Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE)

• Processo: 18/14389-0
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de abril de 2019 - 31 de março de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ester Cerdeira Sabino
• Beneficiário: Ester Cerdeira Sabino
• Pesq. responsável no exterior: Nuno Miguel Rodrigues Pascoal Faria
• Instituição no exterior: University of Oxford, Inglaterra
• Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais:( Atuais ): Maria Anice Mureb Sallum
• Pesquisadores principais:( Anteriores ): Adriano Pinter dos Santos ; Anna Sara Shafferman Levin ; Renato Pereira de Souza ; Vivian Helena Iida Avelino da Silva
• Pesq. associados: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza ; Juliana Telles de Deus ; Licia Natal Fernandes ; Lucas Augusto Moyses Franco ; Marcelo Urbano Ferreira ; Marina Farrel Côrtes ; Maurício Lacerda Nogueira ; Mayara Bertanhe ; Nazareno Scaccia ; Silvia Figueiredo Costa
• Auxílios(s) vinculado(s): 20/04884-4 - Estudo da prevalência do coronavírus COVID-19 na população de doadores de sangue e avaliação dos soropositivos para a produção de soro hiperimune, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/11953-5 - Análise espaço-temporal das variantes de preocupação do SARS-CoV-2 no município de São Paulo, BP.PD; 21/11827-0 - Desenvolvimento de um teste baseado em metagenômica rápida, econômica e sensível para o diagnóstico e vigilância de vírus associados à Encefalite/Meningite, BP.PD; 21/13203-3 - Triagem prospectiva para identificação de variantes de preocupação do SARS-CoV-2 no município de São Paulo, BP.TT; + mais bolsas vinculadas 21/13204-0 - Levantamento de agentes infecciosos por metagenômica em quirópteros de áreas verdes do município de São Paulo e sua implicância para a Saúde Pública, BP.TT; 21/10241-1 - Análise filogenética do SARS-CoV-2 na cidade de São Paulo, BP.TT; 21/09969-0 - Vigilância genômica de variantes de preocupação do Sars-CoV-2 no município de São Paulo, BP.TT; 21/09278-8 - Diagnóstico viral em indivíduos com doença febril aguda no Brasil, BP.TT; 21/09083-2 - Filogeografia do vírus dengue sorotipos 1 a 4 no estado de São Paulo: estudo retrospectivo de 1991 a 2016, BP.TT; 21/03973-6 - Aspectos da emergência da febre amarela na Serra da Cantareira, Região Metropolitana de São Paulo - Brasil, BP.TT; 21/03215-4 - Metagenômica viral para identificação de vírus em mosquitos no estado de São Paulo, BP.TT; 20/04272-9 - Genética viral para identificação de arbovírus no estado de São Paulo, BP.TT; 20/02280-4 - Metagenômica viral para identificação de vírus em mosquitos no estado de São Paulo, BP.TT; 19/21706-5 - Metagenômica viral de mosquitos capturados no Estado de São Paulo, BP.DD; 19/21301-5 - Identificação de Flavivirus e Alphavirus em mosquitos (Diptera: Culicidae) coletados na cidade de São Paulo, BP.IC; 19/21568-1 - Identificação de Febre Amarela e Chikungunya em mosquitos capturados no estado de São Paulo, BP.IC; 19/12988-7 - Identificação de espécies de mosquitos, farinha de sangue e detecção de vírus usando a tecnologia da Oxford Nanopore technologies (MinION) em um cenário de transmissão de YF, BP.PD; 19/12000-1 - Modelagem da dispersão espaço-temporal de arbovírus emergentes usando fontes de dados heterogêneas no Estado de São Paulo, BP.PD; 19/07544-2 - Coletas de campo de mosquito e identificação de código de barras COI usando a tecnologia MinION, BP.TT; 19/07982-0 - Aspectos da emergência da febre amarela na Serra da Cantareira, Região Metropolitana de São Paulo - Brasil, BP.TT; 17/00021-9 - Metagenômica viral da Dengue, Chikungunya e Zika: acompanhar, explicar e prever a transmissão e distribuição espaço-temporal no Brasil, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Saúde pública Epidemiologia Genômica Prevalência Diagnóstico clínico Vírus Arbovirus Vírus Zika Febre de Chikungunya Dengue Febre amarela

