Biologia integrativa aplicada à saúde humana

• Processo: 18/14933-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores - Fase 2
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2025
• Área do conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Helder Takashi Imoto Nakaya
• Beneficiário: Helder Takashi Imoto Nakaya
• Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). São Paulo , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Paulo
• Pesquisadores associados: Esper Georges Kallás ; Fernando Augusto Bozza ; Frederico Moraes Ferreira ; Luciano da Fontoura Costa ; Luis Carlos de Souza Ferreira ; Mario Hiroyuki Hirata ; Paola Marcella Camargo Minoprio ; Patricia Cristina Baleeiro Beltrão Braga ; Ricardo Tostes Gazzinelli ; Sergio Schenkman ; Vanderson de Souza Sampaio
• Vinculado ao auxílio: 12/19278-6 - Biologia de sistemas de longos RNAs não-codificadores, AP.JP
• Auxílio(s) vinculado(s): 19/16444-1 - Aplicação da imunologia de sistemas para a resolução dos mecanismos de proteção contra a Peste Suína Clássica induzida por vacina, AP.R SPRINT
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/00563-0 - Jornalismo Científico para Projeto Jovem Pesquisador 2 (2018/14933-2), BP.JC; 24/00562-3 - Jornalismo Científico para Projeto Jovem Pesquisador 2 (2018/14933-2), BP.JC; 23/09291-0 - Predição de alterações estruturais em citocinas causadas por mutações pontuais utilizando AlphaFold2 e Dinâmica Molecular para Vacinologia de Precisão, BP.PD; + mais bolsas vinculadas 20/05284-0 - Interação de microrganismos e hospedeiros humanos associados ao desfecho clínico de pacientes com doenças infecciosas, BP.DD; 20/12017-9 - Aprendizado de máquina para interpretação de análise de imagens microscópicas, BP.PD; 19/27139-5 - Aplicação de ferramentas genômicas para o estudo de bases de dados epidemiológicos, BP.DD; 19/27146-1 - Integração de dados de transcriptoma com dados clínicos e imunológicos, BP.DD; 19/16419-7 - Estudo da transmissão de doenças usando celular de pessoas infectadas, BP.DD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Imunologia Epidemiologia Biologia computacional Biologia de sistemas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | biologia de sistemas | Epidemiologia | Imunologia | integração de dados | Biologia de Sistemas

Resumo

Dados relacionados com a saúde humana, desde informações clínicas e epidemiológicas até imagens médicas e experimentos ômicos, estão sendo gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento. Este projeto propõe abordagens inovadoras para: analisar imensas bases de dados epidemiológicos; mapear hotspots de transmissão de doenças; integrar dados de transcritoma com dados clínicos e imunológicos; e usar aprendizado de máquina para interpretação e análise de imagens microscópicas. Técnicas atuais e modernas de análises de biologia de sistemas e aprendizado de máquina serão utilizadas e até mesmo desenvolvidas para cada abordagem, levando em conta os fundamentos da biologia integrativa. Espera-se que os resultados do projeto possam esclarecer diversos problemas relacionados à saúde humana, da análise automática de lâminas microscópicas até os mecanismos moleculares de doenças infecciosas e inflamatórias. (AU)

Publicações científicas

(38)

(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)

AGUIAR, RENATO S.; POHL, FABIO; MORAIS, GUILHERME L.; NOGUEIRA, FABIO C. S.; DE CARVALHO, JOSEANE B.; GUIDA, LETICIA; ARGE, LUIS W. P.; MELO, ADRIANA; MOREIRA, MARIA E. L.; CUNHA, DANIELA P.; et al. Molecular alterations in the extracellular matrix in the brains of newborns with congenital Zika syndrome. Science Signaling, v. 13, n. 635, JUN 9 2020. (13/08216-2, 12/19278-6, 18/21934-5, 17/50137-3, 18/14933-2)

PERON, J. P. S.; NAKAYA, I, H.; SCHLINDWEIN, M. A. M.; GONCALVES, M. V. M.. COVID-19 Pandemic and Dysbiosis: Can the Ivermectin Hysteria Lead to an Increase of Autoimmune Neuroinflammatory Diseases?. CRITICAL REVIEWS IN IMMUNOLOGY, v. 40, n. 6, SI, p. 537-542, 2020. (17/22504-1, 18/14933-2, 12/19278-6, 13/08216-2, 18/21934-5, 19/06372-3, 17/21363-5)

