Caracterização genômica e funcional de potenciais lncRNAs restritos a melanoma (RMELs)

• Processo: 18/04017-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2018 - 31 de outubro de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Enilza Maria Espreafico
• Beneficiário: Enilza Maria Espreafico
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Transformação celular neoplásica Neoplasias Melanoma RNA longo não codificante Técnicas de silenciamento de genes Superexpressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Braf | câncer | lncRNAs | Mapk | melanoma | Mitf | RMELs | Biologia Molecular e Genômica do Câncer

Resumo

Os genes RMELs, primeiramente descritos pelo nosso grupo em 2010, são potenciais lncRNAs com expressão restrita a melanoma. Alta expressão dos RMELs 2, 3 e 4 (HCCAT5) se associa à BRAFV600E, a principal mutação condutora de tumorigênese em melanoma. Pesquisas em andamento em nosso laboratório indicam que o gene RMEL3 é um alvo das vias de MAPK e PI3K e o transcrito, por sua vez, parece fazer parte de um circuito de retroalimentação positiva dessas vias. Abordagens usando silenciamento e superexpressão indicaram que os quatro lncRNAs, objetos desse estudo, de maneiras e intensidades diferentes, promovem sobrevivência e proliferação de células de melanoma. Análises integradas de genômica e proteômica mostram que o silenciamento dos RMELs em células de melanoma afeta vias centrais relacionadas a proliferação/sobrevivência e resistência terapêutica aos inibidores de BRAF/MEK e imunoterapia. RMEL2 (OVAAL) é superexpresso em um menor número de casos de melanoma e linhagens celulares do que os outros RMELs e, embora o silenciamento de RMEL2 não afete a proliferação em condições normais de adesão, leva a uma redução significativa na capacidade de crescimento independente de ancoragem e mostra indícios de uma relação com resistência do melanoma ao tratamento com terapias alvo-dirigidas (BRAFi/MEKi). O RMEL1 apresenta correlação positiva de expressão com MITF e o programa de diferenciação melanocítica e o RMEL4 parece correlacionar-se com uma assinatura molecular de tumores não responsivos à imunoterapia, sendo que seu silenciamento inverte a assinatura em direção à responsiva. Encorajados por esses resultados, propomos aqui caracterizar esses lncRNAs quanto à estrutura, isoformas, interações moleculares, localização subcelular, capacidade de codificar polipeptídeos e bifuncionalidade. Interações com microRNAs e proteínas serão investigadas através de ensaios usando Luciferase como repórter e pulldown, respectivamente. Estudos funcionais utilizando metodologias de superexpressão e silenciamento (ou knockout por CRISPr) serão conduzidos in vitro e em modelo de tumorigênese em camundongos, visando explorar as funções desses lncRNAs e aplicabilidade em diferentes contextos biológicos e combinações de terapias alvo-dirigidas ou imunoterapia. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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ARAUJO, L. F.; SIENA, A. D. D.; PLACA, J. R.; BROTTO, D. B.; BARROS, I. I.; MUYS, B. R.; BIAGI JR, C. A. O.; PERONNI, K. C.; SOUSA, J. F.; MOLFETTA, G. A.; et al. Mitochondrial transcription factor A (TFAM) shapes metabolic and invasion gene signatures in melanoma. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, SEP 21 2018. (18/04017-9, 13/08135-2, 09/53853-5, 15/21940-7, 13/25119-0)

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