O físico Carlos Henrique de Brito Cruz assumiu a presidência do Conselho Superior da FAPESP em 1996. Ocupou o cargo até 2002. Em 2005, assumiu como diretor científico.
Formado em Engenharia de Eletrônica pelo Instituto Tecnológico da Aeronáutica (ITA) em 1978, fez mestrado (concluído em 1980) e o doutorado (1983) no Instituto de Física Gleb Wataghin da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp).
Foi diretor do Instituto de Física Gleb Wataghin (1991 a 1994 e 1998 a 2002), pró-reitor de Pesquisa (1994 a 1998) e reitor da Unicamp de abril de 2002 a abril de 2005.