Uma abordagem intercontinental para a investigação da evolução cromossômica, diversidade genética e biogeografia na ordem Osteoglossiformes (Teleostei: Osteoglossomorpha). Parte III.

• Processo: 18/22033-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de março de 2019 - 28 de fevereiro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Marcelo de Bello Cioffi
• Beneficiário: Marcelo de Bello Cioffi
• Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Carlos Congrains Castillo ; Eliana Feldberg ; Luiz Antonio Carlos Bertollo ; Manolo Fernandez Perez ; Orlando Moreira Filho ; Terumi Hatanaka
• Auxílios(s) vinculado(s): 19/04877-0 - Citogenômica evolutiva, diversidade genética e biogeografia de peixes Aruanãs (Teleostei: Osteoglossiformes), AP.R SPRINT
• Bolsa(s) vinculada(s): 19/06439-0 - Plano de Trabalho para Bolsa TT3 junto ao Laboratório de Citogenética de Peixes, BP.TT
• Assunto(s): Hibridização genômica comparativa Peixes Biogeografia Evolução cariotípica Citogenética
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biogeografia | Citogenética de Peixes | evolução cariotípica | Hibridização genômica comparativa | Peixes | Citogenética Animal

Resumo

O presente projeto dará continuidade ao projeto anterior (FAPESP- 2016/22196-2), enfocando na evolução cromossômica, diversidade genética e filogeografia de espécies de Osteoglossiformes representativas de distintas regiões intercontinentais, contando com uma rede de colaboradores internacionais igualmente interessados nesta promissora abordagem. Será utilizado o sequenciamento de nova geração de regiões associadas a Elementos Ultra Conservados (EUCs) e de marcadores DArT-Seq (Diversity Array Technology Sequencing), em uma ampla amostragem de representantes de todas as famílias da ordem. Buscar-se-á inferir sobre a diversificação de espécies próximas, atualmente presentes em continentes diferentes, tendo em vista o processo de fragmentação dos mesmos e a ocorrência de dispersões marinhas de ancestrais atualmente extintos. Neste contexto destacam-se, particularmente, as espécies de aruanãs (Osteoglossidae), por apresentarem investigações ainda totalmente a descoberto, onde serão enfocadas análises cromossômicas e genômicas comparativas em todas as espécies presentes na América do Sul, Ásia e Austrália, com foco nos processos de evolução cariotípica e reconstrução de modelos biogeográficos que possam esclarecer a atual distribuição geográfica desse grupo. Além disso, a história filogeográfica de uma das espécies mais conhecidas e representativas dos Osteoglossiformes, o pirarucu (Arapaima gigas) será investigada a partir do desenvolvimento de modelos evolutivos, que serão testados com metodologias recentes de análise filogeográfica. Aliada a este projeto encontra-se uma equipe integrada de 06 grupos de pesquisa, representativa de todos os 05 continentes, somando esforços para a viabilização e execução dos objetivos que estão sendo propostos. A presente proposta propiciará avanços significativos para o entendimento de evolução cromossômica, organização e diversificação genômica e biodiversidade dos Osteoglossiformes, uma das ordens mais basais dentre os peixes e amplamente distribuída por diversos continentes do velho e do novo mundo. (AU)

Publicações científicas

(25)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

TOMA, GUSTAVO AKIRA; ROSA DE MORAES, RENATA LUIZA; CAVALCANTE SASSI, FRANCISCO DE MENEZES; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; RAB, PETR; SEMBER, ALEXANDR; LIEHR, THOMAS; HATANAKA, TERUMI; VIANA, PATRIK FERREIRA; et al. Cytogenetics of the small-sized fish, Copeina guttata (Characiformes, Lebiasinidae): Novel insights into the karyotype differentiation of the family. PLoS One, v. 14, n. 12, DEC 19 2019. (18/22033-1, 18/24235-0, 17/09321-5)

SASSI, FRANCISCO DE M. C.; HATANAKA, TERUMI; DE MORAE, RENATA LUIZA R.; TOMA, GUSTAVO A.; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL A.; LIEHR, THOMAS; RAB, PETR; BERTOLLO, LUIZ A. C.; VIANA, PATRIK F.; FELDBERG, ELIANA; et al. An Insight into the Chromosomal Evolution of Lebiasinidae (Teleostei, Characiformes). GENES, v. 11, n. 4, APR 2020. (17/09321-5, 18/22033-1, 18/24235-0)

