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Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore

Processo: 17/10630-2
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de junho de 2018 - 31 de maio de 2023
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Lucia Galvão de Albuquerque
Beneficiário:Lucia Galvão de Albuquerque
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Josineudson Augusto Ii de Vasconcelos Silva ; Maria Eugênia Zerlotti Mercadante ; Roberto Carvalheiro
Pesq. associados:Alexandre Berndt ; Ana Fabrícia Braga Magalhães ; Camila Urbano Braz ; Daiane Cristina Becker Scalez ; Daniel Guariz Pinheiro ; Diercles Francisco Cardoso ; Fernando Sebastián Baldi Rey ; Gerardo Alves Fernandes Júnior ; Guilherme Jordão de Magalhães Rosa ; Henrique Nunes de Oliveira ; Humberto Tonhati ; Jesus Aparecido Ferro ; Joslaine Noely dos Santos Goncalves Cyrillo ; Larissa Fernanda Simielli Fonseca ; Luis Artur Loyola Chardulo ; Rafael Espigolan ; Roberta Carrilho Canesin ; Rosa Toyoko Shiraishi Frighetto
Auxílios(s) vinculado(s):18/20026-8 - EMU concedido no processo 2017/10630-2: servidor, AP.EMU
Bolsa(s) vinculada(s):20/03975-6 - Incorporando variantes de sequência para melhorar a predição genômica de características reprodutivas em bovinos Nelore, BP.PD
19/11738-7 - Correlações fenotípicas, genéticas e associação genômica ampla entre eficiência alimentar e emissão de metano entérico de bovinos Nelore, BP.DR
20/02392-7 - Determinação das emissões de metano entérico de bovinos da raça Nelore, BP.TT
+ mais bolsas vinculadas 20/02304-0 - Associação do comportamento ingestivo e emissão de metano entérico em bovinos da raça Nelore, BP.IC
19/06361-1 - Interação genótipo-ambiente em bovinos Nelore para características de crescimento e escores visuais com utilização de dados de sequência, BP.DR
19/15397-0 - Estudo de associação ampla e detecção de assinaturas de seleção no genoma de bovinos nelore usando dados de sequenciamento, BP.PD
19/16732-7 - Aplicação da bioinformática na análise do genoma e transcriptoma de bovinos Nelore, integrando informações pública, BP.PD
19/05165-4 - Avaliação dos fluxos das emissões de metano ruminal de animais da raça Nelore, BP.TT
18/12504-7 - Fenotipagem de machos Nelore para emissão de metano entérico em teste de eficiência alimentar, BP.TT
18/10109-3 - Identificação e análise de variantes genéticas obtidas a partir do sequenciamento do genoma de touros da raça Nelore, BP.PD
18/04313-7 - Avaliação da endogamia e estudo de variantes funcionais usando sequenciamento completo do genoma de bovinos da raça Nelore, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Análise de sequência de DNA  Transcriptoma  Gado Nelore  Qualidade da carne  Carcaça  Metano  Eficiência alimentar 

