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Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu

Processo: 18/19216-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de junho de 2019 - 31 de maio de 2023
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Nedenia Bonvino Stafuzza
Beneficiário:Nedenia Bonvino Stafuzza
Instituição-sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
Pesq. associados:Adhemar Zerlotini Neto ; Breno de Oliveira Fragomeni ; Claudia Cristina Paro de Paz ; Daniela Andressa Lino Lourenco ; Fernando Sebastián Baldi Rey
Vinculado ao auxílio:17/50339-5 - Plano de desenvolvimento institucional de pesquisa do Instituto de Zootecnia (PDIp), AP.PDIP
Bolsa(s) vinculada(s):20/03699-9 - Fenotipagem Pará termotolerância, eficiência alimentar e resistência a carrapatos Èm bovinos Caracu, BP.TT
19/17251-2 - Banco de dados fenotípicos para características de adaptabilidade e produção em bovinos Caracu, BP.TT
19/10438-0 - Análise integrada dò transcriptoma e proteoma Pará identificação dè biomarcadores Pará eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato Èm bovinos Caracu, BP.JP
Assunto(s):Genômica  Análise de sequência de RNA  Proteômica  Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)  Bos taurus taurus  Gado Caracu  Transcriptoma  Proteoma  Biomarcadores  Eficiência alimentar  Doenças transmitidas por carrapatos 

Resumo

Caracu é uma raça taurina adaptada ao clima tropical e subtropical brasileiro que mantém as características de qualidade de carne de um taurino, combinada com a habilidade de se desenvolver eficientemente em qualquer região do Brasil. Desse modo, a raça Caracu apresenta um excelente material genético para auxiliar na elucidação dos mecanismos que controlam características complexas. O projeto proposto tem como objetivo identificar biomarcadores para estresse térmico, eficiência alimentar e resistência ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus por meio da análise do transcriptoma integrado de sangue periférico e proteínas plasmáticas de animais da raça Caracu. As amostras de RNA serão obtidas a partir de sangue periférico e bibliotecas de RNA total e de miRNA serão construídas e sequenciadas via HiSeq2500. As análises proteômica serão realizadas por eletroforese em gel (SDS-PAGE) e espectrometria de massa (LC-MS/MS). Os genes mais significantes serão validados por PCR em tempo real. A elucidação dos mecanismos que controlam as características de termotolerância e eficiência alimentar, bem como a compreensão dos mecanismos biológicos responsáveis pelas interações vetor-hospedeiro contribuirão para o desenvolvimento de estratégias inovadoras relacionadas a essas características. Este projeto é pioneiro na descrição do transcriptoma integrado e proteoma da raça Caracu, a partir do qual serão identificados genes, novos alelos, RNAs funcionais, transcritos alternativos, polimorfismos, proteínas e novas isoformas que contribuem para as diferenças fenotípicas observadas para cada uma das características estudadas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LIMA, SERGIO B. G. P. N. P.; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; PIRES, BIANCA V.; BONILHA, SARAH F. M.; CYRILLO, JOSLAINE N. S. G.; NEGRAO, JOAO A.; PAZ, CLAUDIA C. P. Effect of high temperature on physiological parameters of Nelore (Bos taurus indicus) and Caracu (Bos taurus taurus) cattle breeds. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION, v. 52, n. 5 MAR 2020. Citações Web of Science: 0.
PIRES, B. V.; STAFUZZA, N. B.; LIMA, S. B. G. P. N. P.; NEGRAO, J. A.; PAZ, C. C. P. Differential expression of heat shock protein genes associated with heat stress in Nelore and Caracu beef cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 230, DEC 2019. Citações Web of Science: 1.

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