Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE)

• Processo: 18/14389-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de abril de 2019 - 31 de março de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ester Cerdeira Sabino
• Beneficiário: Ester Cerdeira Sabino
• Pesq. responsável no exterior: Nuno Miguel Rodrigues Pascoal Faria
• Instituição no exterior: University of Oxford, Inglaterra
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores principais:( Atuais ): Maria Anice Mureb Sallum
• Pesquisadores principais:( Anteriores ): Adriano Pinter dos Santos ; Anna Sara Shafferman Levin ; Renato Pereira de Souza ; Vivian Helena Iida Avelino da Silva
• Pesquisadores associados: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza ; Erika Regina Manuli ; Fernando Rosado Spilki ; Filipe Romero Rebello Moreira ; Franciane Mendes de Oliveira ; Juliana Telles de Deus ; Licia Natal Fernandes ; Lucas Augusto Moyses Franco ; Marcelo Urbano Ferreira ; Mariana Sequetin Cunha ; Marina Farrel Côrtes ; Marissa da Silva Lima ; Maurício Lacerda Nogueira ; Mayara Bertanhe ; Milena Gomes Cabral ; Mirela D'arc Ferreira da Costa ; Nazareno Scaccia ; Silvia Figueiredo Costa
• Auxílios(s) vinculado(s): 22/00533-8 - Avaliação de uma plataforma portátil baseada em imagem para análise quantitativa do ensaio de LAMP, AP.R SPRINT; 20/04884-4 - Estudo da prevalência do coronavírus COVID-19 na população de doadores de sangue e avaliação dos soropositivos para a produção de soro hiperimune, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/06687-0 - Implementação da técnica de nariz eletrônico em amostras prospectivas de saliva e expirado pulmonar de pacientes com Covid-19, outras infecções virais e pacientes controle., BP.IC; 22/11933-7 - Mecanismos moleculares envolvidos na evolução para Doença Articular Crônica pós-Chikungunya, BP.PD; 22/05637-6 - Filogeografia de dengue vírus sorotipos 1 a 4 no estado de São Paulo: estudo retrospectivo de 1991 a 2016, BE.PQ; + mais bolsas vinculadas 21/11953-5 - Análise espaço-temporal das variantes de preocupação do SARS-CoV-2 no município de São Paulo, BP.PD; 21/11827-0 - Desenvolvimento de um teste baseado em metagenômica rápida, econômica e sensível para o diagnóstico e vigilância de vírus associados à Encefalite/Meningite, BP.PD; 21/13203-3 - Triagem prospectiva para identificação de variantes de preocupação do SARS-CoV-2 no município de São Paulo, BP.TT; 21/13204-0 - Levantamento de agentes infecciosos por metagenômica em quirópteros de áreas verdes do município de São Paulo e sua implicância para a Saúde Pública, BP.TT; 21/10241-1 - Análise filogenética do SARS-CoV-2 na cidade de São Paulo, BP.TT; 21/09083-2 - Filogeografia do vírus dengue sorotipos 1 a 4 no estado de São Paulo: estudo retrospectivo de 1991 a 2016, BP.TT; 21/09969-0 - Vigilância genômica de variantes de preocupação do Sars-CoV-2 no município de São Paulo, BP.TT; 21/09278-8 - Diagnóstico viral em indivíduos com doença febril aguda no Brasil, BP.TT; 21/03973-6 - Aspectos da emergência da febre amarela na Serra da Cantareira, Região Metropolitana de São Paulo - Brasil, BP.TT; 21/03215-4 - Metagenômica viral para identificação de vírus em mosquitos no estado de São Paulo, BP.TT; 20/04272-9 - Genética viral para identificação de arbovírus no estado de São Paulo, BP.TT; 20/02280-4 - Metagenômica viral para identificação de vírus em mosquitos no estado de São Paulo, BP.TT; 19/21706-5 - Metagenômica viral de mosquitos capturados no Estado de São Paulo, BP.DD; 19/21301-5 - Identificação de Flavivirus e Alphavirus em mosquitos (Diptera: Culicidae) coletados na cidade de São Paulo, BP.IC; 19/21568-1 - Identificação de Febre Amarela e Chikungunya em mosquitos capturados no estado de São Paulo, BP.IC; 19/12988-7 - Identificação de espécies de mosquitos, farinha de sangue e detecção de vírus usando a tecnologia da Oxford Nanopore technologies (MinION) em um cenário de transmissão de YF, BP.PD; 19/12000-1 - Modelagem da dispersão espaço-temporal de arbovírus emergentes usando fontes de dados heterogêneas no Estado de São Paulo, BP.PD; 19/07544-2 - Coletas de campo de mosquito e identificação de código de barras COI usando a tecnologia MinION, BP.TT; 19/07982-0 - Aspectos da emergência da febre amarela na Serra da Cantareira, Região Metropolitana de São Paulo - Brasil, BP.TT; 17/00021-9 - Metagenômica viral da Dengue, Chikungunya e Zika: acompanhar, explicar e prever a transmissão e distribuição espaço-temporal no Brasil, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Saúde pública Epidemiologia Genômica Prevalência Diagnóstico clínico Vírus Arbovirus Vírus Zika Febre de Chikungunya Dengue Febre amarela
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epidemiologia | Genômica | Prevalência | Saúde Pública | Virus | Doenças infecciosas e parasitárias

