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Passo de mudança do tropismo pelo coreceptor em indivíduos infectados com VIH-1 após a infecção recente

Processo: 18/05389-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de junho de 2018 - 30 de novembro de 2018
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Ricardo Sobhie Diaz
Beneficiário:Ricardo Sobhie Diaz
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):HIV-1  Infectologia  Progressão da doença  Tropismo 

Resumo

A entrada do HIV-1 nas células alvo influencia vários aspectos da patogênese do HIV-1, incluindo o tropismo viral, a transmissão do HIV-1 e a progressão da doença e a resposta aos inibidores de entrada. A evolução das cepas que utilizam CCR5 para CXCR4 em um hospedeiro humano ainda é imprevisível. Aqui, analisamos o tempo e os preditores para a evolução do tropismo pelo coreceptores entre os indivíduos recentemente infectados pelo VIH-1. O DNA proviral foi avaliado longitudinalmente em 66 indivíduos utilizando Geno2pheno[coreceptor]. Demografia, carga viral, contagem de células T CD4+ e CD8+, polimorfismos CCR5”32, coinfecção do vírus GB (GBV-C) e perfis HLA também foram avaliados. O sequenciamento paralelo maciço foi realizado em amostras iniciais de 11 indivíduos selecionados. O mudança de tropismo de cepas utilizando CCR5 para CXCR4 foi identificada em 9/49 (18,4%) indivíduos. Apenas taxa basal de falso positivo (FPR) baixa foi encontrada como um preditor significativo de mudança de tropismo. Nenhuma variante minoria usando CXCR4 foi identificada em amostras basal de 4/5 individuos quem mostrou mudança de tropismo R5 para não-R5. A análise de regressão logística mostrou que os pacientes com FPR basal de 40,6% apresentaram FPR estável ao longo do tempo, enquanto os FPRs menores tendem a queda progressiva, levando a aparecimento de cepas usando CXCR4, com um tempo de evolução médio de 27,29 meses (intervalo, 8,90 para 64.62). Um limite de FPR acima de 40,6% determinado por análise de regressão logística pode tornar desnecessário determinar ainda mais o tropismo para predição de progressão da doença relacionada ao aparecimento de cepas X4 ou ao uso de antagonistas de CCR5. A detecção de variantes com FPR intermediários e queda progressiva do FPR ao longo do tempo não só fortalece o poder de Geno2pheno na previsão do tropismo do HIV, mas também indiretamente confirma a evolução contínua de variantes anteriores de cepas usando R5 para CXCR4. (AU)