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Caracterização de fatores de risco intrínsecos e o desenvolvimento de novas alternativas de diagnóstico e tratamento para COVID-19

Processo: 20/04558-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de abril de 2020 - 31 de março de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Pesquisador responsável:José Luiz Proença Módena
Beneficiário:José Luiz Proença Módena
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/00194-8 - Patogênese e neurovirulência de vírus emergentes no Brasil, AP.JP
Assunto(s):Virologia  Infecções por Coronavirus  COVID-19  SARS-CoV-2  Diversidade genética  Biomarcadores  Metabolômica  Desenvolvimento de fármacos  Antivirais  Técnicas e procedimentos diagnósticos  Pandemias  Controle de doenças transmissíveis 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biomarcadores | Coronavirus | Covid-19 | diversidade genética viral | Ferramentas diagnósticas | SARS-CoV-2 | Virologia

Resumo

A chegada do SARS-CoV-2 no Brasil em março de 2020 impactou de maneira negativa a economia, gerado pânico na população e desestruturado os sistemas de saúde público e privado do nosso país. É evidente a necessidade de métodos de diagnóstico/prognóstico rápido e de alternativas terapêuticas que ajude no enfrentamento dessa pandemia em nosso país. Desse modo, este projeto multidisciplinar e que envolve pesquisadores de diversas unidades da Unicamp e de outras instituições de pesquisa do Brasil e exterior, visa utilizar espécimes clínicos (swab nasofaríngeo, soro e sangue total congelado) já utilizados no diagnóstico e outros exames de rotina e armazenados no Laboratório de Patologia Clínica do HC para: (1) Avaliar a circulação e diversidade genética do Covid-19 em Campinas; (2) Buscar biomarcadores que nos ajude no diagnóstico rápido ou na predição dos casos fatais, usando metodologias de proteômica, metabolômica e imunoensaios multiplex; (3) Identificar novos antivirais através do reposicionamento de fármacos já aprovados para uso em humanos, além de descoberta de novos candidatos a fármacos, por ensaios de triagem computacional e teste de atividade antiviral em cultura de células em laboratório de contenção biológica nível 3. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio::
El virus evoluciona 
O vírus em evolução 
O perigo das novas variantes 
Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
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Publicações científicas (20)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BORIN, ALEXANDRE; COIMBRA, LAIS D.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; NACIUK, FABRICIO F.; FONTOURA, MARINA; SIMEONI, CAMILA L.; GOMES, GIOVANNI, V; AMORIM, MARIENE R.; GRAVINA, HUMBERTO D.; SHIMIZU, JACQUELINE FARINHA; et al. Identification and characterization of the anti-SARS-CoV-2 activity of cationic amphiphilic steroidal compounds. VIRULENCE, v. 13, n. 1, p. 18-pg., . (20/04558-0, 16/00194-8, 19/06459-1)
