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Análise de variantes genéticas determinantes para a infecção e evolução do quadro clínico em jovens adultos com COVID-19

Processo: 20/06091-1
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
Data de Término da vigência: 30 de junho de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Beneficiário:Pedro Alexandre Favoretto Galante
Instituição Sede: Hospital Sírio-Libanês. Sociedade Beneficente de Senhoras (SBSHSL). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Anamaria Aranha Camargo ; Cibele Masotti ; Diogo Meyer ; Maria Isabel Alves de Souza Waddington Achatz ; Paula Fontes Asprino
Vinculado ao auxílio:18/15579-8 - Retroelementos: uma força motriz criando novidades genéticas no genoma humano e de camundongos, AP.JP2
Assunto(s):Biologia computacional  Predisposição genética para doença  Variação genética  SARS-CoV-2  COVID-19  Infecções por Coronavirus  Análise de sequência de DNA  Polimorfismo genético  Enzima conversora da angiotensina 2  Jovens  Pandemias  Controle de doenças transmissíveis 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | Covid-19 | Polimorfismo | Receptores ACE2 TMPRSS2 | SARS-CoV-2 | Sequenciamento de DNA | Bioinformática, genômica

Resumo

O vírus da síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2) vem causando uma pandemia sem precedentes na história da humanidade. Em cerca de 3.5 meses da doença (COVID-19), esse vírus já infectou mais de 2.6 milhões de pessoas, causando mais de 178 mil mortes. Inicialmente, acreditava-se que o prognóstico da doença seria ruim quase que exclusivamente para pessoas do chamado grupo de risco (idosos ou pessoas com doenças crônicas preexistentes). No entanto, estamos vendo um número crescente de casos fatais em que as vítimas são jovens adultos (<55 anos de idade) e aparentemente saudáveis. Nos EUA, o país mais afetado pela doença, pessoas nessa faixa etária representam 51% das internações em UTIs e, dessas, S morrem em decorrência da doença. Adicionalmente, fatores como raça e gênero parecem ter uma importância em relação ao risco à COVID-19. Portanto, se analisado de um ponto de vista amplo, tais evidências sugerem haver fatores genéticos que determinam o curso da infecção e a capacidade de resposta de cada organismo ao SARS-CoV-2. Nesse projeto, através de sequenciamento de DNA e análises computacionais, iremos estudar variações genéticas em três grupos de pacientes jovens adultos infectados por SARS-CoV-2: pacientes que desenvolveram sintomas leves, graves ou críticos da doença. Em uma primeira frente de trabalho, buscaremos variações genéticas potencialmente associadas a tais sintomas. Analisaremos variações em todos os genes codificadores e também em genes sabidamente envolvidos na infecção viral, tal como o ACE2 e o TMPRSS2. Em uma segunda frente, iremos fazer a tipagem dos alelos HLA dos pacientes e buscar uma relação dessas variações com uma resposta (excessiva ou atenuada) ao vírus. Como resultado final, esperamos identificar um conjunto de variantes genéticas associadas a cada grupo de pacientes. Esses resultados podem contribuir para prevermos indivíduos mais (ou menos) vulneráveis a doença e entendermos os mecanismos moleculares de ação do vírus, contribuindo para o desenvolvimento de tratamentos e maneiras eficazes de combater o SARS-CoV-2. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE FREITAS AMORIM, VITOR MARTINS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FILIPE F.; ULRICH, HENNING; GALANTE, PEDRO A. F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants of Concern: A Perspective for Emerging More Transmissible and Vaccine-Resistant Strains. Viruses-Basel, v. 14, n. 4, p. 21-pg., . (18/07366-4, 20/06091-1, 19/00195-2, 16/09047-8, 20/14158-9, 20/04680-0, 17/18246-7, 17/19541-2, 18/15579-8)
DE SOUZA, ANACLETO SILVA; AMORIM, VITOR MARTINS DE FREITAS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FELIPE R. C.; DOS SANTOS, FILIPE F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; JUVENAL, GUILHERME DE ARAUJO; HUANG, YIHUA; GE, PINGJU; JIANG, YINAN; et al. Molecular Dynamics Analysis of Fast-Spreading Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants and Their Effects on the Interaction with Human Angiotensin-Converting Enzyme 2. ACS OMEGA, v. 7, n. 35, p. 10-pg., . (20/06091-1, 17/18246-7, 17/19541-2, 20/04680-0, 19/00195-2, 16/09047-8, 18/15579-8, 18/07366-4, 20/14158-9)
SEQUEIRA BARREIRO, RODRIGO ARAUJO; SABBAGA, JORGE; ROSSI, BENEDITO M.; ACHATZ, MARIA ISABEL W.; BETTONI, FABIANA; CAMARGO, ANAMARIA A.; ASPRINO, PAULA F.; GALANTE, PEDRO A. F.. Monoallelic deleterious MUTYH germline variants as a driver for tumorigenesis. JOURNAL OF PATHOLOGY, v. 256, n. 2, . (18/15579-8, 20/06091-1, 19/04927-8)