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Estudos sobre comparação de genomas

Processo: 18/00031-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de dezembro de 2018 - 28 de fevereiro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Teoria da Computação
Pesquisador responsável:João Meidanis
Beneficiário:João Meidanis
Instituição-sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):20/00975-5 - Aplicações da Teoria Matricial de Rearranjos de Genomas, BP.TT
Assunto(s):Biologia computacional 

Resumo

Este projeto busca avançar a teoria matricial de rearranjo de genomas,introduzida por Meidanis, Zanetti e Biller, aplicando-a a casos práticosde comparação de genomas de micróbios, fungos, plantas e mamíferos,através de colaborações com biocientistas. Os principais problemas aatacar aqui giram em torno da construção de filogenias usando rearranjos,e a inferência dos genomas ancestrais nos nós internos destas filogenias.Ao mesmo tempo, é objetivodo projeto refinar os métodos do ponto de vista matemático e computacional,aperfeiçoando os algoritmos que os implementam, e complementando-oscom ferramentas de suporte para facilitar seu uso na prática. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Treinamento técnico em Bioinformática com bolsa da FAPESP 
Treinamento técnico em Bioinformática com bolsa da FAPESP