Genotipagem molecular, estudos de diversidade e marcadores moleculares de alta resolução revelados por microssatélites em Giardia duodenalis

• Processo: 19/01993-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
• Vigência: 01 de março de 2019 - 31 de agosto de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Anete Pereira de Souza
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética populacional Biologia computacional Giardia Marcador molecular Repetições de microssatélites Diversidade genética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Diversidade Genética | Giardia | marcadores moleculares | Microssatélites | Genética Populacional

Resumo

Giardia duodenalis é um parasita protozoário que causa giardíase, uma doença que afeta milhões de pessoas em todo o mundo e uma ampla gama de hospedeiros mamíferos. G. duodenalis apresenta considerável variabilidade genética e há uma demanda crescente para o desenvolvimento de novos marcadores moleculares. Este estudo teve como objetivo identificar e caracterizar microssatélites genômicos de Giardia com base nos diferentes genomas disponíveis. Depois de realizar uma análise usando o software MISA e SciRoKo, 1.853 repetições de sequência simples (SSRs) foram identificadas e muitas delas foram anotadas como proteínas de superfície específicas de variantes. Detectamos 20 SSRs polimórficos, incluindo um compartilhado entre todos os genomas disponíveis. Como os marcadores são baseados em uma PCR simples, eles têm um grande potencial para uso em futuros estudos de Giardia por meio de PCR, sequenciamento genético ou genotipagem por PCR em tempo real. (AU)