Resumo
Nos últimos anos, com a intensa utilização do sequenciamento em larga-escala em substituição aos microarranjos para detecção da expressão gênica em diversos organismos, ficou evidente que, em todos os eucariotos até agora estudados, milhares de RNAs longos (> 200 nucleotídeos) não-codificadores de proteínas (lncRNAs) representam uma classe tecido-específica e muito diversa de RNAs em uma célula. Apesar disso, apenas cerca de quatro dezenas de lncRNAs em humanos tiveram seus mecanismos moleculares de ação identificados e caracterizados em detalhe, o que tem revelado seu papel como reguladores da transcrição gênica em eucariotos. O desafio atual ainda continua sendo encontrar os modelos experimentais e os processos celulares mais relevantes, buscar lncRNAs que sejam alvos chave nestes processos, e mostrar a perda e o ganho de função, em um determinado tipo celular ou órgão, quando a transcrição de um destes lncRNAs é reprimida ou ele é super-expresso. O projeto aqui proposto focaliza processos celulares relevantes em duas espécies, o homem e o parasita Schistosoma mansoni, que têm sido o interesse de estudo de nosso grupo nos últimos 15 anos. Em humanos, estudaremos a participação de lncRNAs nos programas de diferenciação de células-tronco embrionárias humanas para células do córtex neural, e para trofoblastos da placenta, e a participação de lncRNAs na regulação por andrógeno do câncer de próstata. Em S. mansoni estudaremos o papel dos lncRNAs na maturação sexual dos parasitas, na resposta dos parasitas a drogas, e a participação de lncRNAs durante a morte de parasitas in vitro, induzida pela ação de soro imune de macacos Rhesus infectados que se auto-curaram da doença. O projeto tem a vantagem de já haver obtido resultados preliminares sobre certos novos lncRNAs que são candidatos a possuir papéis reguladores sobre alguns destes processos biológicos. A aplicação de novas tecnologias para detectar a interação entre lncRNAs, proteínas e seus possíveis sítios de ligação no DNA genômico, e a detecção em paralelo das modificações de marcas da cromatina e da atividade transcricional de genes, aqui propostas, permitirão entender o papel regulatório de lncRNAs, e o conhecimento desses mecanismos de regulação poderá abrir portas para o eventual uso desses lncRNAs como alvos terapêuticos. (AU)
Publicações científicas
(5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
AMARAL, MURILO S.;
MACIEL, LUCAS F.;
SILVEIRA, GILBERT O.;
OLBERG, GIOVANNA G. O.;
LEITE, JOAO V. P.;
IMAMURA, LUCAS K.;
PEREIRA, ADRIANA S. A.;
MIYASATO, PATRICIA A.;
NAKANO, ELIANA;
VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO.
Long non-coding RNA levels can be modulated by 5-azacytidine in Schistosoma mansoni.
SCIENTIFIC REPORTS,
v. 10,
n. 1
DEC 9 2020.
Citações Web of Science: 0.
AMARAL, MURILO SENA;
GOULART, ERNESTO;
CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS;
MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM;
SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA;
GOMES, ROSELANE PAIVA;
OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA;
ASTRAY, RENATO MANCINI;
KALIL, JORGE E.;
ZATZ, MAYANA;
VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO.
Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins.
PLoS Neglected Tropical Diseases,
v. 14,
n. 8
AUG 2020.
Citações Web of Science: 0.
MACIEL, LUCAS F.;
MORALES-VICENTE, DAVID A.;
SILVEIRA, GILBERT O.;
RIBEIRO, RAPHAEL O.;
OLBERG, GIOVANNA G. O.;
PIRES, DAVID S.;
AMARAL, MURILO S.;
VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO.
Weighted Gene Co-Expression Analyses Point to Long Non-Coding RNA Hub Genes at Different Schistosoma mansoni Life-Cycle Stages.
FRONTIERS IN GENETICS,
v. 10,
SEP 12 2019.
Citações Web of Science: 0.