Auxílio à pesquisa 19/19338-8 - Bacteriologia, Infecções por Campylobacter - BV FAPESP
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Genômica, transcriptômica e caracterização fenotipica de linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de diversas fontes durante 20 anos no Brasil

Processo: 19/19338-8
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Pesquisador responsável:Juliana Pfrimer Falcão
Beneficiário:Juliana Pfrimer Falcão
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Bacteriologia  Infecções por Campylobacter  Campylobacter jejuni  Análise de sequência de DNA  Linhagem  Genoma bacteriano  Transcriptoma  Fenótipo  Virulência  Estresse oxidativo  Estresse ácido 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Campylobacter jejuni | Sequenciamento do genoma completo | Testes fenotípicos relacionados a virulência | Transcriptoma | Bacteriologia

Resumo

A campilobacteriose é uma zoonose de ampla distribuição mundial, sendo que a espécie Campylobacter jejuni é uma importante causa de gastroenterite em humanos em vários países da Europa, bem como nos Estados Unidos, Canadá, Austrália, dentre outros. Entretanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. jejuni são reportados com menor frequência, o que dificulta avaliar a importância e dimensão desse patógeno como causador de doença em humanos no nosso país. Esse projeto tem como objetivos analisar e comparar, por meio do sequenciamento do genoma completo, sequenciamento do transcriptoma e de testes fenotípicos relacionados à virulência linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos ao longo de 20 anos no Brasil. A análise comparativa do genoma completo sequenciado será realizada para 116 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (47), animais (35), alimentos (32) e ambiente (02). Para 46 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (18), animais (14) e alimentos (14) serão realizados os testes fenotípicos de flutuação da temperatura, stress ácido e stress oxidativo, virulência em Galleria mellonella, ensaio in vivo utilizando-se membrana corioalantóica de embrião de galinha, invasão a células CACO-2 e multiplicação e sobrevivência em macrófagos de humanos U937. Ademais, será feita a análise do transcriptoma de seis linhagens de C. jejuni que apresentarem diferenças significativas frente aos testes fenotípicos de stress ácido e oxidativo, e os RNAs serão extraídos após submeter as linhagens a cada stress e também em condições ideais de crescimento. Devido à escassez de trabalhos envolvendo linhagens de C. jejuni no nosso país, estudos que objetivem a análise do genoma completo e a elucidação dos possíveis mecanismos de patogenicidade e virulência em tais linhagens são inovadores e de extrema importância. Portanto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização de linhagens de C. jejuni isoladas durante 20 anos no Brasil, colaborando para o entendimento desse patógeno de grande importância mundial. (AU)