DE SOUZA, WILLIAM M.; MURARO, STEFANIE P.; SOUZA, GABRIELA F.; AMORIM, MARIENE R.; SESTI-COSTA, RENATA; MOFATTO, LUCIANA S.; FORATO, JULIA; BARBOSA, PRISCILLA P.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; et al. lusters of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 Infection after Vaccination with Adenovirus-Vectored and Inactivated Vaccine. Viruses-Basel, v. 13, n. 11, . (16/00194-8, 18/14389-0, 18/13645-3, 17/26908-0, 20/02159-0, 17/13981-0, 19/09704-7, 18/10224-7, 19/24251-9, 20/04558-0)
CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; et al. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, . (20/04558-0, 16/00194-8, 19/21301-5, 18/14389-0, 18/14933-2, 17/13981-0, 20/04836-0, 18/25468-9, 16/18445-7, 18/09383-3, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 19/24251-9)
RIBEIRO, LUCIANA C.; BENITES, BRUNO DELTREGGIA; ULAF, RAISA G.; NUNES, THYAGO A.; COSTA-LIMA, CAROLINA; ADDAS-CARVALHO, MARCELO; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; GRANJA, FABIANA; DA COSTA, VITOR ANTONIO; SANTOS DUARTE, ADRIANA DA SILVA; et al. Rapid clinical recovery of a SARS-CoV-2 infected common variable immunodeficiency patient following the infusion of COVID-19 convalescent plasma. ALLERGY ASTHMA AND CLINICAL IMMUNOLOGY, v. 17, n. 1, . (20/04558-0, 20/04522-5, 13/07607-8, 16/00194-8)
PASCOAL, LIVIA BITENCOURT; RODRIGUES, PATRICIA BRITO; GENARO, LIVIA MOREIRA; DOS SANTOS PEREIRA GOMES, ARILSON BERNARDO; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL AUGUSTO; PARISE, PIERINA LORENCINI; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; SIMEONI, CAMILA LOPES; GUIMARAES, PAULA VERI; BUSCARATTI, LUCAS ILDEFONSO; et al. Microbiota-derived short-chain fatty acids do not interfere with SARS-CoV-2 infection of human colonic samples. GUT MICROBES, v. 13, n. 1, p. 1-9, . (20/04558-0, 20/04583-4, 20/02448-2, 20/02312-3, 19/14342-7, 20/04746-0, 17/26908-0, 20/04579-7, 20/04919-2, 19/06372-3, 13/07607-8, 20/02159-0)
SABINO, JANINE S.; AMORIM, MARIENE R.; DE SOUZA, WILLIAM M.; MAREGA, LIA F.; MOFATTO, LUCIANA S.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; FORATO, JULIA; STABELI, RODRIGO G.; COSTA, MARIA LAURA; SPILKI, FERNANDO R.; et al. Clearance of Persistent SARS-CoV-2 RNA Detection in a NF kappa B-Deficient Patient in Association with the Ingestion of Human Breast Milk: A Case Report. Viruses-Basel, v. 14, n. 5, p. 10-pg., . (20/04558-0, 18/14389-0, 16/00194-8, 18/14372-0)
RIBEIRO, LUCIANA C.; BENITES, BRUNO DELTREGGIA; ULAF, RAISA G.; NUNES, THYAGO A.; COSTA-LIMA, CAROLINA; ADDAS-CARVALHO, MARCELO; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; GRANJA, FABIANA; DA COSTA, VITOR ANTONIO; SANTOS DUARTE, ADRIANA DA SILVA; et al. Rapid clinical recovery of a SARS-CoV-2 infected common variable immunodeficiency patient following the infusion of COVID-19 convalescent plasma. ALLERGY ASTHMA AND CLINICAL IMMUNOLOGY, v. 17, n. 1, p. 4-pg., . (13/07607-8, 16/00194-8, 20/04522-5, 20/04558-0)
SALGADO, BARBARA BATISTA; MAUES, FABIO CARMONA DE JESUS; JORDAO, MAELE; PEREIRA, RENATO LEMOS; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; PARISE, PIERINA L.; GRANJA, FABIANA; SOUZA, HIGO FERNANDO SANTOS; YAMAMOTO, MARCIO MASSAO; CHIANG, JANNIFER OLIVEIRA; et al. Antibody cross-reactivity and evidence of susceptibility to emerging Flaviviruses in the dengue-endemic Brazilian Amazon. INTERNATIONAL JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, v. 129, p. 10-pg., . (16/00194-8, 20/04558-0)