Resumo

Recentemente, o Brasil tem sido afetado por epidemias de arbovírus inesperadas de vírus Zika, Chikungunya, dengue e febre amarela. O enorme ônus econômico do Zika (R $ 1 bilhão) e a presença generalizada de vetores de mosquitos no Brasil destacam a necessidade de previsões precisas da disseminação de doenças, particularmente em regiões grandes e densamente povoadas. Esta Parceria Reino Unido-Brasil irá melhorar e expandir uma excelente colaboração existente, com o objetivo de antecipar e prevenir futuras epidemias de arbovírus no Brasil. Nossas questões de pesquisa incluem: 1) Quais arbovirus circulam em humanos, mosquitos e populações de reservatórios no Brasil? 2) Onde e como os arbovírus persistem durante períodos não epidêmicos? 3) Quais são as implicações da diversidade genética dos arbovírus circulantes? 4) Que fatores convertem uma nova introdução em populações humanas em uma epidemia e qual a melhor forma de responder? A vigilância ativa em vetores e reservatórios será combinada com pesquisas de soroprevalência em doadores de sangue para caracterizar a dinâmica arboviral, a genômica, a transmissão e a imunidade. Novos protocolos de sequenciamento de genoma portátil e análises epidemiológicas em tempo real serão realizados para arbovírus relevantes. A unificação das informações em genômica e epidemiologia fortalecerá a base de evidências para ações de saúde pública e fortalecerá a capacidade do sistema de saúde brasileiro em resposta a doenças arbovirais emergentes. (AU)

Publicações científicas

(38)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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DE SOUZA, WILLIAM M.; MURARO, STEFANIE P.; SOUZA, GABRIELA F.; AMORIM, MARIENE R.; SESTI-COSTA, RENATA; MOFATTO, LUCIANA S.; FORATO, JULIA; BARBOSA, PRISCILLA P.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; et al. lusters of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 Infection after Vaccination with Adenovirus-Vectored and Inactivated Vaccine. Viruses-Basel, v. 13, n. 11, NOV 2021. (16/00194-8, 18/14389-0, 18/13645-3, 17/26908-0, 20/02159-0, 17/13981-0, 19/09704-7, 18/10224-7, 19/24251-9, 20/04558-0)

ROMANO, CAMILA MALTA; FELIX, ALVINA CLARA; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; DE JESUS, JAQUELINE GOES; ANDRADE, PAMELA S.; CANDIDO, DARLAN; DE OLIVEIRA, FRANCIANE M.; RIBEIRO, ANDREIA C.; DA SILVA, FRANCINI C.; INEMAMI, MARTA; et al. SARS-CoV-2 reinfection caused by the P.1 lineage in Araraquara city, Sao Paulo State, Brazil. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, 2021. (17/13981-0, 19/03859-9, 19/24251-9, 18/14389-0)

NICOLETE, VANESSA C.; RODRIGUES, PRISCILA T.; JOHANSEN, IGOR C.; CORDER, RODRIGO M.; TONINI, JULIANA; CARDOSO, MARLY A.; DE JESUS, JAQUELINE G.; CLARO, INGRA M.; FARIA, NUNO R.; SABINO, ESTER C.; et al. Interacting Epidemics in Amazonian Brazil: Prior Dengue Infection Associated With Increased Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Risk in a Population-Based Cohort Stud. Clinical Infectious Diseases, v. 73, n. 11, p. 2045-2054, DEC 1 2021. (18/14389-0, 16/18740-9, 20/04505-3)

RIBEIRO PRIST, PAULA; REVERBERI TAMBOSI, LEANDRO; FILIPE MUCCI, LUIS; PINTER, ADRIANO; PEREIRA DE SOUZA, RENATO; DE LARA MUYLAERT, RENATA; ROGER RHODES, JONATHAN; HENRIQUE COMIN, CESAR; DA FONTOURA COSTA, LUCIANDO; LANG D'AGOSTINI, TATIANA; et al. Roads and forest edges facilitate yellow fever virus dispersion. JOURNAL OF APPLIED ECOLOGY, v. 59, n. 1, OCT 2021. (18/09125-4, 18/14389-0, 15/22308-2, 18/23364-1, 17/11666-0)

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EVELYN PATRICIA SÁNCHEZ ESPINOZA; MARINA FARREL CORTES; SAIDY VASCONEZ NOGUERA; ANDERSON VICENTE DE PAULA; THAIS GUIMARÃES; LUCY SANTOS VILLAS BOAS; MARCELO PARK; CRISTINA CARVALHO DA SILVA; INGRA MORALES; LAURO VIEIRA PERDIGÃO NETO; et al. Are mobile phones part of the chain of transmission of SARS-CoV-2 in hospital settings?. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, 2021-09-27. (18/14389-0)

