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Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE)

Processo: 18/14389-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de abril de 2019 - 31 de março de 2022
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
Pesquisador responsável:Ester Cerdeira Sabino
Beneficiário:Ester Cerdeira Sabino
Pesq. responsável no exterior: Nuno Miguel Rodrigues Pascoal Faria
Instituição no exterior: University of Oxford, Inglaterra
Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Adriano Pinter dos Santos ; Anna Sara Shafferman Levin ; Maria Anice Mureb Sallum ; Renato Pereira de Souza ; Vivian Helena Iida Avelino da Silva
Pesq. associados:Licia Natal Fernandes ; Marcelo Urbano Ferreira ; Maurício Lacerda Nogueira
Auxílios(s) vinculado(s):20/04884-4 - Estudo da prevalência do coronavírus COVID-19 na população de doadores de sangue e avaliação dos soropositivos para a produção de soro hiperimune, AP.R
Bolsa(s) vinculada(s):20/04272-9 - Genética viral para identificação de arbovírus no estado de São Paulo, BP.TT
20/02280-4 - Metagenômica viral para identificação de vírus em mosquitos no estado de São Paulo, BP.TT
19/21706-5 - Metagenômica viral de mosquitos capturados no Estado de São Paulo, BP.DD
+ mais bolsas vinculadas 19/21568-1 - Identificação de Febre Amarela e Chikungunya em mosquitos capturados no estado de São Paulo, BP.IC
19/21301-5 - Identificação de Flavivirus e Alphavirus em mosquitos (Diptera: Culicidae) coletados na cidade de São Paulo, BP.IC
19/12988-7 - Identificação de espécies de mosquitos, farinha de sangue e detecção de vírus usando a tecnologia da Oxford Nanopore technologies (MinION) em um cenário de transmissão de YF, BP.PD
19/12000-1 - Modelagem da dispersão espaço-temporal de arbovírus emergentes usando fontes de dados heterogêneas no Estado de São Paulo, BP.PD
19/07544-2 - Coletas de campo de mosquito e identificação de código de barras COI usando a tecnologia MinION, BP.TT
19/07982-0 - Aspectos da emergência da febre amarela na Serra da Cantareira, Região Metropolitana de São Paulo - Brasil, BP.TT
17/00021-9 - Metagenômica viral da Dengue, Chikungunya e Zika: Acompanhar, explicar e prever a transmissão e distribuição espaço-temporal no Brasil, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Saúde pública  Epidemiologia  Genômica  Prevalência  Diagnóstico clínico  Vírus  Arbovirus  Vírus Zika  Febre de Chikungunya  Dengue  Febre amarela 

Resumo

Recentemente, o Brasil tem sido afetado por epidemias de arbovírus inesperadas de vírus Zika, Chikungunya, dengue e febre amarela. O enorme ônus econômico do Zika (R $ 1 bilhão) e a presença generalizada de vetores de mosquitos no Brasil destacam a necessidade de previsões precisas da disseminação de doenças, particularmente em regiões grandes e densamente povoadas. Esta Parceria Reino Unido-Brasil irá melhorar e expandir uma excelente colaboração existente, com o objetivo de antecipar e prevenir futuras epidemias de arbovírus no Brasil. Nossas questões de pesquisa incluem: 1) Quais arboviros circulam em humanos, mosquitos e populações de reservatórios no Brasil? 2) Onde e como os arbovírus persistem durante períodos não epidêmicos? 3) Quais são as implicações da diversidade genética dos arbovírus circulantes? 4) Que fatores convertem uma nova introdução em populações humanas em uma epidemia e qual a melhor forma de responder? A vigilância ativa em vetores e reservatórios será combinada com pesquisas de soroprevalência em doadores de sangue para caracterizar a dinâmica arboviral, a genômica, a transmissão e a imunidade. Novos protocolos de sequenciamento de genoma portátil e análises epidemiológicas em tempo real serão realizados para arbovírus relevantes. A unificação das informações em genômica e epidemiologia fortalecerá a base de evidências para ações de saúde pública e fortalecerá a capacidade do sistema de saúde brasileiro em resposta a doenças arbovirais emergentes. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Pesquisadores reconstituem epidemia de febre amarela em São Paulo por meio de técnicas genômicas 
