Glicosilação do SARS-CoV-2 para identificação das características estruturais da COVID-19

• Processo: 20/04923-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de maio de 2020 - 30 de abril de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Giuseppe Palmisano
• Beneficiário: Giuseppe Palmisano
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Carla Claser ; Carsten Wrenger ; Cláudio Romero Farias Marinho ; Danielle Bruna Leal de Oliveira ; Edison Luiz Durigon ; Edmarcia Elisa de Souza ; Fábio De Rose Ghilardi ; Lívia Rosa Fernandes ; Rinaldo Focaccia Siciliano
• Vinculado ao auxílio: 18/15549-1 - Modificações pós-traducionais nos processos biológicos e no diagnóstico da Doença de Chagas: novas abordagens metodológicas e implicações biológicas, AP.JP2
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/00507-4 - Glicosilação do SARS-CoV-2 para identificação das características estruturais da COVID-19, BP.PD
• Assunto(s): Doenças transmissíveis Infecções por Coronavirus COVID-19 SARS-CoV-2 Interações entre hospedeiro e microrganismos Glicosilação Proteoma Marcador molecular Técnicas e procedimentos diagnósticos Testes imediatos Pandemias Controle de doenças transmissíveis
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cell Signalling | Infectious diseases | protein glycosylation | SARS-CoV-2 | systems biology | Protein glycosylation

Resumo

SARS-CoV-2 é um vírus humano emergente da família Coronaviridae. O SARS-CoV-2 é o agente etiológico de uma nova pneumonia chamada COVID-19, doença do coronavírus 2019. Devido ao rápido aumento no número de casos que vem afetando diversos países, a OMS classificou o surto de COVID-19 como uma pandemia em curso. Em 1º de abril, existiam 750.890 casos confirmados e 36.405 mortes em todo o mundo. Compreender a dinâmica vírus-hospedeiro é fundamental para o desenvolvimento de estratégias profiláticas, diagnósticas e terapêuticas, além do estabelecimento de medidas para o controle epidemiológico do COVID-19. Muitos aspectos moleculares ainda precisam ser entendidos sobre o comportamento de SARS-CoV-2 e a resposta do hospedeiro durante a infecção, por ex. marcadores moleculares e celulares de infecções graves, leves e assintomáticas, proporcionando maior entendimento da patogênese do COVID-19. Neste projeto, propomos a aplicação de uma abordagem proteômica espacial e temporal para caracterização da interação SARS-CoV-2:hospedeiro, a ser abordada em três frentes interconectadas: (1) avaliação das vias de sinalização ativadas por análise quantitativa sistemática da dinâmica temporal em alterações proteica e de glicosilação durante a infecção de células humanas por SARS-CoV-2; (2) caracterização da diversidade de proteoma e PTMs da SARS-CoV-2; e (3) desenvolvimento de uma plataforma de diagnóstico e prognóstico precoce com base no perfil proteômico de soros de pacientes com diferentes características clínicas. O projeto proposto contribuirá para ampliar o entendimento da patogênese viral e priorizará a descoberta de biomarcadores para testes diagnósticos rápidos. (AU)

Publicações científicas

(17)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RIBEIRO, GIOVANE DE JESUS GOMES; YAN, SUN LIU REI; PALMISANO, GIUSEPPE; WRENGER, CARSTEN. Plant Extracts as a Source of Natural Products with Potential Antimalarial Effects: An Update from 2018 to 2022. PHARMACEUTICS, v. 15, n. 6, p. 19-pg., 2023-06-01. (18/15549-1, 18/18257-1, 20/04923-0, 17/26358-0, 15/26722-8)

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DOMBROWSKI, JAMILLE GREGORIO; BARATEIRO, ANDRE; MACHADO PEIXOTO, ERIKA PAULA; CLAUDIO DA SILVA BARROS, ANDRE BOLER; DE SOUZA, RODRIGO MEDEIROS; CLARK, TAANE GREGORY; CAMPINO, SUSANA; WRENGER, CARSTEN; WUNDERLICH, GERHARD; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Adverse pregnancy outcomes are associated with Plasmodium vivax malaria in a prospective cohort of women from the Brazilian Amazon. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 4, APR 2021. (17/03966-4, 17/03939-7, 18/18257-1, 19/12068-5, 15/26722-8, 17/24267-7, 20/06747-4, 18/20468-0, 20/04923-0, 18/15549-1, 17/05782-8)

