A modalidade Pesquisa em Políticas Públicas tem o objetivo de financiar pesquisas sobre o atendimento de demandas sociais concretas, desenvolvidas em parceria entre universidades e instituições de pesquisa e órgãos governamentais ou organizações não-governamentais (ONGs). Os projetos são desenvolvidos sob a responsabilidade de um Pesquisador Principal vinculado, a instituições superiores de ensino e pesquisa no Estado de São Paulo. A seleção é feita por meio de análise pelos pares.