Mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em eucariotos

• Processo: 18/23693-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de julho de 2019 - 30 de junho de 2024
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Sergio Verjovski Almeida
• Beneficiário: Sergio Verjovski Almeida
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Chao Yun Irene Yan ; Christoph Grunau ; Eliana Nakano ; Felipe Cesar Ferrarezi Beckedorff ; João Carlos Setubal ; Jorge Elias Kalil Filho ; Mayana Zatz ; Murilo Sena Amaral ; Ronaldo de Carvalho Augusto
• Auxílios(s) vinculado(s): 22/05770-8 - ICOPA 2022 15o Congresso internacional de Parasitologia, AR.EXT
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/13698-2 - Caracterização funcional do lincRNA PVT1 associado ao receptor de andrógeno em Câncer de próstata, BP.IC; 21/06005-0 - Identificação de RNAs longos não-codificadores envolvidos no programa de regulação do desenvolvimento celular de trofoblastos humanos, BP.DR; 20/02976-9 - Caracterização dos sítios de interação no genoma do lincRNA PVT1 associado ao receptor de andrógeno em linhagem de Câncer de Próstata, BP.PD
• Assunto(s): Regulação da expressão gênica Epigênese genética Schistosoma mansoni Diferenciação celular RNAs não codificadores Eucariotos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: células humanas | epigenética | expressão gênica em larga-escala | regulação da diferenciação celular | RNAs não-codificadores | Schistosoma mansoni | Regulação da expressão gênica

Resumo

Nos últimos anos, com a intensa utilização do sequenciamento em larga-escala em substituição aos microarranjos para detecção da expressão gênica em diversos organismos, ficou evidente que, em todos os eucariotos até agora estudados, milhares de RNAs longos (> 200 nucleotídeos) não-codificadores de proteínas (lncRNAs) representam uma classe tecido-específica e muito diversa de RNAs em uma célula. Apesar disso, apenas cerca de quatro dezenas de lncRNAs em humanos tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados em detalhe, o que tem revelado seu papel como reguladores da transcrição gênica em eucariotos. O desafio atual ainda continua sendo encontrar os modelos experimentais e os processos celulares mais relevantes, buscar lncRNAs que sejam alvos chave nestes processos, e mostrar a perda e o ganho de função, em um determinado tipo celular ou órgão, quando a transcrição de um destes lncRNAs é reprimida ou ele é super-expresso. O projeto aqui proposto focaliza processos celulares relevantes em duas espécies, o homem e o parasita Schistosoma mansoni, que têm sido o interesse de estudo de nosso grupo nos últimos 15 anos. Em humanos, estudaremos a participação de lncRNAs nos programas de diferenciação de células-tronco embrionárias humanas para células do córtex neural, e para trofoblastos da placenta, e a participação de lncRNAs na regulação por andrógeno do câncer de próstata. Em S. mansoni estudaremos o papel dos lncRNAs na maturação sexual dos parasitas, na resposta dos parasitas a drogas, e a participação de lncRNAs durante a morte de parasitas in vitro, induzida pela ação de soro imune de macacos Rhesus infectados que se auto-curaram da doença. O projeto tem a vantagem de já haver obtido resultados preliminares sobre certos novos lncRNAs que são candidatos a possuir papéis reguladores sobre alguns destes processos biológicos. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico, e a detecção em paralelo das modificações de marcas da cromatina e da atividade transcricional de genes, aqui propostas, permitirão entender o papel regulatório de lncRNAs, e o conhecimento desses mecanismos de regulação poderá abrir portas para o eventual uso desses lncRNAs como alvos terapêuticos. (AU)

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

AMARAL, MURILO SENA; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; GOMES, ROSELANE PAIVA; OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; KALIL, JORGE E.; ZATZ, MAYANA; et al. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 8, AUG 2020. (14/03620-2, 13/08028-1, 14/50931-3, 18/23693-5)

AMARAL, MURILO S.; MACIEL, LUCAS F.; SILVEIRA, GILBERT O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; LEITE, JOAO V. P.; IMAMURA, LUCAS K.; PEREIRA, ADRIANA S. A.; MIYASATO, PATRICIA A.; NAKANO, ELIANA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Long non-coding RNA levels can be modulated by 5-azacytidine in Schistosoma mansoni. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, DEC 9 2020. (18/19591-2, 18/23693-5, 16/10046-6, 18/24015-0)

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AMARAL, MURILO SENA; SANTOS, DAISY WOELLNER; PEREIRA, ADRIANA S. A.; TAHIRA, ANA CAROLINA; MALVEZZI, JOAO V. M.; MIYASATO, PATRICIA AOKI; FREITAS, RAFAELA DE PAULA; KALIL, JORGE; FAT, ELISA M. TJON KON; DE DOOD, CLAUDIA J.; et al. Rhesus macaques self-curing from a schistosome infection can display complete immunity to challenge. NATURE COMMUNICATIONS, v. 12, n. 1, OCT 26 2021. (16/10046-6, 15/06366-2, 19/09404-3, 18/15049-9, 18/18117-5, 18/23693-5)

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MACIEL, LUCAS F.; MORALES-VICENTE, DAVID A.; SILVEIRA, GILBERT O.; RIBEIRO, RAPHAEL O.; OLBERG, GIOVANNA G. O.; PIRES, DAVID S.; AMARAL, MURILO S.; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, SEP 12 2019. (14/03620-2, 17/22379-2, 18/24015-0, 18/23693-5)