Resumo

De maneira geral, os rebanhos brasileiros precisam melhorar seus índices de eficiência e de qualidade do produto final que é a carne. Além disto, atualmente, existe uma preocupação mundial quanto ao aspecto da sustentabilidade da produção animal, o qual poderá ser melhorado por meio da seleção de animais que emitam menor quantidade de metano entérico para a atmosfera. Com a evolução das técnicas de sequenciamento completo do genoma e a diminuição do custo por animal, o sequenciamento tem sido proposto como alternativa aos chips de SNP, apresentando uma série de vantagens em relação aos mesmos. Assim, o presente projeto visa criar um banco de dados de emissão de metano entérico e utilizar um conjunto de informações de características de eficiência alimentar, qualidade de carne e carcaça bem como de reprodução, para realizar estudos genômicos com base em sequência completa do DNA, visando desenvolver tecnologias que permitam o melhor conhecimento biológico e o melhoramento da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de bovinos da raça Nelore. A princípio, serão desenvolvidos os seguintes tópicos no projeto: a) estudo genético-quantitativo de características relacionadas à emissão de metano entérico e suas associações genéticas com características de eficiência alimentar; b) estudo da acurácia de imputação para a sequência completa a partir de animais genotipados com chips comerciais com diferentes números de SNPs e utilizando diferentes métodos; c) estudo da caracterização do genoma do Nelore utilizando dados de sequenciamento; d) estudo de associação genômica ampla para características de importância econômica utilizando a sequência completa do genoma juntamente com o mapeamento fino de genes candidatos, visando à identificação das mutações causais e busca de mutações deletérias; e) estudo de seleção genômica realizada com base em dados de sequenciamento para características relacionadas com a qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne; f) análise de expressão gênica de características relacionadas com eficiência alimentar (transcriptoma). (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Hallados genes potencialmente vinculados con la resistencia del ganado a las variaciones ambientales  
Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais 
Pós-doutorado em Bioinformática com bolsa da FAPESP 
Pós-doutorado em Bioinformática com bolsa da FAPESP 
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (27 total):
Mais itensMenos itens
Revista Pecuária Brasil: Os genes da rusticidade (01/Nov/2019)
The Dairy Site (EUA): Brazilian Study Identifies Genes Potentially Associated with Heat- and Drought-resistant Cattle (16/Out/2019)
The Cattle Site (Reino Unido): Brazilian Study Identifies Genes Potentially Associated with Heat- and Drought-resistant Cattle (16/Out/2019)
The Beef Site (Reino Unido): Brazilian Study Identifies Genes Potentially Associated with Heat- and Drought-resistant Cattle (16/Out/2019)
NCYT Amazings (Espanha): Hallados genes potencialmente vinculados con la resistencia de ganado bovino a las variaciones ambientales (23/Set/2019)
Agro Rural News: Hallados genes potencialmente vinculados con la resistencia del ganado a las variaciones ambientales (23/Set/2019)
Mundo Agropecuario (Venezuela): Hallados genes potencialmente vinculados con la resistencia del ganado a las variaciones ambientales (23/Set/2019)
Perulactea (Peru): Hallados genes potencialmente vinculados con la resistencia del ganado a las variaciones ambientales (23/Set/2019)
Economis (Argentina): Hallaron genes potencialmente vinculados con la resistencia del ganado a las variaciones ambientales (23/Set/2019)
Acrissul - Associação dos Criadores do Mato Grosso do Sul: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas (12/Set/2019)
Rural Pecuária: Pesquisadores do Brasil e da Austrália anunciaram a descoberta de 16 genes potencialmente associados com a resistência do gado Nelore (11/Set/2019)
KLFF online: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas (11/Set/2019)
Foco Rural: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas (11/Set/2019)
Ioeste: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas (11/Set/2019)
Ciência e Clima: Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais (10/Set/2019)
Casa Rural: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas. (10/Set/2019)
TNH1: Estudo ajuda a identificar gados menos sensíveis ao ambiente (09/Set/2019)
Compre Rural: Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado (06/Set/2019)
Diario de Ciencias Aplicadas (Argentina): Genes potencialmente vinculados a la resistencia del ganado a variaciones ambientales identificadas (06/Set/2019)
A Lavoura online: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas. (06/Set/2019)
Brasil CT&I: Estudo ajuda a identificar gados menos sensíveis ao ambiente (06/Set/2019)
Confap - Conselho Nacional das Fundações Estaduais de Amparo à Pesquisa: Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais (05/Set/2019)
Conexão Tocantins : Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais (05/Set/2019)
LabNetwork: Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais (05/Set/2019)
Portal CanaMix : Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas. (05/Set/2019)
Revista Analytica online: Estudo ajuda a identificar gado resistente às variações climáticas. (05/Set/2019)
Portal Neo Mondo: Identificados genes potencialmente ligados à resistência do gado a variações ambientais (05/Set/2019)