Resumo

Recentemente, o Brasil tem sido afetado por epidemias de arbovírus inesperadas de vírus Zika, Chikungunya, dengue e febre amarela. O enorme ônus econômico do Zika (R $ 1 bilhão) e a presença generalizada de vetores de mosquitos no Brasil destacam a necessidade de previsões precisas da disseminação de doenças, particularmente em regiões grandes e densamente povoadas. Esta Parceria Reino Unido-Brasil irá melhorar e expandir uma excelente colaboração existente, com o objetivo de antecipar e prevenir futuras epidemias de arbovírus no Brasil. Nossas questões de pesquisa incluem: 1) Quais arbovirus circulam em humanos, mosquitos e populações de reservatórios no Brasil? 2) Onde e como os arbovírus persistem durante períodos não epidêmicos? 3) Quais são as implicações da diversidade genética dos arbovírus circulantes? 4) Que fatores convertem uma nova introdução em populações humanas em uma epidemia e qual a melhor forma de responder? A vigilância ativa em vetores e reservatórios será combinada com pesquisas de soroprevalência em doadores de sangue para caracterizar a dinâmica arboviral, a genômica, a transmissão e a imunidade. Novos protocolos de sequenciamento de genoma portátil e análises epidemiológicas em tempo real serão realizados para arbovírus relevantes. A unificação das informações em genômica e epidemiologia fortalecerá a base de evidências para ações de saúde pública e fortalecerá a capacidade do sistema de saúde brasileiro em resposta a doenças arbovirais emergentes. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LEAL, FABIO E.; MENDES-CORREA, MARIA C.; BUSS, LEWIS FLETCHER; COSTA, SILVIA F.; BIZARIO, JOAO C. S.; DE SOUZA, SONIA R. P.; THOMAZ, OSORIO; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; VILLAS-BOAS, LUCY S.; DE OLIVEIRA-DA SILVA, LEA CAMPOS; GRESPAN, REGINA M. Z.; CAPUANI, LIGIA; BUCCHERI, RENATA; DOMINGUES, HELVES; ALEXANDER, NEAL; MAYAUD, PHILIPPE; SABINO, ESTER CERDEIRA. Clinical features and natural history of the first 2073 suspected COVID-19 cases in the Corona Sao Caetano primary care programme: a prospective cohort study. BMJ OPEN, v. 11, n. 1 2021. Citações Web of Science: 0.

CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; MANULI, ERIKA R.; THEZE, JULIEN; ALMEIDA, LUIZ; MENEZES, MARIANE T.; VOLOCH, CAROLINA M.; FUMAGALLI, MARCILIO J.; COLETTI, THAIS M.; SILVA, CAMILA A. M.; RAMUNDO, MARIANA S.; AMORIM, MARIENE R.; HOELTGEBAUM, HENRIQUE H.; MISHRA, SWAPNIL; GILL, MANDEV S.; CARVALHO, LUIZ M.; BUSS, LEWIS F.; PRETE JR, CARLOS A.; ASHWORTH, JORDAN; NAKAYA, I, HELDER; PEIXOTO, PEDRO S.; BRADY, OLIVER J.; NICHOLLS, SAMUEL M.; TANURI, AMILCAR; ROSSI, ATILA D.; BRAGA, V, CARLOS K.; GERBER, ALEXANDRA L.; GUIMARAES, ANA PAULA DE C.; GABURO JR, NELSON; ALENCAR, CECILA SALETE; FERREIRA, ALESSANDRO C. S.; LIMA, CRISTIANO X.; LEVI, JOSE EDUARDO; GRANATO, CELSO; FERREIRA, GIULIA M.; FRANCISCO JR, RONALDO S.; GRANJA, FABIANA; GARCIA, MARCIA T.; MORETTI, MARIA LUIZA; PERROUD JR, MAURICIO W.; CASTINEIRAS, TEREZINHA M. P. P.; LAZARI, CAROLINA S.; HILL, SARAH C.; DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; SIMEONI, CAMILA L.; FORATO, JULIA; SPOSITO, ANDREI C.; SCHREIBER, ANGELICA Z.; SANTOS, MAGNUN N. N.; DE SA, CAMILA ZOLINI; SOUZA, RENAN P.; RESENDE-MOREIRA, LUCIANA C.; TEIXEIRA, MAURO M.; HUBNER, JOSY; LEME, PATRICIA A. F.; MOREIRA, RENNAN G.; NOGUEIRA, MAURICIO L.; FERGUSON, NEIL M.; COSTA, SILVIA F.; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R.; BHATT, SAMIR; LEMEY, PHILIPPE; WU, CHIEH-HSI; RAMBAUT, ANDREW; LOMAN, NICK J.; AGUIAR, RENATO S.; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES; DISCOVERY, BRAZIL-UK CTR ARBOVIRUS. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. Citações Web of Science: 1.