Além de danos nas articulações, chikungunya pode afetar sistema nervoso central 
São Caetano do Sul investe na atenção primária para enfrentar a pandemia 
COVID-19 já tinha se disseminado pelo Brasil quando medidas de contenção foram adotadas 
Média de idade dos primeiros afetados pela COVID-19 no Brasil é menor do que em outros países  
Pesquisadores se unem em força-tarefa para combate ao coronavírus 
54,8% dos casos importados de COVID-19 para o Brasil até 5 de março vieram da Itália 
Novo coronavírus acelera produção e difusão científica 
Sequenciamento identifica genomas diferentes nos dois casos brasileiros de coronavírus 
Tecnologia que sequenciou coronavírus em 48 horas permitirá monitorar epidemia em tempo real 
Pós-doutorado em doenças infecciosas e entomologia com bolsa da FAPESP 
Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio::
Coronavírus avança no Brasil 
Novo coronavírus acelera produção e difusão científica 

Publicações científicas (9)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; MANULI, ERIKA R.; THEZE, JULIEN; ALMEIDA, LUIZ; MENEZES, MARIANE T.; VOLOCH, CAROLINA M.; FUMAGALLI, MARCILIO J.; COLETTI, THAIS M.; SILVA, CAMILA A. M.; RAMUNDO, MARIANA S.; AMORIM, MARIENE R.; HOELTGEBAUM, HENRIQUE H.; MISHRA, SWAPNIL; GILL, MANDEV S.; CARVALHO, LUIZ M.; BUSS, LEWIS F.; PRETE JR, CARLOS A.; ASHWORTH, JORDAN; NAKAYA, I, HELDER; PEIXOTO, PEDRO S.; BRADY, OLIVER J.; NICHOLLS, SAMUEL M.; TANURI, AMILCAR; ROSSI, ATILA D.; BRAGA, V, CARLOS K.; GERBER, ALEXANDRA L.; GUIMARAES, ANA PAULA DE C.; GABURO JR, NELSON; ALENCAR, CECILA SALETE; FERREIRA, ALESSANDRO C. S.; LIMA, CRISTIANO X.; LEVI, JOSE EDUARDO; GRANATO, CELSO; FERREIRA, GIULIA M.; FRANCISCO JR, RONALDO S.; GRANJA, FABIANA; GARCIA, MARCIA T.; MORETTI, MARIA LUIZA; PERROUD JR, MAURICIO W.; CASTINEIRAS, TEREZINHA M. P. P.; LAZARI, CAROLINA S.; HILL, SARAH C.; DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; SIMEONI, CAMILA L.; FORATO, JULIA; SPOSITO, ANDREI C.; SCHREIBER, ANGELICA Z.; SANTOS, MAGNUN N. N.; DE SA, CAMILA ZOLINI; SOUZA, RENAN P.; RESENDE-MOREIRA, LUCIANA C.; TEIXEIRA, MAURO M.; HUBNER, JOSY; LEME, PATRICIA A. F.; MOREIRA, RENNAN G.; NOGUEIRA, MAURICIO L.; FERGUSON, NEIL M.; COSTA, SILVIA F.; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R.; BHATT, SAMIR; LEMEY, PHILIPPE; WU, CHIEH-HSI; RAMBAUT, ANDREW; LOMAN, NICK J.; AGUIAR, RENATO S.; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES; DISCOVERY, BRAZIL-UK CTR ARBOVIRUS. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. Citações Web of Science: 1.
HILL, SARAH C.; DE SOUZA, RENATO; THEZE, JULIEN; CLARO, INGRA; AGUIAR, RENATO S.; ABADE, LEANDRO; SANTOS, FABIANA C. P.; CUNHA, MARIANA S.; NOGUEIRA, JULIANA S.; SALLES, FLAVIA C. S.; ROCCO, IRAY M.; MAEDA, ADRIANA Y.; VASAMI, FERNANDA G. S.; DU PLESSIS, LOUIS; SILVEIRA, PAOLA P.; DE JESUS, JAQUELINE G.; QUICK, JOSHUA; FERNANDES, NATALIA C. C. A.; GUERRA, JULIANA M.; RESSIO, RODRIGO A.; GIOVANETTI, MARTA; ALCANTARA, LUIZ C. J.; CIRQUEIRA, CINTHYA S.; DIAZ-DELGADO, JOSUE; MACEDO, FERNANDO L. L.; TIMENETSKY, MARIA DO CARMO S. T.; DE PAULA, REGIANE; SPINOLA, ROBERTA; DE DEUS, JULIANA TELLES; MUCCI, LUIS F.; TUBAKI, ROSA MARIA; DE MENEZES, REGIANE M. T.; RAMOS, PATRICIA L.; DE ABREU, ANDRE L.; CRUZ, LAURA N.; LOMAN, NICK; DELLICOUR, SIMON; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO R. Genomic Surveillance of Yellow Fever Virus Epizootic in Sao Paulo, Brazil, 2016-2018. PLOS PATHOGENS, v. 16, n. 8 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.