CARNEIRO, ANDREIA; VIANA-GOMES, DIEGO; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; OLIVEIRA LIMA, GISCARD HUMBERTO; MITRI, SIMONE; ALVES, SERGIO RABELLO; KOLLIARI-TURNER, ALEXANDER; ZANOTELI, EDMAR; DE AQUINO NETO, FRANCISCO RADLER; PALMISANO, GIUSEPPE; et al. Risk factors and future directions for preventing and diagnosing exertional rhabdomyolysis. Neuromuscular Disorders, v. 31, n. 7, p. 583-595, JUL 2021. (20/04923-0, 18/15549-1, 18/18257-1)

MULE, SIMON NGAO; SAAD, JOYCE SILVA; FERNANDES, LIVIA ROSA; STOLF, BEATRIZ S.; CORTEZ, MAURO; PALMISANO, GIUSEPPE. Protein glycosylation inLeishmaniaspp.. MOLECULAR OMICS, v. 16, n. 5, p. 407-424, OCT 1 2020. (20/04923-0, 18/15549-1, 16/23689-2, 17/04032-5)

MULE, SIMON NGAO; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; WAILEMANN, ROSANGELA A. M.; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; LARSEN, MARTIN R.; LABRIOLA, LETICIA; PALMISANO, GIUSEPPE. HSPB1 influences mitochondrial respiration in ER-stressed beta cells. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1869, n. 9, SEP 2021. (17/04032-5, 14/02745-6, 17/03618-6, 18/18257-1, 16/04676-7, 20/04923-0, 16/14845-0, 13/07937-8, 18/15549-1, 21/00507-4)

FLOREZ-ALVAREZ, LIZDANY; DE SOUZA, EDMARCIA ELISA; BOTOSSO, VIVIANE FONGARO; LEAL DE OLIVEIRA, DANIELLE BRUNA; HO, PAULO LEE; TABORDA, CARLOS PELLESCHI; PALMISANO, GIUSEPPE; CAPURRO, MARGARETH LARA; REBELLO PINHO, JOAO RENATO; FERREIRA, HELENA LAGE; et al. Hemorrhagic fever viruses: Pathogenesis, therapeutics, and emerging and re-emerging potential. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 13, p. 16-pg., 2022-10-25. (16/20045-7, 19/12303-4, 18/18257-1, 20/04923-0, 17/03966-4, 17/27131-9, 22/01812-8, 18/15549-1, 15/26722-8, 20/12277-0, 20/06409-1, 16/08730-6)

CARNEIRO, ANDREIA; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; GUIMARAES, THIAGO; MENDONCA, CLARISSA FEROLLA; DE OLIVEIRA BRANQUINHO, JESSICA LAIS; LUCENA, CINTIA VERDAN; OSORIO, JULIANA; PERNAMBUCO, EDUARDO; et al. Urine proteomics as a non-invasive approach to monitor exertional rhabdomyolysis during military training. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 258, p. 17-pg., 2022-04-30. (18/13283-4, 14/27198-8, 18/18257-1, 20/04923-0, 18/15549-1, 21/00140-3)

MULE, SIMON NGAO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; COUTINHO, JOAO V. P.; GOMES, VINICIUS DE MORAIS; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; QUINA, DANIEL; DE OLIVEIRA, GILBERTO SANTOS; THAYSEN-ANDERSEN, MORTEN; LARSEN, MARTIN R.; et al. Systems-wide analysis of glycoprotein conformational changes by limited deglycosylation assay. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 248, SEP 30 2021. (18/15549-1, 13/07937-8, 20/04923-0, 17/04032-5, 18/18257-1)

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CARRASCO, ALEXIS GERMAN MURILLO; OTAKE, ANDREIA HANADA; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; PALMISANO, GIUSEPPE; ANDRADE, LUCIANA NOGUEIRA DE SOUSA; CHAMMAS, ROGER. Deciphering the Functional Status of Breast Cancers through the Analysis of Their Extracellular Vesicles. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 24, n. 16, p. 33-pg., 2023-08-01. (18/15549-1, 18/18257-1, 20/04923-0, 21/00140-3, 19/05583-0)

