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Síntese, estudos e aplicações de sondas fluorescentes e circular dicroicas para caracterização de interações com proteínas, DNA e determinação de atividade enzimática

Processo: 19/18445-5
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2021 - 31 de janeiro de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Enzimologia
Pesquisador responsável:Valdecir Farias Ximenes
Beneficiário:Valdecir Farias Ximenes
Instituição-sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
Pesq. associados:Aguinaldo Robinson de Souza ; Nelson Henrique Morgon
Assunto(s):Peroxidases  DNA  Albuminas  Dicroísmo circular  Corantes fluorescentes 

Resumo

Na detecção, monitoração e quantificação de processos moleculares em meios simples e complexos busca-se o contraste entre aquilo que se quer e o que não se quer ver, ou seja, o aumento da razão sinal/ruído. Neste panorama, técnicas baseadas em fluorescência se destacam, pois são os métodos mais utilizados quando se trata de estudos no campo químico e biomédico. Seria impossível imaginar o desenvolvimento em áreas como bioquímica, imunologia, biologia celular e molecular, sem o uso de marcadores fluorescentes capazes de elucidar o envolvimento de proteínas, metabólitos, espécies reativas de oxigênio e nitrogênio, liberação ou captação de íons, alterações de pH intracelular, potencial de membrana, vias de sinalização etc. Este projeto enquadra-se neste campo, pois parte do mesmo está voltado ao desenvolvimento e aplicação de sondas fluorescentes com os seguintes propósitos: síntese e estudo de amino-quinolinas fluorescentes para determinação seletiva de atividade enzimática das enzimas mieloperoxidase e peroxidase de eosinófilos; síntese e estudo de sonda fluorescente para estudo de DNA via formação de exciplexo; estudo de transferência de energia (FRET) para elucidação de interação de sondas fluorescentes com albumina; estudos solvatocrômicos com as sonda 4-(dicianodometileno)-2-metil-6-(4-dimetilaminostiril)-4H-pirano e 4-dimetilamino-²-nitroestireno e aplicação para determinação de constante dielétrica no interior de proteína e detecção de agregados amiloides. O projeto visa também a síntese (sistemas bifenílicos) e desenvolvimento de sondas susceptíveis à indução de sinal de dicroísmo circular. Neste caso temos como meta desenvolver um método para monitorar o deslocamento das sondas entre duas proteínas em função do tempo e aplicar ao estudo de caracterização de agregados amilóides. Ainda nesta linha, o sinal de dicroísmo circular induzido ao corante rosa bengala será utilizado para estudar sua movimentação na proteína. Todos os estudos citados acima terão a sua contraparte teórica por métodos ab initio, onde se buscará a compreensão dos fenômenos a nível molecular, simulações dos espectros de absorção, emissão e de dicroísmo circular das sondas livres e complexadas às macromoléculas. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DOS SANTOS, WILLIAN HENRIQUE; YOGUIM, MAURICIO IKEDA; DARE, REGINA GOMES; DA SILVA-FILHO, LUIZ CARLOS; LAUTENSCHLAGER, SUELI OLIVEIRA SILVA; XIMENES, VALDECIR FARIAS. Development of a caffeic acid-phthalimide hybrid compound for NADPH oxidase inhibition. RSC ADVANCES, v. 11, n. 29, p. 17880-17890, MAY 27 2021. Citações Web of Science: 0.
ZERAIK, MARIA LUIZA; PAULI, IVANI; DUTRA, LUIZ A.; CRUZ, RAQUEL S.; VALLI, MARILIA; PARACATU, LUANA C.; DE FARIA, CAROLINA M. Q. G.; XIMENES, VALDECIR F.; REGASINI, LUIS O.; ANDRICOPULO, ADRIANO D.; BOLZANI, VANDERLAN S. Identification of a Prenyl Chalcone as a Competitive Lipoxygenase Inhibitor: Screening, Biochemical Evaluation and Molecular Modeling Studies. Molecules, v. 26, n. 8 APR 2021. Citações Web of Science: 0.
BERTOZO, LUIZA DE CARVALHO; MASZOTA-ZIELENIAK, MARTYNA; BOLEAN, MAYTE; CIANCAGLINI, PIETRO; SAMSONOV, SERGEY A.; XIMENES, VALDECIR F. Binding of fluorescent dansyl amino acids in albumin: When access to the protein cavity is more important than the strength of binding. DYES AND PIGMENTS, v. 188, APR 2021. Citações Web of Science: 0.
ALVES DA SILVA, BRUNA TERRA; PELOI, KAREN ELAINE; XIMENES, VALDECIR FARIAS; NAKAMURA, CELSO VATARU; SILVA LAUTENSCHLAGER, SUELI DE OLIVEIRA. 2-acetylphenothiazine protects L929 fibroblasts against UVB-induced oxidative damage. JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY B-BIOLOGY, v. 216, MAR 2021. Citações Web of Science: 0.
XIMENES, VALDECIR F.; XIMENES, THOMAZ P.; MORGON, NELSON H.; DE SOUZA, AGUINALDO R. Taurine Chloramine and Hydrogen Peroxide as a Potential Source of Singlet Oxygen for Topical Application. Photochemistry and Photobiology, MAR 2021. Citações Web of Science: 0.

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