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Elucidação de mecanismos genéticos envolvidos na hidrólise de biomassa vegetal por meio de genômica funcional

Processo: 18/19660-4
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de julho de 2019 - 30 de junho de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Anete Pereira de Souza
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Trichoderma harzianum  Proteínas recombinantes  Transcriptômica  Expressão gênica 

Resumo

O gênero Trichoderma é de grande importância biotecnológica devido, à capacidade, que os fungos deste grupo apresentam na degradação de substratos celulósicos e geração de açúcares livres, que podem por sua vez ser explorados para a produção de biocombustível, com especial atenção para a bioetanol. Neste contexto o presente projeto tem como principal objetivo realizar um estudo sistemático focando no genoma funcional de diferentes espécies pertencentes ao gênero Trichoderma, incluindo: T. harzianum IOC-3844, T. harzianum CBMAI-0179, T. reesei CBMAI-0711 e T. atroviride CBMAI-0020, visando estabelecer as bases genéticas relacionadas com a eficácia do metabolismo de carboidratos. Para isso, dados de genômica estrutural gerados por meio da construção de bibliotecas de BACs especificas para cada linhagem serão correlacionados com dados de RNA-Seq dos fungos crescidos em condições de degradação de biomassa a fim de analisar o nível de expressão/regulação dos genes alvos. Com os resultados de expressão gênica, redes de co-regulação gênica serão construídas, uma vez que estas evidenciam quais as relações de regulação entre os diferentes genes. Uma vez obtidas essas redes, a busca por genes alvo será realizada a fim de identificar genes candidatos a ação de fatores de transcrição relacionados a vias de catabolismo de carboidratos, afim de buscar por mecanismos/genes comuns compartilhados entre as espécies. Ademais, pretende-se caracterizar bioquimicamente esses gene-alvos com estudos de expressão hieróloga de proteínas. Dessa forma, o presente estudo propõe adicionar novas informações quanto ao mecanismo genético relacionado ao processo de degradação de biomassa em Trichoderma spp., permitindo a identificação de genes chave para o desenvolvimento/melhoria de coquetéis enzimáticos destinados a produção de bioetanol. (AU)