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Compêndio abrangente de fatores de transcrição bovinos curado manualmente

Processo: 18/18262-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de outubro de 2018 - 31 de março de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Luciana Correia de Almeida Regitano
Beneficiário:Luciana Correia de Almeida Regitano
Instituição-sede: Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional  Banco de dados  Expressão gênica  Bovinos  Fatores de transcrição 

Resumo

Fatores de transcrição (FTs) são proteínas reguladoras que controlam a expressão gênica de forma dependente do contexto e específica ao tecido. Em contraste com humanos, para o qual existem abrangentes coleções de FTs, os FTs bovinos foram apenas compilados de forma rudimentar. Nesse artigo, apresentamos um compêndio curado manualmente de 865 FTs bovinos ligantes de DNA de maneira específica a sequencia, para os quais nós analisamos a distribuição das famílias de domínios, conservação evolutiva e expressão tecido-específica. Além disso, fornecemos uma lista de prováveis cofatores de transcrição derivados de interações já conhecidas com os FTs identificados. Como existe escassez generalizada de conhecimento sobre a regulação da expressão gênica em bovinos, a lista curada de FTs deve prover uma base para melhor compreensão dos mecanismos regulatórios específicos da espécie. (AU)