Desenho de diferentes fragmentos da proteína de superfície, spike, do SARS-CoV-2, para desenvolvimento de testes rápidos e de vacina

• Processo: 20/04680-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de abril de 2020 - 31 de dezembro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho
• Beneficiário: Cristiane Rodrigues Guzzo Carvalho
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/17303-7 - Estrutura e função de sistemas de secreção bacterianas, AP.TEM
• Auxílios(s) vinculado(s): 22/05691-0 - Análise da dinâmica molecular das variantes do coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave de rápida disseminação e seus efeitos na interação com a enzima de conversão da angiotensina humana 2, PUB.ART
• Assunto(s): COVID-19 SARS-CoV-2 Infecções por Coronavirus Proteínas da membrana Glicoproteína da espícula de Coronavirus Anticorpos Desenvolvimento de vacinas Vacinas contra COVID-19 Expressão gênica Biologia estrutural Pandemias Controle de doenças transmissíveis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: anticorpo | proteína | teste rápido | Vacina | Biologia de macromoléculas e biologia estrutural

Resumo

Nosso grupo de pesquisa em colaboração com o pesquisador Dr. Edison Durigon do ICB USP, estamos desenvolvendo teste rápido para detectar COVID-19. Para isso, nós já conseguimos clonar e expressar 4 fragmentos da proteína de superfície do SARS-CoV-2 e mostramos ser imonogênicos contra o soro de um paciente humano. Para a produção do teste rápido, as proteínas foram produzidas em larga escala para inocular em três animais (rato, coelho e cabra). Iniciamos as inoculações de três proteínas em ratos, cabra e coelho. A previsão é que em 21 dias tenhamos bastante soro para produzir os primeiros testes rápidos. Devido à demanda e à urgência na produção destes fragmentos do spike, estou coordenando um mutirão que envolve também o Prof. Shaker Chuck Farah para produzir os 4 fragmentos de spike em grande quantidade tanto para continuar as inoculações nos animais quanto para fazer outros testes. Também já mandamos sintetizar novos oligos para construção de mais 4 fragmentos da proteína spike do vírus para tentar obter proteínas solúveis para desenvolvimento de vacinas, essa parte do projeto será feita em colaboração com o Prof. Durigon e com a Profa. Ana Marcia também do ICB USP. (AU)

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Quantitative structure-activity relationships, molecular docking and molecular dynamics simulations reveal drug repurposing candidates as potent SARS-CoV-2 main protease inhibitors. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, JUL 2021. (20/04680-0, 19/00195-2, 16/09047-8)

DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Quantitative structure-activity relationships, molecular docking and molecular dynamics simulations reveal drug repurposing candidates as potent SARS-CoV-2 main protease inhibitors. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, v. 40, n. 21, p. 18-pg., 2022-01-01. (19/00195-2, 16/09047-8, 20/04680-0)

MACHADO, RAFAEL R. G.; GLASER, TALITA; ARAUJO, DANIELLE B.; PETIZ, LYVIA LINTZMAIER; OLIVEIRA, DANIELLE B. L.; DURIGON, GIULIANA S.; LEAL, ALESSANDRA L.; PINHO, JOAO RENATO R.; FERREIRA, LUIS C. S.; ULRICH, HENNING; et al. Inhibition of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Replication by Hypertonic Saline Solution in Lung and Kidney Epithelial Cells. ACS PHARMACOLOGY & TRANSLATIONAL SCIENCE, v. 4, n. 5, p. 1514-1527, OCT 8 2021. (20/06409-1, 19/00195-2, 18/07366-4, 17/24769-2, 16/20045-7, 20/04680-0)

DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE FREITAS AMORIM, VITOR MARTINS; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Molecular dynamics simulations of the spike trimeric ectodomain of the SARS-CoV-2 Omicron variant: structural relationships with infectivity, evasion to immune system and transmissibility. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, v. N/A, p. 18-pg., 2022-10-29. (20/04680-0, 21/00070-5, 19/00195-2, 16/09047-8)

VENTURA FERNANDES, BIANCA H.; FEITOSA, NATALIA MARTINS; BARBOSA, ANA PAULA; BOMFIM, CAMILA GASQUE; GARNIQUE, ANALI M. B.; ROSA, IVANA F.; RODRIGUES, MAIRA S.; DORETTO, LUCAS B.; COSTA, DANIEL F.; CAMARGO-DOS-SANTOS, BRUNO; et al. oxicity of spike fragments SARS-CoV-2 S protein for zebrafish: A tool to study its hazardous for human health. Science of The Total Environment, v. 813, MAR 20 2022. (19/00195-2, 18/07098-0, 20/05761-3, 17/17303-7, 20/04680-0, 14/04294-1, 19/21739-0, 19/19939-1, 19/18356-2, 19/14285-3, 19/12234-2)

DE SOUZA, ANACLETO SILVA; AMORIM, VITOR MARTINS DE FREITAS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FELIPE R. C.; DOS SANTOS, FILIPE F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; JUVENAL, GUILHERME DE ARAUJO; HUANG, YIHUA; GE, PINGJU; JIANG, YINAN; et al. Molecular Dynamics Analysis of Fast-Spreading Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants and Their Effects on the Interaction with Human Angiotensin-Converting Enzyme 2. ACS OMEGA, v. 7, n. 35, p. 10-pg., 2022-08-24. (20/06091-1, 17/18246-7, 17/19541-2, 20/04680-0, 19/00195-2, 16/09047-8, 18/15579-8, 18/07366-4, 20/14158-9)

DANIELLE BASTOS ARAUJO; RAFAEL RAHAL GUARAGNA MACHADO; DEYVID EMANUEL AMGARTEN; FERNANDA DE MELLO MALTA; GABRIEL GUARANY DE ARAUJO; CAIRO OLIVEIRA MONTEIRO; ERIKA DONIZETTI CANDIDO; CAMILA PEREIRA SOARES; FERNANDO GATTI DE MENEZES; ANA CAROLINA CORNACHIONI PIRES; et al. SARS-CoV-2 isolation from the first reported patients in Brazil and establishment of a coordinated task network. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz, v. 115, 2020-10-23. (20/06409-1, 16/20045-7, 17/24769-2, 17/25123-9, 18/23680-0, 20/04680-0, 18/21076-9)

DE SOUZA, ANACLETO SILVA; DE FREITAS AMORIM, VITOR MARTINS; GUARDIA, GABRIELA D. A.; DOS SANTOS, FILIPE F.; ULRICH, HENNING; GALANTE, PEDRO A. F.; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; GUZZO, CRISTIANE RODRIGUES. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants of Concern: A Perspective for Emerging More Transmissible and Vaccine-Resistant Strains. Viruses-Basel, v. 14, n. 4, p. 21-pg., 2022-04-01. (18/07366-4, 20/06091-1, 19/00195-2, 16/09047-8, 20/14158-9, 20/04680-0, 17/18246-7, 17/19541-2, 18/15579-8)