HILL, SARAH C.; DE SOUZA, RENATO; THEZE, JULIEN; CLARO, INGRA; AGUIAR, RENATO S.; ABADE, LEANDRO; SANTOS, FABIANA C. P.; CUNHA, MARIANA S.; NOGUEIRA, JULIANA S.; SALLES, FLAVIA C. S.; ROCCO, IRAY M.; MAEDA, ADRIANA Y.; VASAMI, FERNANDA G. S.; DU PLESSIS, LOUIS; SILVEIRA, PAOLA P.; DE JESUS, JAQUELINE G.; QUICK, JOSHUA; FERNANDES, NATALIA C. C. A.; GUERRA, JULIANA M.; RESSIO, RODRIGO A.; GIOVANETTI, MARTA; ALCANTARA, LUIZ C. J.; CIRQUEIRA, CINTHYA S.; DIAZ-DELGADO, JOSUE; MACEDO, FERNANDO L. L.; TIMENETSKY, MARIA DO CARMO S. T.; DE PAULA, REGIANE; SPINOLA, ROBERTA; DE DEUS, JULIANA TELLES; MUCCI, LUIS F.; TUBAKI, ROSA MARIA; DE MENEZES, REGIANE M. T.; RAMOS, PATRICIA L.; DE ABREU, ANDRE L.; CRUZ, LAURA N.; LOMAN, NICK; DELLICOUR, SIMON; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO R. Genomic Surveillance of Yellow Fever Virus Epizootic in Sao Paulo, Brazil, 2016-2018. PLOS PATHOGENS, v. 16, n. 8 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.

DENG, XIANDING; GU, WEI; FEDERMAN, SCOT; DU PLESSIS, LOUIS; PYBUS, OLIVER G.; FARIA, NUNO R.; WANG, CANDACE; YU, GUIXIA; BUSHNELL, BRIAN; PAN, CHAO-YANG; GUEVARA, HUGO; SOTOMAYOR-GONZALEZ, ALICIA; ZORN, KELSEY; GOPEZ, ALLAN; SERVELLITA, VENICE; HSU, ELAINE; MILLER, STEVE; BEDFORD, TREVOR; GRENINGER, ALEXANDER L.; ROYCHOUDHURY, PAVITRA; STARITA, LEA M.; FAMULARE, MICHAEL; CHU, HELEN Y.; SHENDURE, JAY; JEROME, KEITH R.; ANDERSON, CATIE; GANGAVARAPU, KARTHIK; ZELLER, MARK; SPENCER, EMILY; ANDERSEN, KRISTIAN G.; MACCANNELL, DUNCAN; PADEN, CLINTON R.; LI, YAN; ZHANG, JING; TONG, SUXIANG; ARMSTRONG, GREGORY; MORROW, SCOTT; WILLIS, MATTHEW; MATYAS, BELA T.; MASE, SUNDARI; KASIRYE, OLIVIA; PARK, MAGGIE; MASINDE, GODFRED; CHAN, CURTIS; YU, ALEXANDER T.; CHAI, SHUA J.; VILLARINO, ELSA; BONIN, BRANDON; WADFORD, DEBRA A.; CHIU, CHARLES Y. Genomic surveillance reveals multiple introductions of SARS-CoV-2 into Northern California. Science, v. 369, n. 6503, p. 582+, JUL 31 2020. Citações Web of Science: 4.

DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS FLETCHER; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; CARRERA, JEAN-PAUL; LI, SABRINA; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; PEREIRA, RAFAEL HENRIQUE MORAES; PRETE, JR., CARLOS A.; DE SOUZA-SANTOS, ANDREZA ARUSKA; PARAG, KRIS V.; BELOTTI, MARIA CAROLINA T. D.; VINCENTI-GONZALEZ, MARIA F.; MESSINA, JANEY; DA SILVA SALES, FLAVIA CRISTINA; ANDRADE, PAMELA DOS SANTOS; NASCIMENTO, VITOR HELOIZ; GHILARDI, FABIO; ABADE, LEANDRO; GUTIERREZ, BERNARDO; KRAEMER, MORITZ U. G.; BRAGA, CARLOS K. V.; AGUIAR, RENATO SANTANA; ALEXANDER, NEAL; MAYAUD, PHILIPPE; BRADY, OLIVER J.; MARCILIO, IZABEL; GOUVEIA, NELSON; LI, GUANGDI; TAMI, ADRIANA; DE OLIVEIRA, SILVANO BARBOSA; PORTO, VICTOR BERTOLLO GOMES; GANEM, FABIANA; DE ALMEIDA, WALQUIRIA APARECIDA FERREIRA; FANTINATO, FRANCIELI FONTANA SUTILE TARDETTI; MACARIO, EDUARDO MARQUES; DE OLIVEIRA, WANDERSON KLEBER; NOGUEIRA, MAURICIO L.; PYBUS, OLIVER G.; WU, CHIEH-HSI; CRODA, JULIO; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES. Epidemiological and clinical characteristics of the COVID-19 epidemic in Brazil. NATURE HUMAN BEHAVIOUR, v. 4, n. 8 JUL 2020. Citações Web of Science: 0.

