Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue

• Processo: 18/18886-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2026
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Otávio Cabral Marques
• Beneficiário: Otávio Cabral Marques
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Antonio Condino Neto ; Jean Pierre Schatzmann Peron ; Niels Olsen Saraiva Câmara ; Paolo Marinho de Andrade Zanotto ; Vera Lucia Garcia Calich
• Auxílio(s) vinculado(s): 20/07069-0 - Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com COVID-19, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 23/12268-0 - Caracterização sistêmica integrativa das interações neuroimunológicas do Transtorno Depressivo Maior e sua interseção com a síndrome pós-COVID-19, BP.MS; 23/07806-2 - Fundamentação bioinformática das análises sistêmicas e integrativas de infecções virais., BP.TT; 23/06086-6 - Análise integrativa sistêmica de tumores associados às infecções por oncovírus humanos, BP.MS; + mais bolsas vinculadas 23/03841-8 - Investigação holística e funcional das redes de interações neuroimunes durante a fisiopatologia de infecções virais neuroinvasivas, BP.MS; 21/03675-5 - Análise da rede de moléculas associadas ao IFN em pacientes com dengue, BP.IC; 20/16246-2 - Caracterização holística do mecanismo de exaustão dos linfócitos T em pacientes com Zika, BP.DD; 20/11710-2 - Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com Dengue, BP.DD; 20/07972-1 - Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com COVID-19, BP.DD; 20/02237-1 - Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue, BP.IC; 20/01688-0 - Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue, BP.JP - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Imunologia Vírus Zika Dengue Linfócitos T
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dengue | Imunologia sistêmica e integrativa | Linfócitos T | Zika | Imunologia

Resumo

Surtos de arboviroses como Zika e Dengue nas Américas têm levado a um estado de emergência pública internacional. Dentre eles, os vírus da Zika (ZIKA) e da Dengue (DENV) são transmitidos pelo mesmo mosquito vetor (Aedes aegypti), têm co-circulado por todo o mundo e desencadeiam características clínicas comuns. Apesar da gravidade dos problemas de saúde causados por esses agentes etiológicos, o conhecimento a respeito dos mecanismos imunológicos sistêmicos que controlam o desenvolvimento das infeções causadas pelos dois patógenos ainda é escasso. Por conseguinte, inexistem terapias específicas efetivas que combatam essas doenças. Notavelmente, a maioria das pessoas infectadas por ZIKV e DENV são portadoras assintomáticas, sugerindo, desse modo, a influência de fatores imunológicos no controle do desenvolvimento dessas arboviroses. Até o momento, os poucos estudos que previamente caracterizaram a resposta imune sistêmica aos ZIKV e DENV, avaliaram apenas as células apresentadoras de antígenos (APCs, ex: monócitos/macrófagos e células dendríticas), por serem elas as mais permissivas e principal rota de dispersão desses dois arbovírus ao longo do corpo. Porém, a função dos linfócitos T nesse contexto, que são leucócitos efetores e reguladores essenciais da resposta imune, permanece pouco esclarecida. Este projeto objetiva identificar mecanismos reguladores comuns e específicos da resposta imune dos linfócitos T em pacientes na fase convalescente da infeção. Após triagem laboratorial, realizaremos uma abordagem sistêmica e integrada da resposta imune dos linfócitos T CD4+ e CD8+ através de uma análise fenotípica e funcional multiparamétrica, bem como, caracterizaremos estrutural e funcionalmente o proteoma e transcriptoma dessas células. Essa abordagem nos permitirá avaliar o estado de exaustão, definir as assinaturas imunogenéticas, vias de sinalização e redes de interações moleculares (interactoma) comuns e específicas envolvidas na resposta imune aos ZIKV e DENV. Além disso, realizaremos uma metanálise de dados previamente depositados no ArrayExpress e GEO (do inglês, Gene Expression Omnibus) para determinar as redes de co-expressão gênica que regulam sistemicamente a resposta imune aos ZIKV e DENV. A combinação de uma abordagem experimental em larga escala com análises computacionais integrativas promoverá um estudo translacional e multidisciplinar, que além de caracterizar o perfil imunológico da suceptibilidade aos ZIKV e DENV, também poderá identificar novos biomarcadores para o diagnóstico diferencial e desenvolvimento de terapias específicas que reduzam a mortalidade e a morbidade induzidas pelos arbovírus. (AU)

