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Genômica, transcriptômica e caracterização fenotipica de linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de diversas fontes durante 20 anos no Brasil

Processo: 19/19338-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de maio de 2020 - 30 de abril de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Pesquisador responsável:Juliana Pfrimer Falcão
Beneficiário:Juliana Pfrimer Falcão
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Bacteriologia  Infecções por Campylobacter  Campylobacter jejuni  Análise de sequência de DNA  Linhagem  Genoma bacteriano  Transcriptoma  Fenótipo  Virulência  Estresse oxidativo  Estresse ácido 

Resumo

A campilobacteriose é uma zoonose de ampla distribuição mundial, sendo que a espécie Campylobacter jejuni é uma importante causa de gastroenterite em humanos em vários países da Europa, bem como nos Estados Unidos, Canadá, Austrália, dentre outros. Entretanto, no Brasil o estudo e o isolamento de C. jejuni são reportados com menor frequência, o que dificulta avaliar a importância e dimensão desse patógeno como causador de doença em humanos no nosso país. Esse projeto tem como objetivos analisar e comparar, por meio do sequenciamento do genoma completo, sequenciamento do transcriptoma e de testes fenotípicos relacionados à virulência linhagens de Campylobacter jejuni isoladas de humanos, animais, ambiente e alimentos ao longo de 20 anos no Brasil. A análise comparativa do genoma completo sequenciado será realizada para 116 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (47), animais (35), alimentos (32) e ambiente (02). Para 46 linhagens de C. jejuni isoladas de humanos (18), animais (14) e alimentos (14) serão realizados os testes fenotípicos de flutuação da temperatura, stress ácido e stress oxidativo, virulência em Galleria mellonella, ensaio in vivo utilizando-se membrana corioalantóica de embrião de galinha, invasão a células CACO-2 e multiplicação e sobrevivência em macrófagos de humanos U937. Ademais, será feita a análise do transcriptoma de seis linhagens de C. jejuni que apresentarem diferenças significativas frente aos testes fenotípicos de stress ácido e oxidativo, e os RNAs serão extraídos após submeter as linhagens a cada stress e também em condições ideais de crescimento. Devido à escassez de trabalhos envolvendo linhagens de C. jejuni no nosso país, estudos que objetivem a análise do genoma completo e a elucidação dos possíveis mecanismos de patogenicidade e virulência em tais linhagens são inovadores e de extrema importância. Portanto, os resultados a serem obtidos deverão contribuir para uma melhor caracterização de linhagens de C. jejuni isoladas durante 20 anos no Brasil, colaborando para o entendimento desse patógeno de grande importância mundial. (AU)