DENG, XIANDING; GU, WEI; FEDERMAN, SCOT; DU PLESSIS, LOUIS; PYBUS, OLIVER G.; FARIA, NUNO R.; WANG, CANDACE; YU, GUIXIA; BUSHNELL, BRIAN; PAN, CHAO-YANG; GUEVARA, HUGO; SOTOMAYOR-GONZALEZ, ALICIA; ZORN, KELSEY; GOPEZ, ALLAN; SERVELLITA, VENICE; HSU, ELAINE; MILLER, STEVE; BEDFORD, TREVOR; GRENINGER, ALEXANDER L.; ROYCHOUDHURY, PAVITRA; STARITA, LEA M.; FAMULARE, MICHAEL; CHU, HELEN Y.; SHENDURE, JAY; JEROME, KEITH R.; ANDERSON, CATIE; GANGAVARAPU, KARTHIK; ZELLER, MARK; SPENCER, EMILY; ANDERSEN, KRISTIAN G.; MACCANNELL, DUNCAN; PADEN, CLINTON R.; LI, YAN; ZHANG, JING; TONG, SUXIANG; ARMSTRONG, GREGORY; MORROW, SCOTT; WILLIS, MATTHEW; MATYAS, BELA T.; MASE, SUNDARI; KASIRYE, OLIVIA; PARK, MAGGIE; MASINDE, GODFRED; CHAN, CURTIS; YU, ALEXANDER T.; CHAI, SHUA J.; VILLARINO, ELSA; BONIN, BRANDON; WADFORD, DEBRA A.; CHIU, CHARLES Y. Genomic surveillance reveals multiple introductions of SARS-CoV-2 into Northern California. Science, v. 369, n. 6503, p. 582+, JUL 31 2020. Citações Web of Science: 4.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS FLETCHER; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; CARRERA, JEAN-PAUL; LI, SABRINA; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; PEREIRA, RAFAEL HENRIQUE MORAES; PRETE, JR., CARLOS A.; DE SOUZA-SANTOS, ANDREZA ARUSKA; PARAG, KRIS V.; BELOTTI, MARIA CAROLINA T. D.; VINCENTI-GONZALEZ, MARIA F.; MESSINA, JANEY; DA SILVA SALES, FLAVIA CRISTINA; ANDRADE, PAMELA DOS SANTOS; NASCIMENTO, VITOR HELOIZ; GHILARDI, FABIO; ABADE, LEANDRO; GUTIERREZ, BERNARDO; KRAEMER, MORITZ U. G.; BRAGA, CARLOS K. V.; AGUIAR, RENATO SANTANA; ALEXANDER, NEAL; MAYAUD, PHILIPPE; BRADY, OLIVER J.; MARCILIO, IZABEL; GOUVEIA, NELSON; LI, GUANGDI; TAMI, ADRIANA; DE OLIVEIRA, SILVANO BARBOSA; PORTO, VICTOR BERTOLLO GOMES; GANEM, FABIANA; DE ALMEIDA, WALQUIRIA APARECIDA FERREIRA; FANTINATO, FRANCIELI FONTANA SUTILE TARDETTI; MACARIO, EDUARDO MARQUES; DE OLIVEIRA, WANDERSON KLEBER; NOGUEIRA, MAURICIO L.; PYBUS, OLIVER G.; WU, CHIEH-HSI; CRODA, JULIO; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES. Epidemiological and clinical characteristics of the COVID-19 epidemic in Brazil. NATURE HUMAN BEHAVIOUR, v. 4, n. 8 JUL 2020. Citações Web of Science: 0.