Publicações científicas (8)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FERNANDES JUNIOR, GERARDO A.; CARVALHEIRO, ROBERTO; DE OLIVEIRA, HENRIQUE N.; SARGOLZAEI, MEHDI; COSTILLA, ROY; VENTURA, RICARDO V.; FONSECA, LARISSA F. S.; NEVES, HAROLDO H. R.; HAYES, BEN J.; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. Imputation accuracy to whole-genome sequence in Nellore cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 53, n. 1 MAR 12 2021. Citações Web of Science: 0.
MAGALHAES MUNIZ, MARIA MALANE; SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO; DE OLIVEIRA, HINAYAH ROJAS; BALDI, FERNANDO; CHARDULO, ARTUR LOYOLA; FERRO, JESUS APARECIDO; CANOVAS, ANGELA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Identification of novel mRNA isoforms associated with meat tenderness using RNA sequencing data in beef cattle. MEAT SCIENCE, v. 173, MAR 2021. Citações Web of Science: 0.
ALVES, JACKELINE SANTOS; DIAZ, IARA DEL PILAR SOLAR; DA CRUZ, VALDECY APARECIDA ROCHA; BASTOS, MARISA SILVA; DE OLIVEIRA, LOUISE SARMENTO MARTINS; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; DE CAMARGO, GREGORIO MIGUEL FERREIRA; COSTA, RAPHAEL BERMAL. The effect of mitochondrial DNA polymorphisms on cattle reproduction. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, v. 48, n. 1 JAN 2021. Citações Web of Science: 0.
ALVES, A. A. C.; ESPIGOLAN, R.; BRESOLIN, T.; COSTA, R. M.; FERNANDES JUNIOR, G. A.; VENTURA, R. V.; CARVALHEIRO, R.; ALBUQUERQUE, L. G. Genome-enabled prediction of reproductive traits in Nellore cattle using parametric models and machine learning methods. ANIMAL GENETICS, v. 52, n. 1 NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
BENFICA, LORENA FERREIRA; SAKAMOTO, LEANDRO SANNOMIYA; BRAGA MAGALHAES, ANA FABRICIA; VARGAS DE OLIVEIRA, MATHEUS HENRIQUE; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; CAVALHEIRO, ROBERTO; BRANCO, RENATA HELENA; DOS SANTOS GONCALVES CYRILLO, JOSLAINE NOELY; ZERLOTTI MERCADANTE, MARIA EUGENIA. Genetic association among feeding behavior, feed efficiency, and growth traits in growing indicine cattle. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 98, n. 11 NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
FERNANDES JUNIOR, GERARDO ALVES; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; CARVALHEIRO, ROBERTO; CARDOSO, DIERCLES FRANCISCO; FONSECA, LARISSA FERNANDA SIMIELLI; VENTURA, RICARDO VIEIRA; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Whole-genome sequencing provides new insights into genetic mechanisms of tropical adaptation in Nellore (Bos primigenius indicus). SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1 JUN 10 2020. Citações Web of Science: 2.
CARVALHEIRO, ROBERTO; COSTILLA, ROY; NEVES, HAROLDO H. R.; ALBUQUERQUE, LUCIA G.; MOORE, STEPHEN; HAYES, BEN J. Unraveling genetic sensitivity of beef cattle to environmental variation under tropical conditions. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 51, JUN 20 2019. Citações Web of Science: 0.
NEVES, HAROLDO H. R.; VARGAS, GIOVANA; BRITO, LUIZ F.; SCHENKEL, FLAVIO S.; ALBUQUERQUE, LUCIA G.; CARVALHEIRO, ROBERTO. Genetic and genomic analyses of testicular hypoplasia in Nellore cattle. PLoS One, v. 14, n. 1 JAN 24 2019. Citações Web of Science: 0.

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