Em 2017, a FAPESP lançou um edital voltado ao apoio à modernização dos institutos de pesquisa do Estado de São Paulo. O objetivo é ampliar a capacidade científica e tecnológica desses institutos, de forma a poderem atender melhor às demandas da sociedade. Por meio do referido edital, a Fundação destina recursos exclusivamente para apoiar atividades de pesquisa nas modalidades de Infraestrutura Institucional de Pesquisa, Bolsas no País e no Exterior, Auxílio à Pesquisa Jovens Pesquisadores, Auxílio Pesquisador Visitante, Programa de Apoio à Pesquisa em Parceria para Inovação Tecnológica (PITE) e Programa de Pesquisa em Políticas Públicas.