SPANGENBERG, VICTOR; ARAKELYAN, MARINE; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; LIEHR, THOMAS; AL-RIKABI, AHMED; MARTYNOVA, ELENA; DANIELYAN, FELIX; STEPANYAN, ILONA; GALOYAN, EDUARD; KOLOMIETS, OXANA. Cytogenetic mechanisms of unisexuality in rock lizards. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, MAY 26 2020. (18/22033-1)

CAVALCANTE SASSI, FRANCISCO DE MENEZES; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; NIRCHIO, MAURO; HATANAKA, TERUMI; FERREIRA MARINHO, MANOELA MARIA; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; AROUTIOUNIAN, ROUBEN; LIEHR, THOMAS; AL-RIKABI, AHMED B. H.; et al. Chromosomal Evolution and Evolutionary Relationships of Lebiasina Species (Characiformes, Lebiasinidae). INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 12, JUN 2 2019. (17/09321-5, 18/22033-1, 18/24235-0)

SEMBER, ALEXANDR; PELIKANOVA, SARKA; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; SLECHTOVA, VENDULA; HATANAKA, TERUMI; DOAN, HIEP DO; KNYTL, MARTIN; RAB, PETR. Taxonomic Diversity Not Associated with Gross Karyotype Differentiation: The Case of Bighead Carps, GenusHypophthalmichthys(Teleostei, Cypriniformes, Xenocyprididae). GENES, v. 11, n. 5, MAY 2020. (18/22033-1)

SANTOS DE SOUZA, FERNANDO HENRIQUE; PEREZ, MANOLO FERNANDEZ; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; LAVOUE, SEBASTIEN; GESTICH, CARLA CRISTINA; RAB, PETR; EZAZ, TARIQ; LIEHR, THOMAS; VIANA, PATRIK FERREIRA; et al. Interspecific Genetic Differences and Historical Demography in South American Arowanas (Osteoglossiformes, Osteoglossidae, Osteoglossum). GENES, v. 10, n. 9, SEP 2019. (18/22033-1, 17/10240-0)

WERNECK FELIX DA COSTA, GIDEAO WAGNER; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; LIEHR, THOMAS; FELDBERG, ELIANA; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; MOLINA, WAGNER FRANCO. Extensive Chromosomal Reorganization in Apistogramma Fishes (Cichlidae, Cichlinae) Fits the Complex Evolutionary Diversification of the Genus. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 17, SEP 1 2019. (18/22033-1)

AL-RIKABI, AHMED B. HAMID; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; LIEHR, THOMAS. Chromosome Microdissection on Semi-Archived Material. Cytometry Part A, v. 95, n. 12, p. 1285-1288, DEC 2019. (18/22033-1, 17/10240-0)

XU, DONGDONG; SEMBER, ALEXANDR; ZHU, QIHUI; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; LIEHR, THOMAS; AL-RIKABI, AHMED B. H.; XIAO, ZHIZHONG; SONG, HONGBIN; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Deciphering the Origin and Evolution of the X1X2Y System in Two Closely-Related Oplegnathus Species (Oplegnathidae and Centrarchiformes). INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 14, JUL 2 2019. (18/22033-1)

SEMBER, ALEXANDR; NGUYEN, PETR; PEREZ, MANOLO F.; ALTMANOVA, MARIE; RAB, PETR; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Multiple sex chromosomes in teleost fishes from a cytogenetic perspective: state of the art and future challenges. PHILOSOPHICAL TRANSACTIONS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, v. 376, n. 1833, SEP 13 2021. (17/10240-0, 18/22033-1)

EZEQUIEL A. DE OLIVEIRA; FRANCISCO DE M. C. SASSI; MANOLO F. PEREZ; LUIZ A. C. BERTOLLO; PETR RÁB; TARIQ EZAZ; TERUMI HATANAKA; PATRIK F. VIANA; ELIANA FELDBERG; EDIVALDO H. C. DE OLIVEIRA; et al. Comparative cytogenetic survey of the giant bonytongue Arapaima fish (Osteoglossiformes: Arapaimidae), across different Amazonian and Tocantins/Araguaia River basins. Neotropical Ichthyology, v. 18, n. 4, 2020-11-16. (17/10240-0, 18/22033-1)