DE SOUZA, WILLIAM DANILO FERNANDES; ZORZELLA-PEZAVENTO, SOFIA FERNANDA GONCALVES; AYUPE, MARINA CACADOR; SALGADO, CAIO LOUREIRO; OLIVEIRA, BERNARDO DE CASTRO; MOREIRA, FRANCIELLY; DA SILVA, GUILHERME WILLIAM; MURARO, STEFANIE PRIMON; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; et al. Lung Inflammation Induced by Inactivated SARS-CoV-2 in C57BL/6 Female Mice Is Controlled by Intranasal Instillation of Vitamin D. CELLS, v. 12, n. 7, p. 24-pg., . (19/13916-0, 20/04558-0, 19/07771-9, 21/12768-7, 19/12691-4, 21/06881-5)
AMORIM, MARIENE R.; SOUZA, WILLIAM M.; BARROS, JR., ANTONIO C. G.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; SIMEONI, CAMILA L.; PARISE, PIERINA L.; VIEIRA, ALINE; FORATO, JULIA; CLARO, INGRA M.; et al. Respiratory Viral Shedding in Healthcare Workers Reinfected with SARS-CoV-2, Brazil, 2020. Emerging Infectious Diseases, v. 27, n. 6, p. 1737-1740, . (20/04558-0, 16/00194-8, 20/02448-2, 18/14389-0, 17/13981-0, 17/26908-0, 19/24251-9, 20/02159-0)
FARIA, NUNO R.; MELLAN, THOMAS A.; WHITTAKER, CHARLES; CLARO, INGRA M.; CANDIDO, DARLAN DA S.; MISHRA, SWAPNIL; CRISPIM, MYUKI A. E.; SALES, FLAVIA C.; HAWRYLUK, IWONA; MCCRONE, JOHN T.; et al. Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science, v. 372, n. 6544, p. 815+, . (20/04558-0, 19/21568-1, 19/21301-5, 18/14389-0, 17/13981-0, 20/04272-9, 18/25468-9, 16/18445-7, 19/21858-0, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 18/12579-7, 19/24251-9)
SACCON, TATIANA DANDOLINI; MOUSOVICH-NETO, FELIPPE; LUDWIG, RAISSA GUIMARAES; CARREGARI, VICTOR CORASOLLA; DOS ANJOS SOUZA, ANA BEATRIZ; DOS PASSOS, AMANDA STEPHANE CRUZ; MARTINI, MATHEUS CAVALHEIRO; BARBOSA, PRISCILLA PASCHOAL; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; MURARO, STEFANIE PRIMON; et al. SARS-CoV-2 infects adipose tissue in a fat depot- and viral lineage-dependent manner. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 15-pg., . (20/08716-9, 20/04558-0, 19/05155-9, 21/10373-5, 13/07607-8, 20/04919-2, 20/04746-0, 17/01184-9, 17/23920-9, 16/24163-4, 16/00194-8, 18/21635-8, 19/00098-7, 20/05040-4, 17/08264-8, 20/04579-7, 19/26119-0, 19/04726-2, 20/04583-4, 20/15959-5)
BAGNO, FLAVIA F.; ANDRADE, LUIS A. F.; SERGIO, SARAH A. R.; PARISE, PIERINA L.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; GAZZINELLI, RICARDO T.; FERNANDES, ANA P. S. M.; TEIXEIRA, SANTUZA M. R.; GRANJA, FABIANA; PROENCA-MODENA, JOSE L.; et al. Previous Infection with SARS-CoV-2 Correlates with Increased Protective Humoral Responses after a Single Dose of an Inactivated COVID-19 Vaccine. Viruses-Basel, v. 14, n. 3, p. 9-pg., . (16/00194-8, 20/04558-0)
VEGA, MAITE DUHALDE; OLIVERA, DANIELA; DAVANZO, GUSTAVO GASTAO; BERTULLO, MAURICIO; NOYA, VERONICA; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; MURARO, STEFANIE PRIMON; CASTRO, ICARO; AREVALO, ANA PAULA; CRISPO, MARTINA; et al. PD-1/PD-L1 blockade abrogates a dysfunctional innate-adaptive immune axis in critical beta-coronavirus disease. SCIENCE ADVANCES, v. 8, n. 38, p. 13-pg., . (20/04558-0, 20/04579-7)