Publicações científicas

(23)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FRANCA, TABATA TAKAHASHI; AL-SBIEI, ASHRAF; BASHIR, GHADA; MOHAMED, YASSIR AWAD; SALGADO, RANIERI COELHO; BARREIROS, LUCILA AKUNE; DA SILVA NAPOLEAO, SARAH MARIA; WEBER, CRISTINA WORM; SEVERO FERREIRA, JANAIRA FERNANDES; ARANDA, CAROLINA SANCHEZ; et al. CD40L modulates transcriptional signatures of neutrophils in the bone marrow associated with development and trafficking. JCI INSIGHT, v. 6, n. 16, AUG 23 2021. (16/22158-3, 20/01688-0, 18/18886-9, 17/04187-9, 20/07069-0)

MOHAMED, KAWTHAR; RZYMSKI, PIOTR; ISLAM, MD SHAHIDUL; MAKUKU, RANGARIRAI; MUSHTAQ, AYESHA; KHAN, AMJAD; IVANOVSKA, MARIYA; MAKKA, SARA A.; HASHEM, FAREEDA; MARQUEZ, LEANDER; et al. OVID-19 vaccinations: The unknowns, challenges, and hope. Journal of Medical Virology, v. 94, n. 4, DEC 2021. (20/07069-0, 18/18886-9, 20/01688-0)

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FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; MARQUES, ALEXANDRE H. C.; VOJDANI, ELROY; HALPERT, GILAD; OSTRINSKI, YURI; BAIOCCHI, GABRIELA CRISPIM; PLACA, DESIREE RODRIGUES; FREIRE, PAULA P.; POUR, SHAHAB ZAKI; et al. Severe COVID-19 patients exhibit elevated levels of autoantibodies targeting cardiolipin and platelet glycoprotein with age: a systems biology approach. NPJ AGING, v. 9, n. 1, p. 14-pg., 2023-08-24. (20/11710-2, 20/09146-1, 20/16246-2, 20/01688-0, 20/07069-0, 20/07972-1, 18/18886-9)

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BORGES, LYSANDRO P.; GUIMARAES, ADRIANA G.; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; FREIRE, PAULA P.; BARRETO, IKARO D. C.; SOUZA, DANIELA R., V; GURGEL, RICARDO Q.; LOPES, ALINE S. A.; DE REZENDE NETO, JOSE MELQUIADES; DOS SANTOS, KEZIA A.; et al. Cross-sectional analysis of students and school workers reveals a high number of asymptomatic SARS-CoV-2 infections during school reopening in Brazilian cities. HELIYON, v. 8, n. 11, p. 11-pg., 2022-11-07. (20/01688-0, 18/18886-9, 20/09146-1, 20/07069-0)

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FRANCA, TABATA TAKAHASHI; BARREIROS, LUCILA AKUNE; SALGADO, RANIERI COELHO; DA SILVA NAPOLEAO, SARAH MARIA; GOMES, LILLIAN NUNES; SEVERO FERREIRA, JANAIRA FERNANDES; PRANDO, CAROLINA; WEBER, CRISTINA WORM; WATANABE DI GESU, REGINA SUMIKO; MONTENEGRO, CECILIA; et al. CD40 Ligand Deficiency in Latin America: Clinical, Immunological, and Genetic Characteristics. JOURNAL OF CLINICAL IMMUNOLOGY, JAN 2022. (20/01688-0, 17/04187-9, 18/18886-9, 16/22158-3)

FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; TORRENTES DE CARVALHO, AMANDA; CUNHA, DANIELA PRADO; MATHIAS DA FONSECA, DENNYSON LEANDRO; EL KHAWANKY, NADIA; FREIRE, PAULA PACCIELLI; CABRAL-MIRANDA, GUSTAVO; SCHIMKE, LENA F.; CAMARA, NIELS OLSEN SARAIVA; OCHS, HANS D.; et al. The clinical spectrum and immunopathological mechanisms underlying ZIKV-induced neurological manifestations. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 8, AUG 2021. (18/18886-9, 20/09146-1, 17/05264-7, 20/01688-0)

CABRAL-MARQUES, OTAVIO; HALPERT, GILAD; SCHIMKE, LENA F.; OSTRINSKI, YURI; VOJDANI, ARISTO; BAIOCCHI, GABRIELA CRISPIM; FREIRE, PAULA PACCIELLI; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; ZYSKIND, ISRAEL; LATTIN, MIRIAM T.; et al. Autoantibodies targeting GPCRs and RAS-related molecules associate with COVID-19 severity. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 12-pg., 2022-03-09. (20/07069-0, 18/18886-9, 20/16246-2, 20/11710-2, 20/07972-1, 20/09146-1, 20/01688-0)

SALGADO, RANIERI COELHO; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; MARQUES, ALEXANDRE H. C.; DA SILVA NAPOLEAO, SARAH MARIA; FRANCA, TABATA TAKAHASHI; AKASHI, KAREN TIEMI; DE SOUZA PRADO, CAROLINE ALIANE; BAIOCCHI, GABRIELA CRISPIM; PLACA, DESIREE RODRIGUES; JANSEN-MARQUES, GABRIEL; et al. The network interplay of interferon and Toll-like receptor signaling pathways in the anti-Candida immune response. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, OCT 13 2021. (20/01688-0, 18/18886-9, 20/07069-0)

DANTAS-KOMATSU, RAQUEL COSTA SILVA; CRUZ, MARINA SAMPAIO; FREIRE, PAULA PACCIELLI; DINIZ, ROSIANE VIANA ZUZA; BORTOLIN, RAUL HERNANDES; CABRAL-MARQUES, OTAVIO; SOUZA, KAMILLA BATISTA DA SILVA; HIRATA, MARIO HIROYUKI; HIRATA, ROSARIO DOMINGUEZ CRESPO; REIS, BRUNA ZAVARIZE; et al. The let-7b-5p, miR-326, and miR-125a-3p are associated with left ventricular systolic dysfunction in post-myocardial infarction. FRONTIERS IN CARDIOVASCULAR MEDICINE, v. 10, p. 11-pg., 2023-05-12. (20/09146-1, 18/18886-9, 20/01688-0, 20/07069-0)

ASGHAR, MUHAMMAD; KHAN, TAJ ALI; SERAPHIN, MARIE NANCY; SCHIMKE, LENA F.; CABRAL-MARQUES, OTAVIO; HAQ, IHTISHAM UL; FAROOQI, ZIA-UR-REHMAN; CAMPINO, SUSANA; ULLAH, IHSAN; CLARK, TAANE G.. Exploring the Antimicrobial Resistance Profile of Salmonella typhi and Its Clinical Burden. ANTIBIOTICS-BASEL, v. 13, n. 8, p. 12-pg., 2024-08-01. (18/18886-9)

BORGES, LYSANDRO PINTO; DE JESUS, PAMELA CHAVES; DE SOUZA, JESSIANE BISPO; SILVA, DEISE MARIA REGO RODRIGUES; MOURA, PEDRO HENRIQUE MACEDO; SANTOS, RONALDY SANTANA; BARRETO, MARINA DOS SANTOS; GUIMARAES, ADRIANA GIBARA; SANTANA, LUCAS ALVES DA MOTA; DA FONSECA, DENNYSON LEANDRO MATHIAS; et al. The Impact of Diabetes Education on Continuous Glucose Monitoring in SUS-Dependent Patients in a Northeastern Brazilian City. LIFE-BASEL, v. 14, n. 3, p. 14-pg., 2024-03-01. (18/18886-9, 23/13356-0)