SPANGENBERG, VICTOR; KOLOMIETS, OXANA; STEPANYAN, ILONA; GALOYAN, EDUARD; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; MARTYNOVA, ELENA; MARTIROSYAN, IRENA; GRISHAEVA, TATIANA; DANIELYAN, FELIX; AL-RIKABI, AHMED; et al. Evolution of the parthenogenetic rock lizard hybrid karyotype: Robertsonian translocation between two maternal chromosomes in Darevskia rostombekowi. CHROMOSOMA, v. 129, n. 3-4, p. 275-283, DEC 2020. (18/22033-1)

DITCHAROEN, SUKHONTHIP; CAVALCANTE SASSI, FRANCISCO DE MENEZES; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; MOLINA, WAGNER FRANCO; LIEHR, THOMAS; SAENJUNDAENG, PASAKORN; TANOMTONG, ALONGKLOD; SUPIWONG, WEERAYUTH; SUWANNAPOOM, CHATMONGKON; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Comparative chromosomal mapping of microsatellite repeats reveals divergent patterns of accumulation in 12 Siluridae (Teleostei: Siluriformes) species. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 4, 2020. (18/22033-1)

PASAKORN SAENJUNDAENG; WEERAYUTH SUPIWONG; FRANCISCO M. C. SASSI; LUIZ A. C. BERTOLLO; PETR RAB; RAFAEL KRETSCHMER; ALONGKLOD TANOMTONG; CHATMONGKON SUWANNAPOOM; MONTRI REUNGSING; MARCELO DE BELLO CIOFFI. Chromosomes of Asian cyprinid fishes: Variable karyotype patterns and evolutionary trends in the genus Osteochilus (Cyprinidae, Labeoninae, “Osteochilini”). GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 4, 2020-11-06. (18/22033-1)

OLIVEIRA, E. A.; PEREZ, M. F.; BERTOLLO, L. A. C.; GESTICH, C. C.; RAB, P.; EZAZ, T.; SOUZA, F. H. S.; VIANA, P.; FELDBERG, E.; OLIVEIRA, E. H. C.; et al. Historical demography and climate driven distributional changes in a widespread Neotropical freshwater species with high economic importance. ECOGRAPHY, v. 43, n. 9, JUN 2020. (18/22033-1, 17/10240-0)

CIOFFI, MARCELO DE BELLO; RAB, PETR; EZAZ, TARIQ; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; LAVOUE, SEBASTIEN; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; SEMBER, ALEXANDR; MOLINA, WAGNER FRANCO; SANTOS DE SOUZA, FERNANDO HENRIQUE; MAJTANOVA, ZUZANA; et al. Deciphering the Evolutionary History of Arowana Fishes (Teleostei, Osteoglossiformes, Osteoglossidae): Insight from Comparative Cytogenomics. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 17, SEP 1 2019. (18/22033-1, 17/10240-0)

HAMID AL-RIKABI, AHMED B.; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; LIEHR, THOMAS. Chromosome Microdissection on Semi-Archived Material. Cytometry Part A, SEP 2019. (18/22033-1, 17/10240-0)

DITCHAROEN, SUKHONTHIP; CARLOS BERTOLLO, LUIZ ANTONIO; RAB, PETR; HNATKOVA, EVA; MOLINA, WAGNER FRANCO; LIEHR, THOMAS; TANOMTONG, ALONGKLOD; TRIANTAPHYLLIDIS, COSTAS; OZOUF-COSTAZ, CATHERINE; TONGNUNUI, SAMPAN; et al. Genomic Organization of Repetitive DNA Elements and Extensive Karyotype Diversity of Silurid Catfishes (Teleostei: Siluriformes): A Comparative Cytogenetic Approach. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 20, n. 14, JUL 2 2019. (18/22033-1)

