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A FAPESP participa de chamadas de propostas de pesquisa em parceria com o European Research Council (ERC), no contexto da colaboração entre a Comissão Europeia e o Conselho Nacional de Fundações de Amparo à Pesquisa (Confap). A parceria visa promover, desenvolver e facilitar a colaboração em pesquisa entre a União Europeia e o Brasil, por meio da participação de pesquisadores de institutos de ensino e pesquisa do Brasil em projetos científicos financiados pelo ERC.