CUNHA, MARIANA SEQUETIN; FARIA, NUNO RODRIGUES; CALEIRO, GIOVANA SANTOS; CANDIDO, DARLAN SILVA; HILL, SARAH C.; CLARO, INGRA MORALES; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; MAEDA, ADRIANA YURIKA; DA SILVA, FERNANDA GISELE; DE SOUZA, RENATO PEREIRA; SPINOLA, ROBERTA; TUBAKI, ROSA MARIA; TIRONI DE MENEZES, REGIANE MARIA; ABADE, LEANDRO; MUCCI, LUIS FILIPE; SAMPAIO TAVARES TIMENETSKY, MARIA DO CARMO; SABINO, ESTHER. Genomic evidence of yellow fever virus in Aedes scapularis, southeastern Brazil, 2016. Acta Tropica, v. 205, MAY 2020. Citações Web of Science: 0.
REZENDE, HELDER RICAS; ROMANO, CAMILA MALTA; CLARO, INGRA MORALES; CALEIRO, GIOVANA SANTOS; SABINO, ESTER CERDEIRA; FELIX, ALVINA CLARA; BISSOLI, JEFFERSON; HILL, SARAH; FARIA, NUNO RODRIGUES; CARDOSO DA SILVA, THERESA CRISTINA; BRIOSCHI SANTOS, ANA PAULA; CERUTTI JUNIOR, CRISPIM; VICENTE, CREUZA RACHEL. First report of Aedes albopictus infected by Dengue and Zika virus in a rural outbreak in Brazil. PLoS One, v. 15, n. 3 MAR 12 2020. Citações Web of Science: 1.
GUTIERREZ, BERNARDO; WISE, EMMA L.; PULLAN, STEVEN T.; LOGUE, CHRISTOPHER H.; BOWDEN, THOMAS A.; ESCALERA-ZAMUDIO, MARINA; TRUEBA, GABRIEL; NUNES, MARCIO R. T.; FARIA, NUNO R.; PYBUS, OLIVER G. Evolutionary Dynamics of Oropouche Virus in South America. Journal of Virology, v. 94, n. 5 MAR 2020. Citações Web of Science: 0.
JAQUELINE GOES DE JESUS; CLAUDIO SACCHI; DARLAN DA SILVA CANDIDO; INGRA MORALES CLARO; FLÁVIA CRISTINA SILVA SALES; ERIKA REGINA MANULI; DANIELA BERNARDES BORGES DA SILVA; TEREZINHA MARIA DE PAIVA; MARGARETE APARECIDA BENEGA PINHO; KATIA CORREA DE OLIVEIRA SANTOS; SARAH CATHERINE HILL; RENATO SANTANA AGUIAR; FILIPE ROMERO; FABIANA CRISTINA PEREIRA DOS SANTOS; CLAUDIA REGINA GONÇALVES; MARIA DO CARMO TIMENETSKY; JOSHUA QUICK; JULIO HENRIQUE ROSA CRODA; WANDERSON DE OLIVEIRA; ANDREW RAMBAUT; OLIVER G. PYBUS; NICHOLAS J. LOMAN; ESTER CERDEIRA SABINO; NUNO RODRIGUES FARIA. Importation and early local transmission of COVID-19 in Brazil, 2020. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, p. -, 2020. Citações Web of Science: 0.
JAQUELINE GOES DE JESUS; KARINA ROCHA DUTRA; FLAVIA CRISTINA DA SILVA SALES; INGRA MORALES CLARO; ANA CAROLINA TERZIAN; DARLAN DA SILVA CANDIDO; SARAH C HILL; JULIEN THÉZÉ; CELESTE TORRES; TATIANA LANG D’AGOSTINI; ALVINA CLARA FELIX; ANDREIA F NEGRI REIS; LUIZ CARLOS JUNIOR ALCANTARA; ANDRÉ L DE ABREU; JÚLIO HR CRODA; WANDERSON K DE OLIVEIRA; ANA MARIA BISPO DE FILIPIS; MARIA DO CARMO RODRIGUES DOS SANTOS CAMIS; CAMILA MALTA ROMANO; NICK J LOMAN; OLIVER G PYBUS; ESTER CERDEIRA SABINO; MAURICIO L NOGUEIRA; NUNO RODRIGUES FARIA. Genomic detection of a virus lineage replacement event of dengue virus serotype 2 in Brazil, 2019. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 115, p. -, 2020. Citações Web of Science: 0.

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