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IANI, FELIPE C. M.; GIOVANETTI, MARTA; FONSECA, VAGNER; SOUZA, WILLIAM M.; ADELINO, TALITA E. R.; XAVIER, JOILSON; JESUS, JAQUELINE G.; PEREIRA, MAIRA A.; SILVA, MARCOS V. F.; COSTA, ALANA V. B.; et al. Epidemiology and evolution of Zika virus in Minas Gerais, Southeast Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 91, JUL 2021. (18/14389-0, 17/13981-0, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/24251-9)

PRETE, JR., CARLOS A.; BUSS, LEWIS F.; BUCCHERI, RENATA; ABRAHIM, CLAUDIA M. M.; SALOMON, TASSILA; CRISPIM, MYUKI A. E.; OIKAWA, MARCIO K.; GREBE, EDUARD; DA COSTA, ALLYSON G.; FRAIJI, NELSON A.; et al. einfection by the SARS-CoV-2 Gamma variant in blood donors in Manaus, Brazi. BMC INFECTIOUS DISEASES, v. 22, n. 1, FEB 5 2022. (19/21858-0, 18/14389-0)

GUTIERREZ, BERNARDO; MARQUEZ, SULLY; PRADO-VIVAR, BELEN; BECERRA-WONG, MONICA; JOSE GUADALUPE, JUAN; DA SILVA CANDIDO, DARLAN; CARLOS FERNANDEZ-CADENA, JUAN; MOREY-LEON, GABRIEL; ARMAS-GONZALEZ, RUBEN; MADELEINY ANDRADE-MOLINA, DERLY; et al. enomic epidemiology of SARS-CoV-2 transmission lineages in Ecuado. VIRUS EVOLUTION, v. 7, n. 2, DEC 2021. (18/14389-0)

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NICOLETE, VANESSA C.; RODRIGUES, PRISCILA T.; JOHANSEN, IGOR C.; CORDER, RODRIGO M.; TONINI, JULIANA; CARDOSO, MARLY A.; DE JESUS, JAQUELINE G.; CLARO, INGRA M.; FARIA, NUNO R.; SABINO, ESTER C.; et al. nteracting Epidemics in Amazonian Brazil: Prior Dengue Infection Associated With Increased Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Risk in a Population-Based Cohort Stud. Clinical Infectious Diseases, v. 73, n. 11, p. 2045-2054, DEC 6 2021. (16/18740-9, 18/14389-0, 20/04505-3)

CLARO, INGRA MORALES; DA SILVA SALES, FLAVIA CRISTINA; RAMUNDO, MARIANA SEVERO; CANDIDO, DARLAN S.; SILVA, CAMILA A. M.; DE JESUS, JAQUELINE GOES; MANULI, ERIKA R.; DE OLIVEIRA, CRISTINA MENDES; SCARPELLI, LUCIANO; CAMPANA, GUSTAVO; et al. Local Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7, Brazil, December 2020. Emerging Infectious Diseases, v. 27, n. 3, p. 970-972, MAR 2021. (18/14389-0)

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AMORIM, MARIENE R.; SOUZA, WILLIAM M.; BARROS, JR., ANTONIO C. G.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; SIMEONI, CAMILA L.; PARISE, PIERINA L.; VIEIRA, ALINE; FORATO, JULIA; CLARO, INGRA M.; et al. Respiratory Viral Shedding in Healthcare Workers Reinfected with SARS-CoV-2, Brazil, 2020. Emerging Infectious Diseases, v. 27, n. 6, p. 1737-1740, JUN 2021. (20/04558-0, 16/00194-8, 20/02448-2, 18/14389-0, 17/13981-0, 17/26908-0, 19/24251-9, 20/02159-0)

LEAL, FABIO E.; MENDES-CORREA, MARIA C.; BUSS, LEWIS FLETCHER; COSTA, SILVIA F.; BIZARIO, JOAO C. S.; DE SOUZA, SONIA R. P.; THOMAZ, OSORIO; TOZETTO-MENDOZA, TANIA REGINA; VILLAS-BOAS, LUCY S.; DE OLIVEIRA-DA SILVA, LEA CAMPOS; et al. Clinical features and natural history of the first 2073 suspected COVID-19 cases in the Corona Sao Caetano primary care programme: a prospective cohort study. BMJ OPEN, v. 11, n. 1, 2021. (18/14389-0)

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REZENDE, HELDER RICAS; ROMANO, CAMILA MALTA; CLARO, INGRA MORALES; CALEIRO, GIOVANA SANTOS; SABINO, ESTER CERDEIRA; FELIX, ALVINA CLARA; BISSOLI, JEFFERSON; HILL, SARAH; FARIA, NUNO RODRIGUES; CARDOSO DA SILVA, THERESA CRISTINA; et al. First report of Aedes albopictus infected by Dengue and Zika virus in a rural outbreak in Brazil. PLoS One, v. 15, n. 3, MAR 12 2020. (15/05958-3, 18/14389-0)

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