CREIGHTON, RACHEL; SCHUCH, VIVIANE; URBANSKI, ALYSSON H.; GIDDALURU, JEEVAN; COSTA-MARTINS, ANDRE G.; NAKAYA, I, HELDER. Network vaccinology. SEMINARS IN IMMUNOLOGY, v. 50, AUG 2020. (18/14933-2, 17/27131-9, 13/08216-2, 18/21934-5)

SANTOS E SILVA, JUAN CARLO; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; YONEHARA NOMA, ISABELLA HARUMI; NORONHA, NATALIA YUMI; AQUINO, RODRIGO; GIDDALURU, JEEVAN; DURAO, LUIZ; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; SCHUCH, VIVIANE; MORAES-VIEIRA, PEDRO M.; et al. Gene signatures of autopsy lungs from obese patients with COVID-19. CLINICAL NUTRITION ESPEN, v. 44, p. 475-478, AUG 2021. (19/27139-5, 18/14933-2, 20/04579-7, 19/27146-1)

PANNARAJ, PIA S.; DA COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; CERINI, CHIARA; LI, FAN; WONG, SOOK-SAN; SINGH, YOUVIKA; URBANSKI, ALYSSON H.; GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; YANG, JULIANA; WEBBY, RICHARD J.; et al. Molecular alterations in human milk in simulated maternal nasal mucosal infection with live attenuated influenza vaccination. MUCOSAL IMMUNOLOGY, v. N/A, p. 8-pg., 2022-06-23. (18/14933-2)

BRUNETTI, NATALIA S.; DAVANZO, GUSTAVO G.; DE MORAES, DIOGO; FERRARI, ALLAN J. R.; SOUZA, GABRIELA F.; MURARO, STEFANIE PRIMON; KNITTEL, THIAGO L.; BOLDRINI, VINICIUS O.; MONTEIRO, LAUAR B.; VIRGILIO-DA-SILVA, JOO VICTOR; et al. SARS-CoV-2 uses CD4 to infect T helper lymphocytes. eLIFE, v. 12, p. 26-pg., 2023-07-31. (20/04558-0, 15/15626-8, 19/06459-1, 19/04726-2, 19/16116-4, 19/05155-9, 19/13552-8, 16/18031-8, 19/00098-7, 20/04583-4, 16/00194-8, 21/08354-2, 19/17007-4, 19/22398-2, 17/01184-9, 19/14465-1, 20/04579-7, 13/08293-7, 18/14933-2, 17/23920-9, 19/06372-3, 16/24163-4, 16/23328-0, 20/04919-2, 20/04746-0)

GONCALVES, ANDRE N. A.; LEVER, MELISSA; RUSSO, PEDRO S. T.; GOMES-CORREIA, BRUNO; URBANSKI, ALYSSON H.; POLLARA, GABRIELE; NOURSADEGHI, MAHDAD; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, I, HELDER. Assessing the Impact of Sample Heterogeneity on Transcriptome Analysis of Human Diseases Using MDP Webtool. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, OCT 24 2019. (13/08216-2, 12/19278-6, 18/14933-2)

LUSCHER-DIAS, THOMAZ; CONCEICAO, IZABELA MAMEDE; SCHUCH, VIVIANE; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; AMARAL, PAULO P.; NAKAYA, HELDER I.; HON, CC. Long non-coding RNAs associated with infection and vaccine-induced immunity. NON-CODING GENOME, v. 65, n. 4, p. 13-pg., 2021-01-01. (18/14933-2, 13/08216-2, 20/04836-0, 17/27131-9, 18/21934-5)

URBAN, BRITTA C.; GONCALVES, ANDRE N. A.; LOUKOV, DESSI; PASSOS, FERNANDO M.; REINE, JESUS; GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; SOLORZANO, CARLA; MITSI, ELENA; NIKOLAOU, ELISSAVET; O'CONNOR, DANIEL; et al. Inflammation of the nasal mucosa is associated with susceptibility to experimental pneumococcal challenge in older adults. MUCOSAL IMMUNOLOGY, v. 17, n. 5, p. 17-pg., 2024-10-09. (18/14933-2)

