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Criação de uma infraestrutura de Armazém de Dados para Análise Visual voltada à saúde

Processo: 18/11424-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2018
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2019
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:Marco Antonio Gutierrez
Beneficiário:Daniel Mário de Lima
Instituição Sede: Instituto do Coração Professor Euryclides de Jesus Zerbini (INCOR). Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da USP (HCFMUSP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/17078-0 - Mineração, indexação e visualização de Big Data no contexto de sistemas de apoio à decisão clínica (MIVisBD), AP.TEM
Assunto(s):Mineração de dados   Análise visual   Banco de dados   Data warehouse
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Análise Visual | Apoio Diagnóstico e Terapêutico | Armazém de Dados | Banco de dados | Mineração de Dados | Sistemas Hospitalares | Banco de Dados

Resumo

O objetivo do trabalho é construir uma infraestrutura baseada nos dados armazenados nos bancos de dados clínicos do InCor e outros 24 Hospitais da Rede Pública do Estado de São Paulo. A primeira e mais onerosa tarefa na alçada deste objetivo é a limpeza dos dados. Sistemas Analíticos Visuais encompassam ferramentas de apoio a decisão em saúde, e portanto, precisam fornecer informação confiável para a tomada de decisões tão precisas quanto possível. Contudo, erros nos registros originais podem levar a decisões erradas. Uma vez que a infraestrutura de armazenamento esteja disponível, é necessário determinar e preparar os dados relevantes que serão usados por cada aplicação analítica visual. O principal objetivo do candidato ao treinamento técnico é portanto prover a infraestrutura envolvendo os dados dos diversos sistemas de infomação hospitalares para permitir o desenvolvimento das ferramentas de análise visual.O sistema de informações hospitalares a ser usado na coleta de dados clínicos é desenvolvido pelo Departamento de Informática do InCor. Este sistema consiste de módulos que registram a admissão, alta e transferência (ADT) dos pacientes, as atividades médicas, os diagnósticos e terapias, solicitações e acessos aos dados dos pacientes, incluindo sinais vitais, imagens e exames laboratoriais. Os módulos são integrados em uma aplicação web de modo a permitir uma navegação fácil e rápida. O sistema tem uma arquitetura em três camadas baseado no Oracle 10g na camada de banco de dados, Oracle Forms na camada de aplicação e um navegador Web na camada de interface com o usuário. Adicionalmente aos dados clínicos, o sistema também inclui informações administrativas e financeiras. O número de pacientes registrados na base de dados do InCor ao final de 2015 era em torno de 1,2 milhões de indivíduos, e o número total dos outros 24 Hospitais era em torno de 1,8 milhões de indivíduos.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LIMA, DANIEL M.; RODRIGUES-JR, JOSE F.; TRAINA, AGMA J. M.; PIRES, FABIO A.; GUTIERREZ, MARCO A.; OHNOMACHADO, L; SEROUSSI, B. Transforming Two Decades of ePR Data to OMOP CDM for Clinical Research. MEDINFO 2019: HEALTH AND WELLBEING E-NETWORKS FOR ALL, v. 264, p. 5-pg., . (18/11424-0)
LIMA, DANIEL M.; GRAVES, CATHARINE, V; GUTIERREZ, MARCO A.; BRANDOLI, BRUNO; RODRIGUES JR, JOSE F.; SCLAROFF, S; DISTANTE, C; LEO, M; FARINELLA, GM; TOMBARI, F. Full Motion Focus: Convolutional Module for Improved Left Ventricle Segmentation Over 4D MRI. IMAGE ANALYSIS AND PROCESSING, ICIAP 2022, PT I, v. 13231, p. 13-pg., . (16/17078-0, 18/11424-0)