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Análises ômicas multi-teciduais para caracterizar a eficiência alimentar em bovinos de corte

Processo: 17/14707-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2017
Data de Término da vigência: 31 de março de 2018
Área de conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Heidge Fukumasu
Beneficiário:Pâmela Almeida Alexandre
Supervisor: Antonio Reverter-Gomez
Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: CSIRO Agriculture and Food, Austrália  
Vinculado à bolsa:15/22276-3 - Abordagem de Biologia de Sistemas Para a Determinação de Mecanismos Moleculares Associados à Eficiência Alimentar de Bovinos Nelore, BP.DR
Assunto(s):Técnicas de genotipagem   Biologia de sistemas   Análise de sequência de RNA   Intercâmbio de pesquisadores
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biologia de sistemas | Networks | polimorfismo funcional | RNAseq | genotipagem e expressão gênica

Resumo

Embora a eficiência da alimentação seja uma característica de grande interesse econômico e ambiental, a seleção de animais é difícil devido ao seu caráter poligênico, sob grande influência ambiental. Assim, há necessidade de estudos que integrem diferentes fontes de informação para criar uma compreensão mais completa da dinâmica dos mecanismos moleculares relacionados a essa característica. Propomos, neste projeto, um estágio de 6 meses no exterior com o Group of Computational and Systems Biology da Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO) para realizar análises genômica e transcriptômica multi-tecido para comparar grupos de alta e baixa eficiência alimentar e identificar os principais mecanismos biológicos relacionados a essa característica. Entre as análises propostas estão: expressão diferencial, identificação de genes reguladores, análise de redes e vias metabólicas, identificação de polimorfismos funcionais e expressão alelo-específica. Acreditamos que o período será suficiente para realizar a análise e o conhecimento adquirido ajudará não só a melhorar a qualidade desse trabalho, mas também a contribuir com outros trabalhos do grupo. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ALEXANDRE, PAMELA A.; REVERTER, ANTONIO; BEREZIN, ROBERTA B.; PORTO-NETO, LAERCIO R.; RIBEIRO, GABRIELA; SANTANA, MIGUEL H. A.; FERRAZ, JOSE BENTO S.; FUKUMASU, HEIDGE. Exploring the Regulatory Potential of Long Non-Coding RNA in Feed Efficiency of Indicine Cattle. GENES, v. 11, n. 9, . (17/14707-0, 15/22276-3, 14/07566-2)
ALEXANDRE, PAMELA A.; NAVAL-SANCHEZ, MARINA; PORTO-NETO, LAERCIO R.; FERRAZ, JOSE BENTO S.; REVERTER, ANTONIO; FUKUMASU, HEIDGE. Systems Biology Reveals NR2F6 and TGFB1 as Key Regulators of Feed Efficiency in Beef Cattle. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, . (17/14707-0, 15/22276-3, 14/07566-2, 14/02493-7)