PLACA, DESIREE RODRIGUES; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; MARQUES, ALEXANDRE H. C.; ZAKI POUR, SHAHAB; USUDA, JULIA NAKANISHI; BAIOCCHI, GABRIELA CRISPIM; PRADO, CAROLINE ALIANE DE SOUZA; SALGADO, RANIERI COELHO; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; FREIRE, PAULA PACCIELLI; et al. Immunological signatures unveiled by integrative systems vaccinology characterization of dengue vaccination trials and natural infection. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 15, p. 17-pg., 2024-02-20. (20/16246-2, 20/07069-0, 20/09146-1, 20/01688-0, 18/18886-9, 20/07972-1, 20/11710-2, 21/03675-5)

BARRETO, MARINA DOS SANTOS; DA SILVA, BEATRIZ SOARES; SANTOS, RONALDY SANTANA; SILVA, DEISE MARIA REGO RODRIGUES; SILVA, ELOIA EMANUELLY DIAS; MOURA, PEDRO HENRIQUE MACEDO; DE SOUZA, JESSIANE BISPO; SANTANA, LUCAS ALVES DA MOTA; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; et al. COVID-19 Vaccination and Serological Profile of a Brazilian University Population. LIFE-BASEL, v. 13, n. 9, p. 14-pg., 2023-09-01. (18/18886-9, 20/16246-2, 23/07806-2)

USUDA, JULIA NAKANISHI; PLACA, DESIREE RODRIGUES; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; MARQUES, ALEXANDRE H. C.; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; CHAVES, VICTOR GABRIEL BASTOS; ADRI, ANNY SILVA; TORRENTES-CARVALHO, AMANDA; HIRATA, MARIO HIROYUKI; FREIRE, PAULA PACCIELLI; et al. Interferome signature dynamics during the anti-dengue immune response: a systems biology characterization. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 14, p. 16-pg., 2023-08-10. (20/16246-2, 20/11710-2, 23/03841-8, 18/18886-9, 21/03675-5)

COUTO, PEDRO S.; AL-ARAWE, NADA; FILGUEIRAS, IGOR S.; FONSECA, DENNYSON L. M.; HINTERSEHER, IRENE; CATAR, RUSAN A.; CHINNADURAI, RAGHAVAN; BERSENEV, ALEXEY; CABRAL-MARQUES, OTAVIO; MOLL, GUIDO; et al. Systematic review and meta-analysis of cell therapy for COVID-19: global clinical trial landscape, published safety/efficacy outcomes, cell product manufacturing and clinical delivery. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 14, p. 24-pg., 2023-06-21. (18/18886-9, 20/16246-2, 20/01688-0, 20/07069-0)

FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; JAEPEL, MAJ; GYAMFI, MICHAEL ADU; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; BAIOCHI, GABRIELA CRISPIM; OSTRINSKI, YURI; HALPERT, GILAD; LAVI, YAEL BUBLIL; VOJDANI, ELROY; SILVA-SOUSA, THAYNA; et al. Dysregulated autoantibodies targeting AGTR1 are associated with the accumulation of COVID-19 symptoms. NPJ SYSTEMS BIOLOGY AND APPLICATIONS, v. 11, n. 1, p. 13-pg., 2025-01-13. (20/16246-2, 19/27139-5, 18/18886-9, 20/01688-0, 23/13356-0, 20/07972-1, 23/12268-0, 23/07806-2, 23/06086-6, 20/09146-1, 20/07069-0)

SILVA-SOUSA, THAYNA; USUDA, JULIA NAKANISHI; AL-ARAWE, NADA; FRIAS, FRANCISCA; HINTERSEHER, IRENE; CATAR, RUSAN; LUECHT, CHRISTIAN; RIESNER, KATARINA; HACKEL, ALEXANDER; SCHIMKE, LENA F.; et al. The global evolution and impact of systems biology and artificial intelligence in stem cell research and therapeutics development: a scoping review. Stem Cells, v. 42, n. 11, p. 16-pg., 2024-10-13. (20/16246-2, 20/07069-0, 23/07806-2, 20/01688-0, 18/18886-9)