MORETTI, ISABELE FATTORI; LERARIO, ANTONIO MARCONDES; SOLA, PAULA RODRIGUES; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; BAPTISTA, MAURICIO DA SILVA; PALMISANO, GIUSEPPE; OBA-SHINJO, SUELI MIEKO; MARIE, SUELY KAZUE NAGAHASHI. GBM Cells Exhibit Susceptibility to Metformin Treatment According to TLR4 Pathway Activation and Metabolic and Antioxidant Status. CANCERS, v. 15, n. 3, p. 18-pg., 2023-02-01. (20/04923-0, 04/12133-6, 20/02988-7, 21/00140-3, 13/07937-8)

SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; DOMBROWSKI, JAMILLE GREGORIO; KAWAHARA, REBECA; ROSA-FERNANDES, LIVIA; MULE, SIMON NGAO; MURILLO, OSCAR; SANTANA, THAIS VIGGIANI; PACCINI COUTINHO, JOAO VICTOR; MACEDO-DA-SILVA, JANAINA; LAZARI, LUCAS CARDOSO; et al. Complement System Activation Is a Plasma Biomarker Signature during Malaria in Pregnancy. GENES, v. 14, n. 8, p. 20-pg., 2023-08-01. (21/14751-4, 18/15549-1, 20/06747-4, 20/04923-0, 17/04032-5, 21/00140-3, 19/12068-5, 18/20468-0)

SAN FRANCISCO, JUAN; ASTUDILLO, CONSTANZA; LUIS VEGA, JOSE; CATALAN, ALEJANDRO; GUTIERREZ, BESSY; ARAYA, JORGE E.; ZAILBERGER, ANIBAL; MARINA, ANABEL; GARCIA, CARLOS; SANCHEZ, NURIA; et al. Trypanosoma cruzi pathogenicity involves virulence factor expression and upregulation of bioenergetic and biosynthetic pathways. VIRULENCE, v. 13, n. 1, p. 22-pg., 2022-12-31. (18/15549-1, 20/04923-0, 18/18257-1, 21/00140-3)

LAZARI, LUCAS C.; ZERBINATI, RODRIGO M.; ROSA-FERNANDES, LIVIA; SANTIAGO, VERONICA FEIJOLI; ROSA, KLAISE F.; ANGELI, CLAUDIA B.; SCHWAB, GABRIELA; PALMIERI, MICHELLE; SARMENTO, DMITY J. S.; MARINHO, CLAUDIO R. F.; et al. ALDI-TOF mass spectrometry of saliva samples as a prognostic tool for COVID-1. OURNAL OF ORAL MICROBIOLOG, v. 14, n. 1, DEC 31 2022. (18/15549-1, 20/06409-1, 20/04923-0, 18/18257-1, 15/26722-8, 17/03966-4, 21/07490-0, 18/20468-0)

SOUZA JUNIOR, DOUGLAS RICARDO; MARTINS SILVA, AMANDA RIBEIRO; ROSA-FERNANDES, LIVIA; REIS, LORENNA ROCHA; ALEXANDRIA, GABRIELLY; BHOSALE, SANTOSH D.; GHILARDI, FABIO DE ROSE; DALCOQUIO, TALIA FALCAO; BERTOLIN, ADRIADNE JUSTI; NICOLAU, JOSE CARLOS; et al. HDL proteome remodeling associates with COVID-19 severity. JOURNAL OF CLINICAL LIPIDOLOGY, v. 15, n. 6, p. 796-804, NOV-DEC 2021. (15/26722-8, 16/00696-3, 20/04923-0, 19/25702-4, 17/07725-1, 18/15549-1, 18/18257-1, 13/07937-8)

ROSA-FERNANDES, LIVIA; BANDEIRA, CARLA; POUR, SHAHAB ZAKI; BENEDETTI, VIVIANE DE FATIMA; FERREIRA, DANIEL; LORENZON, ALINE R.; MORELI, JUSCIELE B.; MARINHO, CLAUDIO ROMERO FARIAS; LARSEN, MARTIN R.; ZANOTTO, PAOLO; et al. The impact of Zika virus exposure on the placental proteomic profile. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE, v. 1868, n. 1, JAN 1 2022. (20/04923-0, 18/18257-1)