Bioquímica inorgânica computacional & computação de alta-performance

• Processo: 18/08311-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Acordo de Cooperação: Tianjin University
• Proposta de Mobilidade: SPRINT - Projetos de pesquisa - Mobilidade
• Pesquisador responsável: Guilherme Menegon Arantes
• Beneficiário: Guilherme Menegon Arantes
• Pesquisador Responsável no exterior: Peter Robert Taylor
• Instituição Parceira no exterior: Tianjin University (TJU), China
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/24096-5 - Simulação computacional de metaloenzimas e de proteínas flexíveis, AP.R
• Assunto(s): Computação de alto desempenho Química bioinorgânica Física molecular Química quântica Compostos de coordenação Metaloproteínas Estrutura eletrônica Simulação por computador
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cálculo de Estrutura Eletrônica | Complexos metálicos polinucleares | Física Molecular | Metaloproteínas | Química Quântica | Supercomputação | Simulação computacional

Resumo

Nós buscamos financiamento para ajudar na proposição e no estabelecimento de uma longa colaboração tanto em bioquímica inorgânica computacional e computação de alto-desempenho, e suas aplicações para ciência computacional. Os autores já colaboraram no passado no primeiro tópico, incuindo uma publicação em revista indexada de alta qualidade. As atividades atuais e os planos futuros da Plataforma de Ciências da Vida na Universidade de Tianjin e o interesse da Universidade de São Paulo em expandir sua infraestrutura em supercomputação permitem uma excelente base para colaboração e atividades conjuntas no segundo tópico. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

YUAN, GUODONG; CURTOLO, FELIPE; DENG, YIBING; WU, TAO; TIAN, FANG; MA, QUN; LIU, YUTONG; ZUO, JINGLIN; ARANTES, GUILHERME MENEGON; ZHENG, PENG. Highly Dynamic Polynuclear Metal Cluster Revealed in a Single Metallothionein Molecule. RESEARCH, v. 2021, JUL 14 2021. (17/26109-0, 19/21856-7, 18/08311-9)

TEIXEIRA, MURILO H.; CURTOLO, FELIPE; CAMILO, SOFIA R. G.; FIELD, MARTIN J.; ZHENG, PENG; LI, HONGBIN; ARANTES, GUILHERME M.. Modeling the Hydrolysis of Iron-Sulfur Clusters. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 60, n. 2, p. 653-660, FEB 2020. (16/24096-5, 18/08311-9)

REIS, ANDRE A. O.; SAYEGH, RAPHAEL S. R.; MARANA, SANDRO R.; ARANTES, GUILHERME M.. Combining Free Energy Simulations and NMR Chemical-Shift Perturbation To Identify Transient Cation-pi Contacts in Proteins. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 60, n. 2, p. 890-897, FEB 2020. (18/25952-8, 16/22365-9, 16/24096-5, 12/00543-1, 18/08311-9)