229-5)
KAHLERT, LUKAS; BERNARDI, DARLON; HAUSER, MAURICE; IOCA, LAURA P.; BERLINCK, ROBERTO G. S.; SKELLAM, ELIZABETH J.; COX, RUSSELL J.. Early Oxidative Transformations During the Biosynthesis of Terrein and Related Natural Products. CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL, . (19/17721-9, 18/10742-8, 16/05133-7, 16/21341-9, 13/50228-8, 20/11691-8)
IOCA, LAURA P.; DAI, YITAO; KUNAKOM, SYLVIA; DIAZ-ESPINOSA, JENNIFER; KRUNIC, ALEKSEJ; CRNKOVIC, CAMILA M.; ORJALA, JIMMY; SANCHEZ, LAURA M.; FERREIRA, ANTONIO G.; BERLINCK, ROBERTO G. S.; et al. A Family of Nonribosomal Peptides Modulate Collective Behavior in Pseudovibrio Bacteria Isolated from Marine Sponges{*}{*}. ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, v. 60, n. 29, p. 15891-15898, . (15/01017-0, 16/05133-7, 18/10742-8)
NICACIO, KAREN J.; IOCA, LAURA P.; FROES, ADRIANA M.; LEOMIL, LUCIANA; APPOLINARIO, LUCIANA R.; THOMPSON, CHRISTIANE C.; THOMPSON, FABIANO L.; FERREIRA, ANTONIO G.; WILLIAMS, DAVID E.; ANDERSEN, RAYMOND J.; et al. Cultures of the Marine Bacterium Pseudovibrio denitrificans Ab134 Produce Bromotyrosine-Derived Alkaloids Previously Only Isolated from Marine Sponges. Journal of Natural Products, v. 80, n. 2, p. 235-240, . (16/05133-7, 13/50228-8)
RODRIGUES-COSTA, FERNANDA; SLIVINSKI, JULIANO; IOCA, LAURA P.; BERTONHA, ARIANE F.; DE FELICIO, RAFAEL; DA CUNHA, MARCOS GUILHERME; DA MATA MADEIRA, PAULO VINICIUS; CAUZ, ANA C. G.; TRINDADE, DANIEL MARAGNO; FREIRE, VITOR F.; et al. Merulinic acid C overcomes gentamicin resistance in Enterococcus faecium. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 100, . (16/05133-7, 13/50228-8, 11/52067-6, 17/12436-9, 15/19906-5, 14/11980-9)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
IÓCA, Laura Pavan. Descoberta e estudos de biossíntese de peptídeos não-ribossomais envolvidos na motilidade de Pseudovibrio brasiliensis Ab134. 2020. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química de São Carlos (IQSC/BT) São Carlos.