MAEHR, TANJA; LOPEZ, JAVIER; DRAKE, GABBY; FERREIRA, FREDERICO M.; FRASER, RICHARD; MCKOWN, REBECCA; KAILATH, RESHMA; MORRIS, SUSAN; CHAMBERS, ADAM; GRAVES, LEO P.; et al. A safe, T cell-inducing heterologous vaccine against elephant endotheliotropic herpesvirus in a proof-of-concept study. NATURE COMMUNICATIONS, v. 16, n. 1, p. 15-pg., 2025-10-03. (18/14933-2, 19/16444-1)

CRUZ, LILIAN; FERREIRA, FREDERICO MORAES; LOPES-RAMOS, CAMILA MIRANDA; WEI, ZHIYUN; HENDRIKS, WILLIAM T.; JINNAH, H. A.; NAKAYA, HELDER I.; BRAGG, D. CRISTOPHER; KRICHEVSKY, ANNA M.; BREAKEFIELD, XANDRA OWENS; et al. Intracellular and Extracellular Vesicle miRNA Signatures in Human iPSC-Derived Neural Stem Cells and Floor Plate Progenitors. FASEB JOURNAL, v. 39, n. 16, p. 20-pg., 2025-08-28. (13/22078-1, 15/25756-6, 18/15557-4, 18/14933-2, 11/13906-2)

FRAGA, CARLOS ALBERTO DE CARVALHO; SANTOS, CATARINA ROSA E SILVA; LIMA, KAYO FELIPE BARBOSA; RODRIGUES, GUSTAVO HENRIQUE BRASIL; PORTO, CAIO CESAR FERNANDES NOBRE; DA SILVA, GABRIEL VICTOR LUCENA; SIMIZO, ADRIANA; DUARTE, ANA KELLY DA SILVA FERNANDES; BAGGIO, JUSSARA ALMEIDA DE OLIVEIRA; RODRIGUES, AMANDA KARINE BARROS FERREIRA; et al. Periostin-positive stellate cells associated with perineural invasion in pancreatic adenocarcinoma. Molecular and Cellular Endocrinology, v. 611, p. 10-pg., 2026-01-01. (18/14933-2, 23/05005-2, 22/02605-6)

FRAGA, CARLOS ALBERTO DE CARVALHO; TIBURSKE, LEANDRO; DA SILVA, GABRIEL VICTOR LUCENA; SIMIZO, ADRIANA; DE MORAIS, MAURO CESAR CAFUNDO; DUARTE, ANA KELLY DA SILVA FERNANDES; GARCIA, HENRY DAVID MOGOLLON; HIRATA, THIAGO DOMINGUEZ CRESPO; NAKAYA, HELDER I.. Revealing shared molecular drivers of brain metastases from distinct primary tumors. Brain Research, v. 1851, p. 10-pg., 2025-02-08. (18/14933-2, 22/02605-6)

CHAVES, BEATRIZ; SILVA, JUAN CARLO; NAKAYA, HELDER; SOCQUET-JUGLARD, NICOLAS; BUCCIARELLI, FLORENCE; PRUNIER, GUILHEN; ALMEIDA, MATHEUS V.; LACOUTURE, CLAIRE; KARI, SANIYA; ASTIER, ANNE L.; et al. In vitro morphological profiling of T cells predicts clinical response to natalizumab therapy in patients with multiple sclerosis. NATURE COMMUNICATIONS, v. 16, n. 1, p. 15-pg., 2025-07-01. (19/27139-5, 18/14933-2)

LUBIANA, TIAGO; NAKAYA, HELDER I.. A reasonable request for true data sharing. LANCET REGIONAL HEALTH-AMERICAS, v. 35, p. 2-pg., 2024-05-28. (19/26284-1, 18/14933-2)

