INTEGRAÇÃO DE ANÁLISES CROMOSSÔMICAS E GENÔMICAS PARA O ESTUDO EVOLUTIVO E FUNCIONAL DE DNAS SATÉLITES EM Astyanax (TELEOSTEI, CHARACIFORMES)

• Processo: 18/03365-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Fábio Porto-Foresti
• Beneficiário: Fábio Porto-Foresti
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Duílio Mazzoni Zerbinato de Andrade Silva ; Fausto Foresti ; Ricardo Utsunomia ; Sandro Natal Daniel
• Assunto(s): Cromossomos B Astyanax Genética de peixes
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Astyanax | Cromossomos B | DNAs satélites | Satelitoma | Genética de Peixes

Resumo

O genoma dos organismos eucariotos estão repletos de sequências de DNA repetitivos. Dentre eles, os DNAs satélites (satDNAs) constituem sequências únicas repetidas em tandem várias vezes. Por muito tempo os satDNA foram considerados como DNA lixo; no entanto, a transcrição deste tipo de sequência em diferentes organismos aponta para possíveis funções estabelecidas. Historicamente, técnicas distintas foram utilizadas para a caracterização de satDNAs, mas apenas com o advento de tecnologias de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) e ferramentas bioinformáticas, foi possível realizar estudos que permitiram a caracterização de coleções inteiras de satDNAs (satelitomas) nos mais diversos organismos a um custo relativamente baixo. Recentemente, o primeiro satelitoma de peixes foi divulgado para a espécie Astyanax paranae e revelou uma quantidade significativa deste tipo de sequência no genoma deste organismo, incluindo várias famílias alocadas exclusivamente no cromossomo B desta espécie. Estes dados geraram novos questionamentos sobre este tipo de sequência, os quais pretende-se investigar com o presente projeto. Assim, os objetivos deste estudo envolvem o aprofundamento do conhecimento estrutural de DNAs satélites em A. paranae utilizando reads longos; uma investigação inicial sobre a funcionalidade destes satDNAs nesta espécie; e a melhor compreensão sobre a manutenção da biblioteca de DNAs satélites em Characidae e sua expansão/retração diferencial em espécies distintas. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CALEGARI, RODRIGO MILAN; MIRA RODRIGUES, PEDRO HENRIQUE; DOS SANTOS, RODRIGO ZENI; FORESTI, FAUSTO; UTSUNOMIA, RICARDO; PORTO-FORESTI, FABIO. The complete mitochondrial genome sequences of five Otophysi species (Vertebrata, Teleostei). MITOCHONDRIAL DNA PART B-RESOURCES, v. 4, n. 2, p. 4198-4199, JUL 3 2019. (18/03365-3)

STORNIOLI, JOSE HENRIQUE FORTE; GOES, CAIO AUGUSTO GOMES; CALEGARI, RODRIGO MILAN; DOS SANTOS, RODRIGO ZENI; GIGLIO, LEONARDO MOURA; FORESTI, FAUSTO; OLIVEIRA, CLAUDIO; PENITENTE, MANOLO; PORTO-FORESTI, FABIO; UTSUNOMIA, RICARDO. The B Chromosomes of Prochilodus lineatus (Teleostei, Characiformes) Are Highly Enriched in Satellite DNAs. CELLS, v. 10, n. 6, JUN 2021. (18/03365-3)