YANO, CASSIA F.; MERLO, MANUEL A.; PORTELA-BENS, SILVIA; CIOFFI, MARCELO DE B.; BERTOLLO, LUIZ A. C.; SANTOS-JUNIOR, CELIO D.; REBORDINOS, LAUREANA. Evolutionary Dynamics of Multigene Families in Triportheus (Characiformes, Triportheidae): A Transposon Mediated Mechanism?. FRONTIERS IN MARINE SCIENCE, v. 7, JAN 24 2020. (18/22033-1)

SAENJUNDAENG, PASAKORN; SUPIWONG, WEERAYUTH; SASSI, FRANCISCO M. C.; BERTOLLO, LUIZ A. C.; RAB, PETR; KRETSCHMER, RAFAEL; TANOMTONG, ALONGKLOD; SUWANNAPOOM, CHATMONGKON; REUNGSING, MONTRI; CIOFFI, MARCELO DE BELLO. Chromosomes of Asian cyprinid fishes: Variable karyotype patterns and evolutionary trends in the genus Osteochilus (Cyprinidae, Labeoninae, ``Osteochilini{''}). GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 4, 2020. (18/22033-1)

DEON, GEIZE APARECIDA; GLUGOSKI, LARISSA; VICARI, MARCELO RICARDO; NOGAROTO, VIVIANE; SASSI, FRANCISCO DE MENEZES CAVALCANTE; CIOFFI, MARCELO DE BELLO; LIEHR, THOMAS; BERTOLLO, LUIZ ANTONIO CARLOS; MOREIRA-FILHO, ORLANDO. Highly Rearranged Karyotypes and Multiple Sex Chromosome Systems in Armored Catfishes from the Genus Harttia (Teleostei, Siluriformes). GENES, v. 11, n. 11, NOV 2020. (18/22033-1, 20/02681-9)

SASSI, FRANCISCO DE M. C.; DEON, GEIZE A.; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; VICARI, MARCELO R.; BERTOLLO, LUIZ A. C.; LIEHR, THOMAS; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL AGUIAR; CIOFFI, MARCELO B.. Multiple Sex Chromosomes and Evolutionary Relationships in Amazonian Catfishes: The Outstanding Model of the Genus Harttia (Siluriformes: Loricariidae). GENES, v. 11, n. 10, OCT 2020. (18/22033-1, 20/02681-9)

DE M. C. SASSI, FRANCISCO; PEREZ, MANOLO F.; OLIVEIRA, VANESSA CRISTINA S.; DEON, GEIZE A.; DE SOUZA, FERNANDO H. S.; FERREIRA, PEDRO H. N.; DE OLIVEIRA, EZEQUIEL A.; HATANAKA, TERUMI; LIEHR, THOMAS; BERTOLLO, LUIZ A. C.; et al. High Genetic Diversity despite Conserved Karyotype Organization in the Giant Trahiras from Genus Hoplias (Characiformes, Erythrinidae). GENES, v. 12, n. 2, FEB 2021. (18/24235-0, 18/22033-1, 20/02681-9)

OLIVEIRA, VANESSA C. S.; ALTMANOVA, MARIE; VIANA, PATRIK F.; EZAZ, TARIQ; BERTOLLO, LUIZ A. C.; RAB, PETR; LIEHR, THOMAS; AL-RIKABI, AHMED; FELDBERG, ELIANA; HATANAKA, TERUMI; et al. Revisiting the Karyotypes of Alligators and Caimans (Crocodylia, Alligatoridae) after a Half-Century Delay: Bridging the Gap in the Chromosomal Evolution of Reptiles. CELLS, v. 10, n. 6, JUN 2021. (18/22033-1)

SPANGENBERG, VICTOR; ARAKELYAN, MARINE; GALOYAN, EDUARD; MARTIROSYAN, IRENA; BOGOMAZOVA, ALEXANDRA; MARTYNOVA, ELENA; DE BELLO CIOFFI, MARCELO; LIEHR, THOMAS; AL-RIKABI, AHMED; OSIPOV, FEDOR; et al. Meiotic synapsis of homeologous chromosomes and mismatch repair protein detection in the parthenogenetic rock lizard Darevskia unisexualis. Molecular Reproduction and Development, v. 88, n. 2, JAN 2021. (18/22033-1)