CARVALHO, PATRICIA CONCEICAO GONZALEZ DIAS; HIRATA, THIAGO DOMINGUEZ CRESPO; ALVES, LEANDRO YUKIO MANO; MOSCARDINI, ISABELLE FRANCO; DO NASCIMENTO, ANA PAULA BARBOSA; COSTA-MARTINS, ANDRE G.; SORGI, SARA; HARANDI, ALI M.; FERREIRA, DANIELA M.; VIANELLO, ELEONORA; et al. Baseline gene signatures of reactogenicity to Ebola vaccination: a machine learning approach across multiple cohorts. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 14, p. 10-pg., 2023-11-08. (18/14933-2)

CAFUNDO MORAIS, MAURO CESAR; SILVA, DIOGO; MILAGRE, MATHEUS MARQUES; DE OLIVEIRA, MAYKON TAVARES; PEREIRA, THAIS; SILVA, JOAO SANTANA; COSTA, LUCIANO DA F.; MINOPRIO, PAOLA; CESAR JUNIOR, ROBERTO MARCONDES; GAZZINELLI, RICARDO; et al. Automatic detection of the parasite Trypanosoma cruzi in blood smears using a machine learning approach applied to mobile phone images. PeerJ, v. 10, p. 19-pg., 2022-05-27. (20/12017-9, 18/14933-2)

JEAN PIERRE SCHATZMANN PERON; HELDER NAKAYA. Susceptibility of the Elderly to SARS-CoV-2 Infection: ACE-2 Overexpression, Shedding, and Antibody-dependent Enhancement (ADE). Clinics, v. 75, 2020-05-15. (17/50137-3, 13/08216-2, 17/22504-1, 17/26170-0, 18/21934-5, 18/14933-2, 12/19278-6)

FERNANDES, CAMILA FELIX DE LIMA; LOPES, MARILENE HOHMUTH; SOUZA, MARIA CLARA DA SILVA; SOARES, SAMUEL RIBEIRO; AREVALO-ROMERO, JENNY ANDREA; LACKIE, RACHEL E.; COELHO, BARBARA PARANHOS; DE ARAUJO, JOAO PEDRO ALVES; BOCCACINO, JACQUELINE MARCIA; IGLESIA, REBECA PIATNICZKA; et al. Stress-inducible phosphoprotein 1 (STIP1) is a critical stemness regulator in mouse embryonic stem cells and early mammalian development. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 8, n. 1, p. 16-pg., 2025-08-29. (14/17385-5, 20/10671-3, 19/12710-9, 19/00341-9, 20/05443-1, 21/13070-3, 21/05287-2, 19/14952-0, 19/11097-1, 22/14445-3, 19/14741-9, 22/08106-1, 18/15557-4, 18/14933-2, 21/13114-0, 17/26158-0, 19/06971-4, 11/13906-2)

BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, AUG 2020. (13/08216-2, 18/21934-5, 17/50137-3, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/22504-1, 17/21363-5, 18/14933-2, 19/06372-3)

PINTO, BRUNA G. G.; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; SINGH, YOUVIKA; JIMENEZ, LEANDRO; GONCALVES, ANDRE N. A.; OGAVA, RODRIGO L. T.; CREIGHTON, RACHEL; SCHATZMANN PERON, JEAN PIERRE; NAKAYA, I, HELDER. ACE2 Expression Is Increased in the Lungs of Patients With Comorbidities Associated With Severe COVID-19. Journal of Infectious Diseases, v. 222, n. 4, p. 556-563, AUG 15 2020. (12/19278-6, 18/14933-2, 18/21934-5, 13/08216-2, 17/50137-3)

ARIAS-CARRASCO, RAUL; GIDDALURU, JEEVAN; CARDOZO, LUCAS E.; MARTINS, FELIPE; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, HELDER I.. OUTBREAK: a user-friendly georeferencing online tool for disease surveillance. Biological Research, v. 54, n. 1, JUL 8 2021. (18/14933-2, 13/08216-2, 19/16419-7, 18/21934-5, 17/50137-3)

JIMENEZ, LEANDRO; CODO, ANA CAMPOS; SAMPAIO, VANDERSON DE SOUZA; OLIVEIRA, ANTONIO E. R.; KOBO FERREIRA, LUCAS KAORU; DAVANZO, GUSTAVO GASTAO; MONTEIRO, LAUAR DE BRITO; VIRGILIO-DA-SILVA, JOAO VICTOR; SILVA BORBA, MAYLA GABRIELA; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; et al. Acid pH Increases SARS-CoV-2 Infection and the Risk of Death by COVID-19. FRONTIERS IN MEDICINE, v. 8, AUG 20 2021. (18/14933-2, 20/04836-0)