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Publicações científicas (15)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SERIBELLI, AMANDA AP.; DA SILVA, PATRICK; DA CRUZ, MARCELO FERREIRA; DE ALMEIDA, FERNANDA; FRAZAO, MILIANE R.; MEDEIROS, MARTA I. C.; RODRIGUES, DALIA DOS P.; KICH, JALUSA D.; DE JESUS BENEVIDES, LEANDRO; SOARES, SIOMAR DE C.; et al. nsights about the epidemiology of Salmonella Typhimurium isolates from different sources in Brazil using comparative genomic. GUT PATHOGENS, v. 13, n. 1, . (16/24716-3, 19/19338-8, 17/06633-6)
VILELA, FELIPE PINHEIRO; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Prevalence of efflux pump and heavy metal tolerance encoding genes among Salmonella enterica serovar Infantis strains from diverse sources in Brazil. PLoS One, v. 17, n. 11, p. 15-pg., . (19/19338-8)
CAMPIONI, FABIO; VILELA, FELIPE PINHEIRO; CAO, GUOJIE; KASTANIS, GEORGE; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; COSTA, RENATA GARCIA; TIBA-CASAS, MONIQUE RIBEIRO; YIN, LANLAN; ALLARD, MARC; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Whole genome sequencing analyses revealed that Salmonella enterica serovar Dublin strains from Brazil belonged to two predominant clades. SCIENTIFIC REPORTS, v. 12, n. 1, p. 6-pg., . (16/05817-3, 16/24716-3, 13/25191-3, 19/19338-8)
VILELA, FELIPE PINHEIRO; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Genomic characterization and antimicrobial resistance profiles of Salmonella enterica serovar Infantis isolated from food, humans and veterinary-related sources in Brazil. Journal of Applied Microbiology, . (19/19338-8, 19/06947-6)
VILELA, FELIPE PINHEIRO; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; FERREIRA, JOSEANE CRISTINA; DA COSTA DARINI, ANA LUCIA; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Genomic characterization of Salmonella enterica serovar Choleraesuis from Brazil reveals a swine gallbladder isolate harboring colistin resistance gene mcr-1.1. Brazilian Journal of Microbiology, v. 53, n. 4, p. 8-pg., . (19/19338-8, 19/06947-6)
SERIBELLI, AMANDA APARECIDA; MACHADO RIBEIRO, TAMARA R.; DA SILVA, PATRICK; MARTINS, ISABELA MANCINI; VILELA, FELIPE PINHEIRO; CAZENTINI MEDEIROS, I, MARTA; PERONNI, KAMILA CHAGAS; DA SILVA JUNIOR, WILSON ARAUJO; MOREIRA, CRISTIANO GALLINA; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Salmonella Typhimurium ST313 isolated in Brazil revealed to be more invasive and inflammatory in murine colon compared to ST19 strains. JOURNAL OF MICROBIOLOGY, v. 59, n. 9, . (17/06633-6, 16/12744-2, 19/19338-8, 19/03049-7, 16/24716-3)
SERIBELLI, AMANDA AP.; DA SILVA, PATRICK; DA CRUZ, MARCELO FERREIRA; DE ALMEIDA, FERNANDA; FRAZAO, MILIANE R.; MEDEIROS, MARTA I. C.; RODRIGUES, DALIA DOS P.; KICH, JALUSA D.; DE JESUS BENEVIDES, LEANDRO; SOARES, SIOMAR DE C.; et al. Insights about the epidemiology of Salmonella Typhimurium isolates from different sources in Brazil using comparative genomics. GUT PATHOGENS, v. 13, n. 1, p. 15-pg., . (17/06633-6, 16/24716-3, 19/19338-8)
VILELA, FELIPE PINHEIRO; PRIBUL, BRUNO ROCHA; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; BALKEY, MARIA; ALLARD, MARC; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Draft Genome Sequences of 80 Salmonella enterica Serovar Infantis Strains Isolated from Food, Environmental, Human, and Veterinary Sources in Brazil. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 10, n. 24, . (19/06947-6, 19/19338-8)
GOMES, CAROLINA NOGUEIRA; BARKER, DILLON OLIVER REESE; DUQUE, SHEILA DA SILVA; CHE, EMILY VICTORIA; JAYAMANNA, VASENA; TABOADA, EDUARDO NAPOLEON; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Campylobacter coli isolated in Brazil typed by core genome Multilocus Sequence Typing shows high genomic diversity in a global context. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 95, . (18/26043-1, 16/24716-3, 15/23408-0, 19/19338-8)
SERIBELLI, AMANDA APARECIDA; DA SILVA, PATRICK; FRAZAO, MILIANE RODRIGUES; KICH, JALUSA DEON; ALLARD, MARC W.; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Phylogenetic relationship and genomic characterization of Salmonella Typhimurium strains isolated from swine in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 93, . (16/24716-3, 17/06633-6, 19/19338-8)
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VILELA, FELIPE PINHEIRO; RODRIGUES, DALIA DOS PRAZERES; ALLARD, MARC WILLIAM; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Genomic analyses of drug-resistant Salmonella enterica serovar Heidelberg strains isolated from meat and related sources between 2013 and 2017 in the south region of Brazil. CURRENT GENETICS, v. 69, n. 2-3, p. 12-pg., . (19/19338-8)
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GOMES, CAROLINA NOGUEIRA; CAMPIONI, FABIO; BARKER, DILLON OLIVER REESE; CHE, EMILY VICTORIA; DUQUE, SHEILA DA SILVA; TABOADA, EDUARDO NAPOLEON; FALCAO, JULIANA PFRIMER. Antimicrobial resistance genotypes and phenotypes of Campylobacter coli isolated from different sources over a 16-year period in Brazil. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 33, p. 5-pg., . (22/07013-0, 18/26043-1, 16/24716-3, 19/19338-8, 15/23408-0)

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