ANDRADE, LUIS A. F.; BAGNO, FLAVIA F.; SERGIO, SARAH A. R.; PARISE, PIERINA L.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; FERNANDES, ANA P. S. M.; TEIXEIRA, SANTUZA M. R.; GRANJA, FABIANA; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; DA FONSECA, FLAVIO G.. Heterogeneity of humoral response patterns in mildly symptomatic, non-hospitalized COVID-19 patients: A one-year longitudinal study. Experimental Biology and Medicine, v. 248, n. 10, p. 9-pg., . (16/00194-8, 20/04558-0)
CARMO, HELISON RAFAEL P.; YOSHINAGA, MARCOS Y.; CASTILLO, ALEJANDRO ROSELL; CHAVES-FILHO, ADRIANO BRITTO; BONILHA, ISABELLA; BARRETO, JOAQUIM; MURARO, STEFANIE PRIMON; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; DAVANZO, GUSTAVO GASTAO; PERROUD JR, MAURICIO W.; et al. Phenotypic changes in low-density lipoprotein particles as markers of adverse clinical outcomes in COVID-19. MOLECULAR GENETICS AND METABOLISM, v. 138, n. 4, p. 8-pg., . (20/04558-0, 20/12649-5, 16/00194-8, 13/07937-8, 18/17792-0)
RODRIGUES, PATRICIA BRITO; GOMES, GIOVANNI FREITAS; ANGELIM, MONARA K. S. C.; SOUZA, GABRIELA F.; MURARO, STEFANIE PRIMON; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; CRUZ RATTIS, BRUNA AMANDA; PASSOS, AMANDA STEPHANE; PRAL, LAIS PASSARIELO; RODOVALHO, VINICIUS DE REZENDE; et al. Impact of Microbiota Depletion by Antibiotics on SARS-CoV-2 Infection of K18-hACE2 Mice. CELLS, v. 11, n. 16, p. 16-pg., . (20/10282-7, 20/04558-0, 20/05211-3, 19/06372-3, 20/04583-4, 20/04746-0)
BRUNETTI, NATALIA S.; DAVANZO, GUSTAVO G.; DE MORAES, DIOGO; FERRARI, ALLAN J. R.; SOUZA, GABRIELA F.; MURARO, STEFANIE PRIMON; KNITTEL, THIAGO L.; BOLDRINI, VINICIUS O.; MONTEIRO, LAUAR B.; VIRGILIO-DA-SILVA, JOO VICTOR; et al. SARS-CoV-2 uses CD4 to infect T helper lymphocytes. eLIFE, v. 12, p. 26-pg., . (20/04558-0, 15/15626-8, 19/06459-1, 19/04726-2, 19/16116-4, 19/05155-9, 19/13552-8, 16/18031-8, 19/00098-7, 20/04583-4, 16/00194-8, 21/08354-2, 19/17007-4, 19/22398-2, 17/01184-9, 19/14465-1, 20/04579-7, 13/08293-7, 18/14933-2, 17/23920-9, 19/06372-3, 16/24163-4, 16/23328-0, 20/04919-2, 20/04746-0)
CODO, ANA CAMPOS; DAVANZO, GUSTAVO GASTAO; MONTEIRO, LAUAR DE BRITO; DE SOUZA, GABRIELA FABIANO; MURARO, STEFANIE PRIMON; VIRGILIO-DA-SILVA, JOAO VICTOR; PRODONOFF, JULIANA SILVEIRA; CARREGARI, VICTOR CORASOLLA; OLIVEIRA DE BIAGI JUNIOR, CARLOS ALBERTO; CRUNFLI, FERNANDA; et al. Elevated Glucose Levels Favor SARS-CoV-2 Infection and Monocyte Response through a HIF-1 alpha/Glycolysis-Dependent Axis. Cell Metabolism, v. 32, n. 3, p. 15-pg., . (19/00098-7, 20/04558-0, 20/04522-5, 19/06372-3, 16/18031-8, 15/15626-8, 16/23328-0, 17/01184-9, 20/04919-2, 20/04583-4, 20/04579-7, 18/22505-0, 20/04746-0)
BARRETO, ESTER A.; CRUZ, AMANDA S.; VERAS, FLAVIO P.; MARTINS, RONALDO; BERNARDELLI, RAFAELLA S.; PAIVA, ISADORA M.; LIMA, THAIS M.; SINGH, YOUVIKA; GUIMARAES, RAPHAEL C.; DAMASCENO, SAMARA; et al. COVID-19-related hyperglycemia is associated with infection of hepatocytes and stimulation of gluconeogenesis. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 120, n. 21, p. 10-pg., . (16/00194-8, 20/05040-4, 17/08264-8, 20/04558-0)

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