CUNHA, MARIANA SEQUETIN; FARIA, NUNO RODRIGUES; CALEIRO, GIOVANA SANTOS; CANDIDO, DARLAN SILVA; HILL, SARAH C.; CLARO, INGRA MORALES; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; MAEDA, ADRIANA YURIKA; DA SILVA, FERNANDA GISELE; DE SOUZA, RENATO PEREIRA; SPINOLA, ROBERTA; TUBAKI, ROSA MARIA; TIRONI DE MENEZES, REGIANE MARIA; ABADE, LEANDRO; MUCCI, LUIS FILIPE; SAMPAIO TAVARES TIMENETSKY, MARIA DO CARMO; SABINO, ESTHER. Genomic evidence of yellow fever virus in Aedes scapularis, southeastern Brazil, 2016. Acta Tropica, v. 205, MAY 2020. Citações Web of Science: 0.

REZENDE, HELDER RICAS; ROMANO, CAMILA MALTA; CLARO, INGRA MORALES; CALEIRO, GIOVANA SANTOS; SABINO, ESTER CERDEIRA; FELIX, ALVINA CLARA; BISSOLI, JEFFERSON; HILL, SARAH; FARIA, NUNO RODRIGUES; CARDOSO DA SILVA, THERESA CRISTINA; BRIOSCHI SANTOS, ANA PAULA; CERUTTI JUNIOR, CRISPIM; VICENTE, CREUZA RACHEL. First report of Aedes albopictus infected by Dengue and Zika virus in a rural outbreak in Brazil. PLoS One, v. 15, n. 3 MAR 12 2020. Citações Web of Science: 1.

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JAQUELINE GOES DE JESUS; CLAUDIO SACCHI; DARLAN DA SILVA CANDIDO; INGRA MORALES CLARO; FLÁVIA CRISTINA SILVA SALES; ERIKA REGINA MANULI; DANIELA BERNARDES BORGES DA SILVA; TEREZINHA MARIA DE PAIVA; MARGARETE APARECIDA BENEGA PINHO; KATIA CORREA DE OLIVEIRA SANTOS; SARAH CATHERINE HILL; RENATO SANTANA AGUIAR; FILIPE ROMERO; FABIANA CRISTINA PEREIRA DOS SANTOS; CLAUDIA REGINA GONÇALVES; MARIA DO CARMO TIMENETSKY; JOSHUA QUICK; JULIO HENRIQUE ROSA CRODA; WANDERSON DE OLIVEIRA; ANDREW RAMBAUT; OLIVER G. PYBUS; NICHOLAS J. LOMAN; ESTER CERDEIRA SABINO; NUNO RODRIGUES FARIA. Importation and early local transmission of COVID-19 in Brazil, 2020. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, p. -, 2020. Citações Web of Science: 8.

JAQUELINE GOES DE JESUS; KARINA ROCHA DUTRA; FLAVIA CRISTINA DA SILVA SALES; INGRA MORALES CLARO; ANA CAROLINA TERZIAN; DARLAN DA SILVA CANDIDO; SARAH C HILL; JULIEN THÉZÉ; CELESTE TORRES; TATIANA LANG D’AGOSTINI; ALVINA CLARA FELIX; ANDREIA F NEGRI REIS; LUIZ CARLOS JUNIOR ALCANTARA; ANDRÉ L DE ABREU; JÚLIO HR CRODA; WANDERSON K DE OLIVEIRA; ANA MARIA BISPO DE FILIPIS; MARIA DO CARMO RODRIGUES DOS SANTOS CAMIS; CAMILA MALTA ROMANO; NICK J LOMAN; OLIVER G PYBUS; ESTER CERDEIRA SABINO; MAURICIO L NOGUEIRA; NUNO RODRIGUES FARIA. Genomic detection of a virus lineage replacement event of dengue virus serotype 2 in Brazil, 2019. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 115, p. -, 2020. Citações Web of Science: 0.