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Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição

Resumo

No JP1, nosso grupo descreveu muitas proteínas associadas à cromatina além de mais de 40 MPTs em histonas, diferencialmente expressas nas formas replicativas versus não replicativas de Trypanosoma cruzi. Regiões clássicas de eu e heterocromatina estão presentes em seus núcleos e mudam dramaticamente durante a diferenciação de epimastigotas para metacíclicos (EàM). Tradicionalmente, essas regiões de cromatina (e algumas histonas MPTs) estão associadas à regulação da transcrição. No entanto, em tripanossomas, é geralmente aceito que mecanismos pós-transcricionais governam a expressão gênica, já que não foram encontradas regiões promotoras clássicas de RNA Pol II, e a transcrição é principalmente policistrônica. Assim, nosso principal objetivo é entender essa aparente controvérsia, investigando o papel da regulação da cromatina em um potencial controle de transcrição. Assim, usando parasitas durante EàM e em diferentes estágios do ciclo celular, pretendemos avaliar, i. a taxa de transcrição em escala genômica global; ii. se a localização genômica interfere na expressão de um gene repórter posicionado em loci genômicos distintos; iii. o conteúdo da cromatina loci-específicos. Esses objetivos serão alcançados usando metodologias de ponta, como o Global Run on sequencing (GRO-seq), a análise de imunoprecipitação de cromatina locus-específica (CLASP ou enCHIP), inserção locus-específica de genes repórter utilizando sistemas CRISPR / Cas9. Prevemos que o uso desse organismo ancestral, que possui muitas peculiaridades genômicas, será uma ferramenta importantíssima para entender regulação da cromatina/epigenética, possivelmente com a descoberta de novos e importantes mecanismos. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AZEVEDO, HATYLAS; PESSOA, GUILHERME CAVALCANTE; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; NSENGIMANA, JEREMIE; NEWTON-BISHOP, JULIA; REIS, EDUARDO MORAES; DA CUNHA, JULIA PINHEIRO CHAGAS; JASIULIONIS, MIRIAM GALVONAS. Gene co-expression and histone modification signatures are associated with melanoma progression, epithelial-to-mesenchymal transition, and metastasis. CLINICAL EPIGENETICS, v. 12, n. 1 AUG 24 2020. Citações Web of Science: 0.
DE LIMA, LOYZE P.; POUBEL, SALOE BISPO; YUAN, ZUO-FEI; ROSON, JULIANA NUNES; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; HOLETZ, FABIOLA BARBIERI; GARCIA, BENJAMIN A.; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO. Improvements on the quantitative analysis of Trypanosoma cruzi histone post translational modifications: Study of changes in epigenetic marks through the parasite's metacyclogenesis and life cycle. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 225, APR 15 2020. Citações Web of Science: 0.

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