ARAUJO, JOSE DENEY; SANTOS-E-SILVA, JUAN CARLO; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; SAMPAIO, VANDERSON; CASTRO, DANIEL BARROS DE; SOUZA, ROBSON F. DE; GIDDALURU, JEEVAN; RAMOS, PABLO IVAN P.; PITA, ROBESPIERRE; BARRETO, MAURICIO L.; et al. Tucuxi-BLAST: Enabling fast and accurate record linkage of large-scale health-related administrative databases through a DNA-encoded approach. PeerJ, v. 10, p. 17-pg., 2022-07-11. (18/14933-2, 19/27139-5)

ALVES, EDUARDO; NAKAYA, HELDER; GUIMARES, EUZEBIO; GARCIA, CELIA R. S.. Combining IP3 affinity chromatography and bioinformatics reveals a novel protein-IP3 binding site on Plasmodium falciparum MDR1 transporter*. CURRENT RESEARCH IN MICROBIAL SCIENCES, v. 4, p. 7-pg., 2022-12-19. (17/08684-7, 18/14933-2, 18/07177-7)

CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; et al. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. (20/04558-0, 16/00194-8, 19/21301-5, 18/14389-0, 18/14933-2, 17/13981-0, 20/04836-0, 18/25468-9, 16/18445-7, 18/09383-3, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 19/24251-9)

LUSCHER-DIAS, THOMAZ; SIQUEIRA DALMOLIN, RODRIGO JULIANI; AMARAL, PAULO DE PAIVA; ALVES, TIAGO LUBIANA; SCHUCH, VIVIANE; FRANCO, GLORIA REGINA; NAKAYA, HELDER I.. The evolution of knowledge on genes associated with human diseases. ISCIENCE, v. 25, n. 1, p. 22-pg., 2022-01-21. (18/14933-2, 18/21934-5)

LUBIANA, TIAGO; LOPES, RAFAEL; MEDEIROS, PEDRO; SILVA, JUAN CARLO; GONCALVES, ANDRE NICOLAU AQUIME; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS; NAKAYA, HELDER I.. Ten quick tips for harnessing the power of ChatGPT in computational biology. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 19, n. 8, p. 9-pg., 2023-08-01. (19/27139-5, 19/26284-1, 18/14933-2)

BRANDAO, W. N.; DE OLIVEIRA, M. G.; ANDREONI, R. T.; NAKAYA, H.; FARIAS, A. S.; PERON, J. P. S.. Neuroinflammation at single cell level: What is new?. Journal of Leukocyte Biology, v. 108, n. 4, p. 9-pg., 2020-08-10. (17/22504-1, 13/08216-2, 18/14933-2, 19/06372-3, 17/21363-5, 17/26170-0, 12/19278-6, 17/50137-3, 18/21934-5)

AQUIME GONCALVES, ANDRE NICOLAU; MASO, VANESSA ESCOLANO; SANTOS DE CASTRO, ICARO MAIA; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; TOMIO OGAVA, RODRIGO LUIZ; NAKAYA, HELDER, I. High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions. JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS, v. N/A, n. 181, p. 22-pg., 2022-03-01. (18/14933-2, 13/08216-2, 19/13880-5, 19/16418-0, 19/27146-1, 12/19278-6, 20/05284-0, 17/50137-3, 18/21934-5)

MONTEIRO, CINTIA J.; DUARTE, MAX J.; MACHADO, MAYARA CRISTINA V.; MASCARENHAS, ROMARIO S.; PALMA, PATRICIA V. BONINI; GARCIA, HENRY D. MOGOLLON; NAKAYA, HELDER I.; CUNHA, THIAGO M.; DONADI, EDUARDO A.; PASSOS, GERALDO A.. The single-cell transcriptome of mTECs and CD4⁺ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 15, p. 18-pg., 2024-08-26. (18/14933-2, 20/09664-2, 21/02081-4, 17/10780-4)

