Os efeitos da Emenda Constitucional no 39 tornam-se ainda mais claros: a FAPESP pôde executar um orçamento cerca de 40% maior que a própria dotação estadual, com impacto positivo sobre as várias modalidade de apoio, com exceção da categoria Mestrado II, que se manteve constante.
O Relatório de Atividades 1985 registra que, entre 1984 e 1985, o número de auxílios publicações aumentou 192,8%, o de auxílios pesquisa 40,6%, o de participação em reuniões no Brasil 39,0%, de reuniões no exterior 39,3%, o de bolsas de iniciação científica 43,3%, de mestrado I 72,7%, de doutorado I 13,0%, de doutorado II 51,0%, de pós-graduação no exterior 83,7% e de pós-doutorado no exterior 38,7%.
Em 1985 a FAPESP aprovou 526 dos 628 projetos de auxílios à pesquisa solicitados e 1.805 das 2.086 bolsas.
Em comparação com o ano anterior, o número de projetos de auxílios à pesquisa aumentou oito das 12 grandes áreas: por exemplo, em Agrárias 135%, em Geociências 65%, em Ciências Humanas e Sociais, 46%.