Elucidação de mecanismos genéticos envolvidos na hidrólise de biomassa vegetal por meio de genômica funcional

• Processo: 18/19660-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Anete Pereira de Souza
• Beneficiário: Anete Pereira de Souza
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Trichoderma harzianum Proteínas recombinantes Transcriptômica Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: degradação de celulose | expressão gênica | proteína recombinante | Transcriptômica | Trichoderma harzianum | Genética e Genômica de Microrganismos

Resumo

O gênero Trichoderma é de grande importância biotecnológica devido, à capacidade, que os fungos deste grupo apresentam na degradação de substratos celulósicos e geração de açúcares livres, que podem por sua vez ser explorados para a produção de biocombustível, com especial atenção para a bioetanol. Neste contexto o presente projeto tem como principal objetivo realizar um estudo sistemático focando no genoma funcional de diferentes espécies pertencentes ao gênero Trichoderma, incluindo: T. harzianum IOC-3844, T. harzianum CBMAI-0179, T. reesei CBMAI-0711 e T. atroviride CBMAI-0020, visando estabelecer as bases genéticas relacionadas com a eficácia do metabolismo de carboidratos. Para isso, dados de genômica estrutural gerados por meio da construção de bibliotecas de BACs especificas para cada linhagem serão correlacionados com dados de RNA-Seq dos fungos crescidos em condições de degradação de biomassa a fim de analisar o nível de expressão/regulação dos genes alvos. Com os resultados de expressão gênica, redes de co-regulação gênica serão construídas, uma vez que estas evidenciam quais as relações de regulação entre os diferentes genes. Uma vez obtidas essas redes, a busca por genes alvo será realizada a fim de identificar genes candidatos a ação de fatores de transcrição relacionados a vias de catabolismo de carboidratos, afim de buscar por mecanismos/genes comuns compartilhados entre as espécies. Ademais, pretende-se caracterizar bioquimicamente esses gene-alvos com estudos de expressão hieróloga de proteínas. Dessa forma, o presente estudo propõe adicionar novas informações quanto ao mecanismo genético relacionado ao processo de degradação de biomassa em Trichoderma spp., permitindo a identificação de genes chave para o desenvolvimento/melhoria de coquetéis enzimáticos destinados a produção de bioetanol. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FERREIRA FILHO, JAIRE A.; ROSOLEN, RAFAELA R.; ALMEIDA, DEBORAH A.; DE AZEVEDO, PAULO HENRIQUE C.; MOTTA, MARIA LORENZA L.; AONO, ALEXANDRE H.; DOS SANTOS, CLELTON A.; HORTA, MARIA AUGUSTA C.; DE SOUZA, ANETE P.. Trends in biological data integration for the selection of enzymes and transcription factors related to cellulose and hemicellulose degradation in fungi. 3 BIOTECH, v. 11, n. 11, NOV 2021. (15/09202-0, 19/03232-6, 20/13420-1, 18/19660-4, 20/10536-9)

ROSOLEN, RAFAELA ROSSI; AONO, ALEXANDRE HILD; ALMEIDA, DEBORAH AIRES; FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; HORTA, MARIA AUGUSTA CRIVELENTE; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Network Analysis Reveals Different Cellulose Degradation Strategies Across Trichoderma harzianum Strains Associated With XYR1 and CRE1. FRONTIERS IN GENETICS, v. 13, p. 19-pg., 2022-02-24. (18/19660-4, 20/13420-1, 15/09202-0, 19/03232-6)

LEAL MOTTA, MARIA LORENZA; FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; DE MELO, RICARDO RODRIGUES; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. A novel fungal metal-dependent alpha-l-arabinofuranosidase of family 54 glycoside hydrolase shows expanded substrate specificity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, MAY 26 2021. (17/14253-9, 15/09202-0, 18/19660-4, 16/19775-0, 19/08855-1)

ROSOLEN, RAFAELA ROSSI; HORTA, MARIA AUGUSTA CRIVELENTE; DE AZEVEDO, PAULO HENRIQUE CAMPITELI; DA SILVA, CARLA CRISTINA; SFORCA, DANILO AUGUSTO; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Whole-genome sequencing and comparative genomic analysis of potential biotechnological strains of Trichoderma harzianum, Trichoderma atroviride, and Trichoderma reesei. Molecular Genetics and Genomics, v. 298, n. 3, p. 20-pg., 2023-04-05. (15/09202-0, 18/19660-4, 20/13420-1, 20/10536-9)

FERREIRA FILHO, JAIRE A.; HORTA, MARIA AUGUSTA C.; DOS SANTOS, CLELTON A.; ALMEIDA, DEBORAH A.; MURAD, NATALIA F.; MENDES, JULIANO S.; SFORCA, DANILO A.; SILVA, CLAUDIO BENICIO C.; CRUCELLO, ALINE; DE SOUZA, ANETE P.. "Integrative genomic analysis of the bioprospection of regulators and accessory enzymes associated with cellulose degradation in a filamentous fungus (Trichoderma harzianum)". BMC Genomics, v. 21, n. 1, p. 14-pg., 2020-11-02. (14/18856-1, 16/19775-0, 17/17782-2, 17/26781-0, 18/19660-4, 15/09202-0)

FERREIRA FILHO, JAIRE A.; HORTA, MARIA AUGUSTA C.; DOS SANTOS, CLELTON A.; ALMEIDA, DEBORAH A.; MURAD, NATALIA F.; MENDES, JULIANO S.; SFORCA, DANILO A.; SILVA, CLAUDIO BENICIO C.; CRUCELLO, ALINE; DE SOUZA, ANETE P.. ``Integrative genomic analysis of the bioprospection of regulators and accessory enzymes associated with cellulose degradation in a filamentous fungus (Trichoderma harzianum){''}. BMC Genomics, v. 21, n. 1, NOV 2 2020. (17/26781-0, 17/17782-2, 15/09202-0, 18/19660-4, 16/19775-0, 14/18856-1)