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Análise molecular de Salmonella typhi clonalmente relacionadas provenientes de casos de febre tifóide não relacionados epidemiologicamente no Brasil

Processo: 19/02534-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de março de 2019 - 31 de agosto de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Monique Ribeiro Tiba Casas
Beneficiário:Monique Ribeiro Tiba Casas
Instituição-sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Bacteriologia  Febre tifoide  Salmonella  Resistência microbiana a medicamentos 

Resumo

O método ouro para a subtipagem molecular da identificação e investigação de surtos alimentares é a eletroforese em gel de campo pulsado. Porém, está técnica não permite a discriminação entre amostras não relacionadas em determinados sorotipos, o que pode ser alcançado pelo sequenciamento de genoma completo. O objetivo deste estudo foi determinar os pontos fortes e desvantagens de WGS usando diferentes abordagens analíticas em comparação com o método de tipagem tradicional, PFGE, para a tipagem retrospectiva de 28 aglomerados de casos de S. Typhi. Foram avaliadas três abordagens analíticas no conjunto de dados WGS (Nucleotide Difference (ND), (SNPs) e Whole genome multi locus sequence typing (wgMLST), que classificou as cepas relacionadas aos casos em dois aglomerados, cluster A (com cepas de 2017 ) e Cluster B (com cepas de 2007).Neste estudo, a tipagem baseada em WGS, foi capaz de competir com PFGE para diferenciação os aglomerados de casos dos casos esporádicos de S. Typhi. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TIBA-CASAS, MONIQUE RIBEIRO; SACCHI, CLAUDIO TAVARES; GONCALVES, CLAUDIA REGINA; ALMEIDA, ELISABETE APARECIDA; SOARES, FLAVIA BARROSA; DE JESUS BERTANI, AMANDA MARIA; FERNANDES, SUELI APARECIDA; DE PAULA EDUARDO, MARIA BERNADETE; CAMARGO, CARLOS HENRIQUE. Molecular analysis of clonally related Salmonella Typhi recovered from epidemiologically unrelated cases of typhoid fever, Brazil. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 81, p. 191-195, APR 2019. Citações Web of Science: 0.

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