COSTA-GOUVEA, TIFFANY B. L.; FRANCOSO, KATIA S.; MARQUES, RODOLFO F.; GIMENEZ, ALBA MARINA; FARIA, ANA C. M.; CARISTE, LEONARDO M.; DOMINGUEZ, MARIANA R.; VASCONCELOS, JOSE RONNIE C.; NAKAYA, HELDER I.; SILVEIRA, EDUARDO L. V.; et al. Poly I:C elicits broader and stronger humoral and cellular responses to a Plasmodium vivax circumsporozoite protein malaria vaccine than Alhydrogel in mice. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 15, p. 15-pg., 2024-04-08. (19/06494-1, 14/18102-7, 18/14933-2, 17/11931-6, 19/25373-0, 12/13032-5)

VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; SANTOS E SILVA, JUAN CARLO; SIMIZO, ADRIANA; AVILA, JONATHAN PENA; GOLDSTEIN, GABRIEL NASSAR REICH; DE OLIVEIRA, PEDRO HENRIQUE PRADO; GARCIA, HENRY MOGOLLON; DE CARVALHO FRAGA, CARLOS ALBERTO; NAKAYA, HELDER, I. Sex-Based Differences in Thyroid Plasma B Cell Infiltration: Implications for Autoimmune Disease Susceptibility. Endocrinology, v. 165, n. 12, p. 6-pg., 2024-11-20. (18/14933-2, 19/27146-1, 19/27139-5, 23/13452-9)

AGUIAR, RENATO S.; POHL, FABIO; MORAIS, GUILHERME L.; NOGUEIRA, FABIO C. S.; DE CARVALHO, JOSEANE B.; GUIDA, LETICIA; ARGE, LUIS W. P.; MELO, ADRIANA; MOREIRA, MARIA E. L.; CUNHA, DANIELA P.; et al. Molecular alterations in the extracellular matrix in the brains of newborns with congenital Zika syndrome. SCIENCE SIGNALING, v. 13, n. 635, p. 13-pg., 2020-06-09. (13/08216-2, 17/50137-3, 18/14933-2, 18/21934-5, 12/19278-6)

LIMA, THAIS S. A.; CORSI-ZUELLI, FABIANA; SOUZA, ADRIANA J.; COLODETE, DEBORA A. E.; DA SILVA, NAIELLY RODRIGUES; VERZA, FLAVIA A.; DEAKIN, BILL; DEL-BEL, ELAINE A.; LOUZADA-JUNIOR, PAULO; DEL-BEN, CRISTINA MARTA; et al. Low-dose methotrexate as a potential treatment for schizophrenia via astrocytic and neuroimmune modulation. SCHIZOPHRENIA RESEARCH, v. 284, p. 10-pg., 2025-07-31. (18/14933-2, 18/17597-3, 23/16182-2, 13/08216-2, 19/13229-2, 21/07448-3)

NAKAYA, HELDER I.; THAKAR, JUILEE; MARACAJA-COUTINHO, VINICIUS. Editorial: User-Friendly Tools Applied to Genetics or Systems Biology. FRONTIERS IN GENETICS, v. 11, p. 2-pg., 2020-09-09. (18/14933-2)

PERON, J. P. S.; NAKAYA, H., I; SCHLINDWEIN, M. A. M.; GONCALVES, M. V. M.. COVID-19 Pandemic and Dysbiosis: Can the Ivermectin Hysteria Lead to an Increase of Autoimmune Neuroinflammatory Diseases?. CRITICAL REVIEWS IN IMMUNOLOGY, v. 40, n. 6, p. 6-pg., 2020-01-01. (17/22504-1, 19/06372-3, 13/08216-2, 17/21363-5, 18/14933-2, 18/21934-5, 12/19278-6)

GONZALEZ-DIAS, PATRICIA; LEE, EVA K.; SORGI, SARA; DE LIMA, DIOGENES S.; URBANSKI, ALYSSON H.; SILVEIRA, EDUARDO LV; NAKAYA, HELDER I.. Methods for predicting vaccine immunogenicity and reactogenicity. HUMAN VACCINES & IMMUNOTHERAPEUTICS, v. 16, n. 2, DEC 2019. (13/08216-2, 18/21934-5, 18/14933-2)